MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017495	AAC	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836840
2	NC_017495	GGT	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
3	NC_017495	GTG	2	6	598	603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836840
4	NC_017495	ATA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836840
5	NC_017495	ATT	2	6	735	740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
6	NC_017495	TAG	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
7	NC_017495	AAG	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
8	NC_017495	ATG	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836840
9	NC_017495	GAA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
10	NC_017495	GAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
11	NC_017495	TAT	2	6	1467	1472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836840
12	NC_017495	AGA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836840
13	NC_017495	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
14	NC_017495	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
15	NC_017495	ATG	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836841
16	NC_017495	TTA	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836841
17	NC_017495	AAG	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
18	NC_017495	TTG	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836841
19	NC_017495	CAA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836841
20	NC_017495	GAA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
21	NC_017495	GAA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836841
22	NC_017495	AAT	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836841
23	NC_017495	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
24	NC_017495	CAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
25	NC_017495	CGA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836842
26	NC_017495	TCA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836842
27	NC_017495	CTG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
28	NC_017495	TGA	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
29	NC_017495	GCT	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836842
30	NC_017495	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836842
31	NC_017495	TGA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
32	NC_017495	TAG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836842
33	NC_017495	AAC	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
34	NC_017495	CAA	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836842
35	NC_017495	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836842
36	NC_017495	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836842
37	NC_017495	ATT	2	6	3924	3929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836843
38	NC_017495	CGT	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
39	NC_017495	CCA	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
40	NC_017495	ACC	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836843
41	NC_017495	CAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836843
42	NC_017495	CGT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836843
43	NC_017495	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
44	NC_017495	CGA	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836843
45	NC_017495	TCA	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
46	NC_017495	TCA	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
47	NC_017495	TCA	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836843
48	NC_017495	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836844
49	NC_017495	ATC	2	6	5397	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836844
50	NC_017495	ACG	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836844
51	NC_017495	ATT	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836845
52	NC_017495	AGA	2	6	6702	6707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836845
53	NC_017495	TAA	2	6	6749	6754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836845
54	NC_017495	CAA	2	6	6781	6786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836845
55	NC_017495	AAT	2	6	6979	6984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836845
56	NC_017495	ATC	2	6	8106	8111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836846
57	NC_017495	TAT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836846
58	NC_017495	GTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836846
59	NC_017495	GGA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836846
60	NC_017495	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836846
61	NC_017495	GAA	2	6	8267	8272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836846
62	NC_017495	CAC	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836846
63	NC_017495	TAC	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836846
64	NC_017495	ATT	2	6	8633	8638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836847
65	NC_017495	ATC	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836847
66	NC_017495	TTC	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836847
67	NC_017495	AAT	2	6	9192	9197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836847
68	NC_017495	CGG	2	6	9277	9282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385836847
69	NC_017495	TAT	2	6	9512	9517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836847
70	NC_017495	AGT	2	6	9727	9732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836848
71	NC_017495	TAT	2	6	9838	9843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
72	NC_017495	TGG	2	6	9937	9942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836848
73	NC_017495	TAT	2	6	9965	9970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
74	NC_017495	TAT	2	6	10033	10038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
75	NC_017495	GCT	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836848
76	NC_017495	TGT	2	6	10201	10206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
77	NC_017495	ATC	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836848
78	NC_017495	ATT	2	6	10231	10236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
79	NC_017495	ATG	2	6	10274	10279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836848
80	NC_017495	TCT	2	6	10302	10307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836848
81	NC_017495	TTG	2	6	10374	10379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
82	NC_017495	TTG	2	6	10397	10402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
83	NC_017495	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836848
84	NC_017495	CTA	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836848
85	NC_017495	ATT	2	6	10492	10497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836848
86	NC_017495	ATT	2	6	10887	10892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836849
87	NC_017495	TTA	2	6	10904	10909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836849
88	NC_017495	ATC	2	6	11023	11028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836849
89	NC_017495	GCT	2	6	11181	11186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836849
90	NC_017495	ACG	2	6	11369	11374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836849
91	NC_017495	GAA	2	6	11458	11463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836849
92	NC_017495	CTC	2	6	11601	11606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836850
93	NC_017495	TTC	2	6	11629	11634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836850
94	NC_017495	AAT	2	6	11637	11642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836850
95	NC_017495	CCA	2	6	11723	11728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836850
96	NC_017495	CTG	2	6	11747	11752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
97	NC_017495	GTC	2	6	11770	11775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
98	NC_017495	CGT	2	6	11809	11814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
99	NC_017495	CGA	2	6	11888	11893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836850
100	NC_017495	TCA	2	6	11968	11973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
101	NC_017495	GCT	2	6	12110	12115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
102	NC_017495	GCC	2	6	12227	12232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836850
103	NC_017495	TGC	2	6	12295	12300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
104	NC_017495	GAA	2	6	12305	12310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836850
105	NC_017495	TCA	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
106	NC_017495	GTT	2	6	12383	12388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836850
107	NC_017495	TCA	2	6	12580	12585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
108	NC_017495	TTA	2	6	12607	12612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836850
109	NC_017495	TAG	2	6	12626	12631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836850
110	NC_017495	GCT	2	6	12666	12671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
111	NC_017495	TTC	2	6	12696	12701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836850
112	NC_017495	TCA	2	6	12787	12792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
113	NC_017495	GAA	2	6	12939	12944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836850
114	NC_017495	TCA	2	6	13039	13044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
115	NC_017495	GCT	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
116	NC_017495	TTC	2	6	13212	13217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836850
117	NC_017495	CTG	2	6	13323	13328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
118	NC_017495	TAA	2	6	13329	13334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836850
119	NC_017495	GTT	2	6	13431	13436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836850
120	NC_017495	TGC	2	6	13527	13532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
121	NC_017495	TTC	2	6	13679	13684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836850
122	NC_017495	ATC	2	6	13729	13734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836850
123	NC_017495	AAT	2	6	13803	13808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836850
124	NC_017495	TGA	2	6	13893	13898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836850
125	NC_017495	TAT	2	6	13955	13960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836850
126	NC_017495	CAA	2	6	13973	13978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836850
127	NC_017495	GAA	2	6	14070	14075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836850
128	NC_017495	TGC	2	6	14086	14091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836850
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.