MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	385836855
2	NC_017496	TG	3	6	2951	2956	0 %	50 %	50 %	0 %	385836856
3	NC_017496	CT	3	6	3550	3555	0 %	50 %	0 %	50 %	385836856
4	NC_017496	TG	3	6	4595	4600	0 %	50 %	50 %	0 %	385836857
5	NC_017496	TC	3	6	5224	5229	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
6	NC_017496	TC	3	6	5289	5294	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
7	NC_017496	TC	3	6	7990	7995	0 %	50 %	0 %	50 %	385836863
8	NC_017496	AT	3	6	8923	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	385836863
9	NC_017496	TA	3	6	13273	13278	50 %	50 %	0 %	0 %	385836866
10	NC_017496	AT	3	6	16329	16334	50 %	50 %	0 %	0 %	385836870
11	NC_017496	TA	3	6	21607	21612	50 %	50 %	0 %	0 %	385836875
12	NC_017496	AT	3	6	21753	21758	50 %	50 %	0 %	0 %	385836875
13	NC_017496	TC	3	6	22296	22301	0 %	50 %	0 %	50 %	385836876
14	NC_017496	AC	3	6	23832	23837	50 %	0 %	0 %	50 %	385836877
15	NC_017496	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	385836877
16	NC_017496	TA	3	6	24250	24255	50 %	50 %	0 %	0 %	385836878
17	NC_017496	TA	3	6	24397	24402	50 %	50 %	0 %	0 %	385836878
18	NC_017496	AT	3	6	26013	26018	50 %	50 %	0 %	0 %	385836879
19	NC_017496	TA	3	6	27105	27110	50 %	50 %	0 %	0 %	385836880
20	NC_017496	TG	3	6	27424	27429	0 %	50 %	50 %	0 %	385836880
21	NC_017496	AG	3	6	28455	28460	50 %	0 %	50 %	0 %	385836882
22	NC_017496	TA	3	6	29032	29037	50 %	50 %	0 %	0 %	385836883
23	NC_017496	TG	3	6	29351	29356	0 %	50 %	50 %	0 %	385836883
24	NC_017496	CA	3	6	30091	30096	50 %	0 %	0 %	50 %	385836885
25	NC_017496	TC	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	385836886
26	NC_017496	TC	3	6	31173	31178	0 %	50 %	0 %	50 %	385836887
27	NC_017496	AT	3	6	31343	31348	50 %	50 %	0 %	0 %	385836887
28	NC_017496	TA	3	6	33214	33219	50 %	50 %	0 %	0 %	385836891
29	NC_017496	AT	3	6	33360	33365	50 %	50 %	0 %	0 %	385836891
30	NC_017496	AT	3	6	34784	34789	50 %	50 %	0 %	0 %	385836893
31	NC_017496	TC	3	6	35979	35984	0 %	50 %	0 %	50 %	385836895
32	NC_017496	AT	3	6	36157	36162	50 %	50 %	0 %	0 %	385836895
33	NC_017496	AG	3	6	37959	37964	50 %	0 %	50 %	0 %	385836898
34	NC_017496	GA	3	6	38733	38738	50 %	0 %	50 %	0 %	385836899
35	NC_017496	AT	3	6	41996	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	385836903
36	NC_017496	CT	3	6	42368	42373	0 %	50 %	0 %	50 %	385836904
37	NC_017496	GT	3	6	43445	43450	0 %	50 %	50 %	0 %	385836908
38	NC_017496	CT	3	6	46031	46036	0 %	50 %	0 %	50 %	385836911
39	NC_017496	TC	3	6	48105	48110	0 %	50 %	0 %	50 %	385836915
40	NC_017496	CT	3	6	49703	49708	0 %	50 %	0 %	50 %	385836917
41	NC_017496	AT	3	6	50303	50308	50 %	50 %	0 %	0 %	385836918
42	NC_017496	TC	3	6	51061	51066	0 %	50 %	0 %	50 %	385836918
43	NC_017496	AG	3	6	52516	52521	50 %	0 %	50 %	0 %	385836920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.