MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	ATTAT	2	10	1892	1901	40 %	60 %	0 %	0 %	385836928
2	NC_017493	ATTTT	2	10	3529	3538	20 %	80 %	0 %	0 %	385836929
3	NC_017493	AGAAA	2	10	4439	4448	80 %	0 %	20 %	0 %	385836930
4	NC_017493	TGGAA	2	10	4736	4745	40 %	20 %	40 %	0 %	385836930
5	NC_017493	CTGTT	2	10	6051	6060	0 %	60 %	20 %	20 %	385836931
6	NC_017493	TTTTA	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
7	NC_017493	ATTTT	2	10	7052	7061	20 %	80 %	0 %	0 %	385836932
8	NC_017493	CATGG	2	10	7138	7147	20 %	20 %	40 %	20 %	385836932
9	NC_017493	AAAGA	2	10	7297	7306	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
10	NC_017493	AAAGA	2	10	7609	7618	80 %	0 %	20 %	0 %	385836932
11	NC_017493	GATTG	2	10	11411	11420	20 %	40 %	40 %	0 %	385836935
12	NC_017493	ATAAA	2	10	13318	13327	80 %	20 %	0 %	0 %	385836938
13	NC_017493	TAAGA	2	10	13658	13667	60 %	20 %	20 %	0 %	385836938
14	NC_017493	AAGTG	2	10	17011	17020	40 %	20 %	40 %	0 %	385836941
15	NC_017493	AAAAT	2	10	19481	19490	80 %	20 %	0 %	0 %	385836942
16	NC_017493	TGCAA	2	10	21492	21501	40 %	20 %	20 %	20 %	385836944
17	NC_017493	TCTCT	2	10	21629	21638	0 %	60 %	0 %	40 %	385836944
18	NC_017493	TCTGT	2	10	22634	22643	0 %	60 %	20 %	20 %	385836945
19	NC_017493	ATTTC	2	10	29408	29417	20 %	60 %	0 %	20 %	385836952
20	NC_017493	TTTTA	2	10	30827	30836	20 %	80 %	0 %	0 %	385836955
21	NC_017493	TCAAA	2	10	31904	31913	60 %	20 %	0 %	20 %	385836955
22	NC_017493	AAAAT	2	10	35118	35127	80 %	20 %	0 %	0 %	385836957
23	NC_017493	TTTTG	2	10	35533	35542	0 %	80 %	20 %	0 %	385836957
24	NC_017493	AATGA	2	10	37185	37194	60 %	20 %	20 %	0 %	385836960
25	NC_017493	ACTAC	2	10	44043	44052	40 %	20 %	0 %	40 %	385836963

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.