MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	TTATA	2	10	14	23	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	ATTAT	2	10	1892	1901	40 %	60 %	0 %	0 %	385836928
3	NC_017493	ATTTT	2	10	3529	3538	20 %	80 %	0 %	0 %	385836929
4	NC_017493	AGAAA	2	10	4439	4448	80 %	0 %	20 %	0 %	385836930
5	NC_017493	TGGAA	2	10	4736	4745	40 %	20 %	40 %	0 %	385836930
6	NC_017493	CTGTT	2	10	6051	6060	0 %	60 %	20 %	20 %	385836931
7	NC_017493	ATCTT	2	10	6477	6486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017493	TTTTA	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
9	NC_017493	ATTTT	2	10	7052	7061	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
10	NC_017493	CATGG	2	10	7138	7147	20 %	20 %	40 %	20 %	385836932
11	NC_017493	AAAGA	2	10	7297	7306	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
12	NC_017493	AAAGA	2	10	7609	7618	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
13	NC_017493	AAATG	2	10	9882	9891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017493	GATTG	2	10	11411	11420	20 %	40 %	40 %	0 %	385836935
15	NC_017493	ATAAA	2	10	13318	13327	80 %	20 %	0 %	0 %	385836938
16	NC_017493	TAAGA	2	10	13658	13667	60 %	20 %	20 %	0 %	385836938
17	NC_017493	TTTAT	2	10	15975	15984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017493	AAGTG	2	10	17011	17020	40 %	20 %	40 %	0 %	385836941
19	NC_017493	AAAAT	2	10	19481	19490	80 %	20 %	0 %	0 %	385836942
20	NC_017493	TGCAA	2	10	21492	21501	40 %	20 %	20 %	20 %	385836944
21	NC_017493	TCTCT	2	10	21629	21638	0 %	60 %	0 %	40 %	385836944
22	NC_017493	TCTGT	2	10	22634	22643	0 %	60 %	20 %	20 %	385836945
23	NC_017493	CTCTA	2	10	27110	27119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017493	ATTTC	2	10	29408	29417	20 %	60 %	0 %	20 %	385836952
25	NC_017493	TTTTA	2	10	30827	30836	20 %	80 %	0 %	0 %	385836955
26	NC_017493	TCAAA	2	10	31904	31913	60 %	20 %	0 %	20 %	385836955
27	NC_017493	GTTGA	2	10	34124	34133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017493	AAAAT	2	10	35118	35127	80 %	20 %	0 %	0 %	385836957
29	NC_017493	TTTTG	2	10	35533	35542	0 %	80 %	20 %	0 %	385836957
30	NC_017493	AATGA	2	10	37185	37194	60 %	20 %	20 %	0 %	385836960
31	NC_017493	CTAGT	2	10	39897	39906	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017493	ACTAC	2	10	44043	44052	40 %	20 %	0 %	40 %	385836963
33	NC_017493	AATAT	2	10	44126	44135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.