MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	TTTA	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	AGAA	2	8	1398	1405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017493	GTAG	2	8	2719	2726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017493	AACA	2	8	3957	3964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017493	CAAA	2	8	5835	5842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017493	AAAG	2	8	6775	6782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017493	ATTC	2	8	9868	9875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017493	ATTT	2	8	13023	13030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017493	TTAT	2	8	15028	15035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017493	ATGT	2	8	15904	15911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017493	TCAG	2	8	16425	16432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017493	ATTT	2	8	16489	16496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017493	TTTA	2	8	16886	16893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017493	CTTT	2	8	17824	17831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017493	CAAA	2	8	24669	24676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017493	GTTT	2	8	24931	24938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017493	TTGT	2	8	24949	24956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017493	GAAA	2	8	25027	25034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017493	AGGG	2	8	26065	26072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017493	AGTG	2	8	27240	27247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017493	TTAT	2	8	33772	33779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017493	TTAT	2	8	37082	37089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017493	AATC	2	8	39873	39880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017493	TGAT	2	8	39954	39961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017493	ATTC	2	8	40011	40018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017493	AAAT	2	8	40104	40111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017493	CTTG	2	8	44114	44121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017493	ATAA	2	8	48217	48224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.