MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	TAT	2	6	735	740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017496	ATT	2	6	891	896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017496	CAC	2	6	2125	2130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017496	TCC	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017496	ACT	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017496	TCC	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017496	AGT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017496	AAT	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017496	GAC	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017496	ATT	2	6	6256	6261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017496	AGA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017496	CAT	2	6	9231	9236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017496	ATT	3	9	9506	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017496	AGG	2	6	9607	9612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017496	ATT	2	6	13873	13878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017496	CAA	2	6	13901	13906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017496	TGA	2	6	16833	16838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017496	ACT	2	6	16840	16845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017496	TAT	2	6	18754	18759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017496	TTA	2	6	18837	18842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017496	GAA	2	6	18880	18885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017496	AGA	2	6	19186	19191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017496	TTA	2	6	19245	19250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017496	ATT	3	9	21905	21913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017496	CAA	2	6	21920	21925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017496	GTT	2	6	21928	21933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017496	AAC	2	6	21934	21939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017496	ATT	2	6	21946	21951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017496	GGA	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017496	ATT	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017496	TCG	2	6	23416	23421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017496	TGA	2	6	24096	24101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017496	CTA	2	6	24923	24928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017496	CTT	2	6	26868	26873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017496	TAT	2	6	27637	27642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017496	TAA	2	6	28149	28154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017496	ATT	2	6	28174	28179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017496	TAT	2	6	29826	29831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017496	TCA	2	6	29884	29889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017496	ATT	2	6	29893	29898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017496	AAC	2	6	31445	31450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017496	TCT	2	6	31486	31491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017496	TAA	2	6	33615	33620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017496	TGA	2	6	33636	33641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017496	TGT	2	6	33804	33809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017496	GAA	2	6	33876	33881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017496	TAT	3	9	33940	33948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017496	ATA	2	6	33950	33955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017496	TAA	2	6	34023	34028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017496	ATA	2	6	34554	34559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017496	GAA	2	6	34933	34938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017496	TCA	2	6	35009	35014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017496	TTA	2	6	35015	35020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017496	TGT	2	6	35023	35028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017496	CAA	2	6	37164	37169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017496	CTG	2	6	37425	37430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017496	TTC	2	6	37431	37436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017496	TAT	2	6	39125	39130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017496	CTT	2	6	39155	39160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017496	GGT	2	6	39209	39214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017496	CTT	2	6	39700	39705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017496	ATA	2	6	39707	39712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017496	ACT	2	6	39736	39741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017496	TAA	2	6	39748	39753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017496	TTA	2	6	39779	39784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017496	CAT	2	6	40109	40114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017496	CGA	2	6	40570	40575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017496	ATT	2	6	40654	40659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017496	TTA	2	6	40817	40822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017496	ATT	2	6	40851	40856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017496	ATG	2	6	40886	40891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017496	GTG	2	6	40897	40902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017496	ACC	2	6	40913	40918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017496	ATT	2	6	41055	41060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017496	ATA	2	6	41111	41116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017496	ATA	2	6	41178	41183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017496	ATT	2	6	42459	42464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017496	TCC	2	6	42823	42828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017496	TAT	2	6	42868	42873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017496	ATA	2	6	43285	43290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017496	TAT	2	6	43301	43306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017496	AAT	2	6	43386	43391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017496	GAA	2	6	43417	43422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017496	CTA	2	6	44636	44641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017496	ATA	2	6	44732	44737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017496	AGG	2	6	44763	44768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017496	TTC	2	6	48352	48357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017496	ATT	2	6	48399	48404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017496	AAG	2	6	48472	48477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017496	ATA	2	6	51245	51250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017496	AGA	2	6	51294	51299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017496	ACA	2	6	51324	51329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017496	TAA	2	6	51388	51393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017496	ACA	2	6	51395	51400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017496	ACG	2	6	51511	51516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017496	ACA	2	6	51522	51527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017496	ACA	2	6	51543	51548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017496	CTC	2	6	51555	51560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017496	ACA	2	6	51564	51569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017496	CTC	2	6	51576	51581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017496	ACA	2	6	51585	51590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017496	TAA	2	6	51697	51702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017496	TCT	2	6	52433	52438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017496	TAG	2	6	53192	53197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.