MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	TTTA	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	GAAA	2	8	246	253	75 %	0 %	25 %	0 %	385836927
3	NC_017493	AAGG	2	8	278	285	50 %	0 %	50 %	0 %	385836927
4	NC_017493	AGCT	2	8	352	359	25 %	25 %	25 %	25 %	385836927
5	NC_017493	AAAT	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	385836927
6	NC_017493	AGAA	2	8	1398	1405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017493	TTAT	2	8	1843	1850	25 %	75 %	0 %	0 %	385836928
8	NC_017493	AAAT	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	385836928
9	NC_017493	GTAG	2	8	2719	2726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017493	CCCT	2	8	3108	3115	0 %	25 %	0 %	75 %	385836929
11	NC_017493	CTTT	2	8	3311	3318	0 %	75 %	0 %	25 %	385836929
12	NC_017493	AACA	2	8	3957	3964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017493	GAAA	2	8	4428	4435	75 %	0 %	25 %	0 %	385836930
14	NC_017493	TTGA	2	8	4798	4805	25 %	50 %	25 %	0 %	385836930
15	NC_017493	AGTA	2	8	4858	4865	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
16	NC_017493	TACT	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	385836930
17	NC_017493	AGTA	2	8	5269	5276	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
18	NC_017493	CTAC	2	8	5500	5507	25 %	25 %	0 %	50 %	385836930
19	NC_017493	CAAA	2	8	5835	5842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017493	TTTA	2	8	6018	6025	25 %	75 %	0 %	0 %	385836931
21	NC_017493	AATT	2	8	6117	6124	50 %	50 %	0 %	0 %	385836931
22	NC_017493	TCTT	2	8	6216	6223	0 %	75 %	0 %	25 %	385836931
23	NC_017493	AAAG	2	8	6775	6782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017493	GAAA	2	8	7460	7467	75 %	0 %	25 %	0 %	385836932
25	NC_017493	ACAA	2	8	7580	7587	75 %	0 %	0 %	25 %	385836932
26	NC_017493	CAAA	2	8	7621	7628	75 %	0 %	0 %	25 %	385836932
27	NC_017493	TAAA	2	8	7859	7866	75 %	25 %	0 %	0 %	385836932
28	NC_017493	AAAG	2	8	8155	8162	75 %	0 %	25 %	0 %	385836932
29	NC_017493	AGCA	2	8	8299	8306	50 %	0 %	25 %	25 %	385836932
30	NC_017493	TGAA	2	8	8309	8316	50 %	25 %	25 %	0 %	385836932
31	NC_017493	GCTT	2	8	8438	8445	0 %	50 %	25 %	25 %	385836932
32	NC_017493	CACT	2	8	8469	8476	25 %	25 %	0 %	50 %	385836932
33	NC_017493	AATG	2	8	8533	8540	50 %	25 %	25 %	0 %	385836932
34	NC_017493	GCAA	2	8	8570	8577	50 %	0 %	25 %	25 %	385836932
35	NC_017493	TTTC	2	8	9233	9240	0 %	75 %	0 %	25 %	385836933
36	NC_017493	ATTC	2	8	9868	9875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017493	AAGG	2	8	9996	10003	50 %	0 %	50 %	0 %	385836935
38	NC_017493	AGTC	2	8	10029	10036	25 %	25 %	25 %	25 %	385836935
39	NC_017493	TATT	2	8	10239	10246	25 %	75 %	0 %	0 %	385836935
40	NC_017493	CGAG	2	8	10347	10354	25 %	0 %	50 %	25 %	385836935
41	NC_017493	TTTA	2	8	10450	10457	25 %	75 %	0 %	0 %	385836935
42	NC_017493	TGTT	2	8	10591	10598	0 %	75 %	25 %	0 %	385836935
43	NC_017493	ATTC	2	8	11111	11118	25 %	50 %	0 %	25 %	385836935
44	NC_017493	AATT	2	8	11572	11579	50 %	50 %	0 %	0 %	385836935
45	NC_017493	AAGC	2	8	11684	11691	50 %	0 %	25 %	25 %	385836936
46	NC_017493	ACAA	2	8	11820	11827	75 %	0 %	0 %	25 %	385836936
47	NC_017493	ATCC	2	8	12539	12546	25 %	25 %	0 %	50 %	385836937
48	NC_017493	ATTT	2	8	13023	13030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017493	AATT	2	8	13070	13077	50 %	50 %	0 %	0 %	385836938
50	NC_017493	ATAG	2	8	13304	13311	50 %	25 %	25 %	0 %	385836938
51	NC_017493	ATAA	2	8	13640	13647	75 %	25 %	0 %	0 %	385836938
52	NC_017493	TGAC	2	8	14379	14386	25 %	25 %	25 %	25 %	385836939
53	NC_017493	ACTG	2	8	14508	14515	25 %	25 %	25 %	25 %	385836939
54	NC_017493	TAAA	2	8	14934	14941	75 %	25 %	0 %	0 %	385836939
55	NC_017493	TTAT	2	8	15028	15035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017493	ATGT	2	8	15904	15911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017493	TCAG	2	8	16425	16432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017493	ATTT	2	8	16489	16496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017493	TTTA	2	8	16886	16893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017493	TTAA	2	8	16915	16922	50 %	50 %	0 %	0 %	385836941
61	NC_017493	AATG	2	8	17047	17054	50 %	25 %	25 %	0 %	385836941
62	NC_017493	TCTT	2	8	17614	17621	0 %	75 %	0 %	25 %	385836941
63	NC_017493	CTTT	2	8	17824	17831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017493	ATAA	2	8	18463	18470	75 %	25 %	0 %	0 %	385836942
65	NC_017493	ACCA	2	8	18997	19004	50 %	0 %	0 %	50 %	385836942
66	NC_017493	TGAA	2	8	19138	19145	50 %	25 %	25 %	0 %	385836942
67	NC_017493	GCAA	2	8	19876	19883	50 %	0 %	25 %	25 %	385836943
68	NC_017493	GTTT	2	8	20043	20050	0 %	75 %	25 %	0 %	385836943
69	NC_017493	CAAT	2	8	20438	20445	50 %	25 %	0 %	25 %	385836943
70	NC_017493	GATT	2	8	20697	20704	25 %	50 %	25 %	0 %	385836943
71	NC_017493	AGGT	2	8	21030	21037	25 %	25 %	50 %	0 %	385836943
72	NC_017493	AGAT	2	8	21194	21201	50 %	25 %	25 %	0 %	385836943
73	NC_017493	AGAT	2	8	21253	21260	50 %	25 %	25 %	0 %	385836943
74	NC_017493	ATTA	2	8	21322	21329	50 %	50 %	0 %	0 %	385836943
75	NC_017493	GAGC	2	8	21580	21587	25 %	0 %	50 %	25 %	385836944
76	NC_017493	CAAT	2	8	23699	23706	50 %	25 %	0 %	25 %	385836947
77	NC_017493	TCAT	2	8	23761	23768	25 %	50 %	0 %	25 %	385836947
78	NC_017493	TTTA	2	8	23883	23890	25 %	75 %	0 %	0 %	385836947
79	NC_017493	ATAC	2	8	23923	23930	50 %	25 %	0 %	25 %	385836947
80	NC_017493	ATAG	2	8	23979	23986	50 %	25 %	25 %	0 %	385836947
81	NC_017493	GTAC	2	8	23995	24002	25 %	25 %	25 %	25 %	385836947
82	NC_017493	TTTA	2	8	24400	24407	25 %	75 %	0 %	0 %	385836948
83	NC_017493	GTCC	2	8	24447	24454	0 %	25 %	25 %	50 %	385836948
84	NC_017493	CAAA	2	8	24669	24676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017493	GTTT	2	8	24931	24938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017493	TTGT	2	8	24949	24956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017493	GAAA	2	8	25027	25034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017493	AAGG	2	8	25611	25618	50 %	0 %	50 %	0 %	385836949
89	NC_017493	TCGA	2	8	25684	25691	25 %	25 %	25 %	25 %	385836949
90	NC_017493	AGGG	2	8	26065	26072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017493	AGTG	2	8	27240	27247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017493	CATC	2	8	27352	27359	25 %	25 %	0 %	50 %	385836951
93	NC_017493	ATTT	2	8	27961	27968	25 %	75 %	0 %	0 %	385836952
94	NC_017493	TGGT	2	8	28222	28229	0 %	50 %	50 %	0 %	385836952
95	NC_017493	TGAT	2	8	29149	29156	25 %	50 %	25 %	0 %	385836952
96	NC_017493	GTCT	2	8	29299	29306	0 %	50 %	25 %	25 %	385836952
97	NC_017493	TCAT	3	12	29493	29504	25 %	50 %	0 %	25 %	385836953
98	NC_017493	AAGT	2	8	29664	29671	50 %	25 %	25 %	0 %	385836953
99	NC_017493	TAAA	2	8	29910	29917	75 %	25 %	0 %	0 %	385836953
100	NC_017493	GTTA	2	8	30126	30133	25 %	50 %	25 %	0 %	385836954
101	NC_017493	GGAT	2	8	30359	30366	25 %	25 %	50 %	0 %	385836954
102	NC_017493	TTGT	2	8	30860	30867	0 %	75 %	25 %	0 %	385836955
103	NC_017493	AAGT	2	8	31074	31081	50 %	25 %	25 %	0 %	385836955
104	NC_017493	AAAT	2	8	31425	31432	75 %	25 %	0 %	0 %	385836955
105	NC_017493	GAAA	2	8	33096	33103	75 %	0 %	25 %	0 %	385836956
106	NC_017493	TTAT	2	8	33772	33779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017493	ATCA	2	8	34476	34483	50 %	25 %	0 %	25 %	385836957
108	NC_017493	GACA	2	8	34869	34876	50 %	0 %	25 %	25 %	385836957
109	NC_017493	ATAA	2	8	34942	34949	75 %	25 %	0 %	0 %	385836957
110	NC_017493	TGTT	2	8	35145	35152	0 %	75 %	25 %	0 %	385836957
111	NC_017493	AAAG	2	8	35399	35406	75 %	0 %	25 %	0 %	385836957
112	NC_017493	TTTC	2	8	36154	36161	0 %	75 %	0 %	25 %	385836958
113	NC_017493	ATTT	2	8	36352	36359	25 %	75 %	0 %	0 %	385836958
114	NC_017493	TAAA	2	8	36988	36995	75 %	25 %	0 %	0 %	385836959
115	NC_017493	TTAT	2	8	37082	37089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017493	ATGC	2	8	37443	37450	25 %	25 %	25 %	25 %	385836960
117	NC_017493	GAAA	2	8	37931	37938	75 %	0 %	25 %	0 %	385836960
118	NC_017493	TCAC	2	8	38062	38069	25 %	25 %	0 %	50 %	385836960
119	NC_017493	CTTT	2	8	38185	38192	0 %	75 %	0 %	25 %	385836960
120	NC_017493	TTTA	2	8	38243	38250	25 %	75 %	0 %	0 %	385836960
121	NC_017493	ATGA	2	8	38253	38260	50 %	25 %	25 %	0 %	385836960
122	NC_017493	CTAT	2	8	38309	38316	25 %	50 %	0 %	25 %	385836960
123	NC_017493	TTTG	2	8	38893	38900	0 %	75 %	25 %	0 %	385836961
124	NC_017493	AATC	2	8	39873	39880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017493	TGAT	2	8	39954	39961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017493	ATTC	2	8	40011	40018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017493	AAAT	2	8	40104	40111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017493	AAAG	2	8	40471	40478	75 %	0 %	25 %	0 %	385836962
129	NC_017493	TTAA	2	8	41462	41469	50 %	50 %	0 %	0 %	385836962
130	NC_017493	CTTG	2	8	41927	41934	0 %	50 %	25 %	25 %	385836962
131	NC_017493	GTAG	2	8	41990	41997	25 %	25 %	50 %	0 %	385836962
132	NC_017493	CTGT	2	8	43788	43795	0 %	50 %	25 %	25 %	385836963
133	NC_017493	CTTG	2	8	44114	44121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017493	AAGA	2	8	44386	44393	75 %	0 %	25 %	0 %	385836964
135	NC_017493	TTGA	2	8	45028	45035	25 %	50 %	25 %	0 %	385836964
136	NC_017493	TGTT	2	8	45405	45412	0 %	75 %	25 %	0 %	385836965
137	NC_017493	AAGT	2	8	45433	45440	50 %	25 %	25 %	0 %	385836965
138	NC_017493	TAAG	2	8	45714	45721	50 %	25 %	25 %	0 %	385836965
139	NC_017493	ATAA	2	8	45994	46001	75 %	25 %	0 %	0 %	385836965
140	NC_017493	CGAG	2	8	47122	47129	25 %	0 %	50 %	25 %	385836967
141	NC_017493	AAAT	2	8	47130	47137	75 %	25 %	0 %	0 %	385836967
142	NC_017493	AGTG	2	8	47691	47698	25 %	25 %	50 %	0 %	385836967
143	NC_017493	ATAA	2	8	48217	48224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017493	TTTA	2	8	48311	48318	25 %	75 %	0 %	0 %	385836968
145	NC_017493	TCAG	2	8	48736	48743	25 %	25 %	25 %	25 %	385836968
146	NC_017493	GTCA	2	8	48866	48873	25 %	25 %	25 %	25 %	385836968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.