MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017495	TAT	2	6	252	257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017495	GAG	2	6	319	324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017495	ATA	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017495	AAC	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836840
5	NC_017495	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
6	NC_017495	GTG	2	6	598	603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
7	NC_017495	ATA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836840
8	NC_017495	ATT	2	6	735	740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
9	NC_017495	TAG	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
10	NC_017495	AAG	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
11	NC_017495	ATG	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
12	NC_017495	GAA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
13	NC_017495	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
14	NC_017495	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
15	NC_017495	AGA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
16	NC_017495	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
17	NC_017495	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
18	NC_017495	ATG	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
19	NC_017495	TTA	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836841
20	NC_017495	AAG	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
21	NC_017495	TTG	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836841
22	NC_017495	CAA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836841
23	NC_017495	GAA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
24	NC_017495	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
25	NC_017495	AAT	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836841
26	NC_017495	TTC	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017495	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
28	NC_017495	CAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
29	NC_017495	CGA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836842
30	NC_017495	TCA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836842
31	NC_017495	CTG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
32	NC_017495	TGA	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
33	NC_017495	GCT	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
34	NC_017495	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836842
35	NC_017495	TGA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
36	NC_017495	TAG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
37	NC_017495	AAC	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
38	NC_017495	CAA	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
39	NC_017495	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836842
40	NC_017495	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836842
41	NC_017495	ATT	2	6	3924	3929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836843
42	NC_017495	CGT	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
43	NC_017495	CCA	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
44	NC_017495	ACC	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
45	NC_017495	CAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836843
46	NC_017495	CGT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
47	NC_017495	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
48	NC_017495	CGA	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
49	NC_017495	TCA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
50	NC_017495	TCA	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
51	NC_017495	TCA	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
52	NC_017495	GTG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017495	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017495	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836844
55	NC_017495	ATC	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836844
56	NC_017495	ACG	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836844
57	NC_017495	ACC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017495	TCT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017495	GTT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017495	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017495	CGA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017495	ATT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017495	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017495	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017495	TGA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017495	CAG	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017495	TTA	2	6	6251	6256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017495	ATC	2	6	6261	6266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017495	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017495	TGT	2	6	6351	6356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017495	GTT	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017495	TAA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017495	ATT	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836845
74	NC_017495	AGA	2	6	6702	6707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836845
75	NC_017495	TAA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836845
76	NC_017495	CAA	2	6	6781	6786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836845
77	NC_017495	AAT	2	6	6979	6984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836845
78	NC_017495	ATT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017495	ATA	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017495	CAA	2	6	7151	7156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017495	GTC	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017495	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017495	TTG	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017495	AAG	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017495	TCC	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017495	TAC	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017495	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017495	TAA	2	6	7532	7537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017495	AAG	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017495	ATA	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017495	ACA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017495	CTT	3	9	7786	7794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017495	TCA	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017495	GTG	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017495	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017495	ATC	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836846
97	NC_017495	TAT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836846
98	NC_017495	GTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836846
99	NC_017495	GGA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836846
100	NC_017495	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836846
101	NC_017495	GAA	2	6	8267	8272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836846
102	NC_017495	CAC	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836846
103	NC_017495	TAC	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836846
104	NC_017495	ACA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017495	ATT	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836847
106	NC_017495	ATC	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836847
107	NC_017495	TTC	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836847
108	NC_017495	AAT	2	6	9192	9197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836847
109	NC_017495	CGG	2	6	9277	9282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836847
110	NC_017495	TAT	2	6	9512	9517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836847
111	NC_017495	ATG	2	6	9626	9631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017495	AGT	2	6	9727	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836848
113	NC_017495	TAT	2	6	9838	9843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
114	NC_017495	TGG	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836848
115	NC_017495	TAT	2	6	9965	9970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
116	NC_017495	TAT	2	6	10033	10038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
117	NC_017495	GCT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836848
118	NC_017495	TGT	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
119	NC_017495	ATC	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836848
120	NC_017495	ATT	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
121	NC_017495	ATG	2	6	10274	10279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836848
122	NC_017495	TCT	2	6	10302	10307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836848
123	NC_017495	TTG	2	6	10374	10379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
124	NC_017495	TTG	2	6	10397	10402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
125	NC_017495	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
126	NC_017495	CTA	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836848
127	NC_017495	ATT	2	6	10492	10497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
128	NC_017495	TTA	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017495	GAA	2	6	10670	10675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017495	ATT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017495	AAG	2	6	10770	10775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017495	ATT	2	6	10887	10892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836849
133	NC_017495	TTA	2	6	10904	10909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836849
134	NC_017495	ATC	2	6	11023	11028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836849
135	NC_017495	GCT	2	6	11181	11186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836849
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223	NC_017495	GAT	2	6	17284	17289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
224	NC_017495	ATA	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_017495	ATT	2	6	17647	17652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.