MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	385836855
2	NC_017496	TG	3	6	2951	2956	0 %	50 %	50 %	0 %	385836856
3	NC_017496	CT	3	6	3550	3555	0 %	50 %	0 %	50 %	385836856
4	NC_017496	TG	3	6	4595	4600	0 %	50 %	50 %	0 %	385836857
5	NC_017496	TC	3	6	5224	5229	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
6	NC_017496	TC	3	6	5289	5294	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
7	NC_017496	AC	4	8	5580	5587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017496	TC	3	6	7990	7995	0 %	50 %	0 %	50 %	385836863
9	NC_017496	AT	3	6	8923	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	385836863
10	NC_017496	AT	3	6	9267	9272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017496	AC	4	8	9289	9296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017496	TA	3	6	9462	9467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017496	TA	4	8	9574	9581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017496	CA	3	6	11788	11793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017496	TA	3	6	13273	13278	50 %	50 %	0 %	0 %	385836866
16	NC_017496	AT	3	6	16329	16334	50 %	50 %	0 %	0 %	385836870
17	NC_017496	AT	3	6	16847	16852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017496	TA	4	8	18863	18870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017496	AG	3	6	21144	21149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017496	TA	3	6	21607	21612	50 %	50 %	0 %	0 %	385836875
21	NC_017496	AT	3	6	21753	21758	50 %	50 %	0 %	0 %	385836875
22	NC_017496	TC	3	6	22296	22301	0 %	50 %	0 %	50 %	385836876
23	NC_017496	AC	3	6	23832	23837	50 %	0 %	0 %	50 %	385836877
24	NC_017496	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	385836877
25	NC_017496	TA	3	6	24250	24255	50 %	50 %	0 %	0 %	385836878
26	NC_017496	TA	3	6	24397	24402	50 %	50 %	0 %	0 %	385836878
27	NC_017496	CT	3	6	24860	24865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017496	AT	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	385836879
29	NC_017496	TA	3	6	27105	27110	50 %	50 %	0 %	0 %	385836880
30	NC_017496	TG	3	6	27424	27429	0 %	50 %	50 %	0 %	385836880
31	NC_017496	AT	3	6	27561	27566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017496	AG	3	6	28455	28460	50 %	0 %	50 %	0 %	385836882
33	NC_017496	TA	3	6	29032	29037	50 %	50 %	0 %	0 %	385836883
34	NC_017496	TG	3	6	29351	29356	0 %	50 %	50 %	0 %	385836883
35	NC_017496	AT	3	6	29488	29493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017496	CA	3	6	30091	30096	50 %	0 %	0 %	50 %	385836885
37	NC_017496	TC	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	385836886
38	NC_017496	TC	3	6	31173	31178	0 %	50 %	0 %	50 %	385836887
39	NC_017496	AT	3	6	31343	31348	50 %	50 %	0 %	0 %	385836887
40	NC_017496	AG	3	6	32751	32756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017496	TA	3	6	33214	33219	50 %	50 %	0 %	0 %	385836891
42	NC_017496	AT	3	6	33360	33365	50 %	50 %	0 %	0 %	385836891
43	NC_017496	GT	3	6	33595	33600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017496	GT	3	6	34377	34382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017496	CT	3	6	34415	34420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017496	GT	3	6	34576	34581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017496	AT	3	6	34784	34789	50 %	50 %	0 %	0 %	385836893
48	NC_017496	TC	3	6	35979	35984	0 %	50 %	0 %	50 %	385836895
49	NC_017496	AT	3	6	36157	36162	50 %	50 %	0 %	0 %	385836895
50	NC_017496	TA	3	6	37530	37535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017496	AG	3	6	37959	37964	50 %	0 %	50 %	0 %	385836898
52	NC_017496	GA	3	6	38733	38738	50 %	0 %	50 %	0 %	385836899
53	NC_017496	TC	3	6	39090	39095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017496	CT	3	6	39341	39346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017496	AT	3	6	40723	40728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017496	AG	3	6	41387	41392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017496	AT	3	6	41996	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	385836903
58	NC_017496	AG	3	6	42097	42102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017496	CT	3	6	42368	42373	0 %	50 %	0 %	50 %	385836904
60	NC_017496	GT	3	6	43445	43450	0 %	50 %	50 %	0 %	385836908
61	NC_017496	CT	3	6	46031	46036	0 %	50 %	0 %	50 %	385836911
62	NC_017496	TC	3	6	48105	48110	0 %	50 %	0 %	50 %	385836915
63	NC_017496	CT	3	6	49703	49708	0 %	50 %	0 %	50 %	385836917
64	NC_017496	AT	3	6	50303	50308	50 %	50 %	0 %	0 %	385836918
65	NC_017496	TC	3	6	51061	51066	0 %	50 %	0 %	50 %	385836918
66	NC_017496	TA	3	6	51314	51319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017496	AT	3	6	51359	51364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017496	TA	3	6	51452	51457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017496	TA	5	10	51669	51678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017496	AG	3	6	52516	52521	50 %	0 %	50 %	0 %	385836920
71	NC_017496	GT	3	6	53240	53245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017496	AC	3	6	53593	53598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.