MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	TTA	2	6	191	196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017493	CTC	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836927
4	NC_017493	ATA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
5	NC_017493	ATT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
6	NC_017493	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836927
7	NC_017493	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
8	NC_017493	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
9	NC_017493	GAA	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
10	NC_017493	ATA	2	6	810	815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
11	NC_017493	TGA	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
12	NC_017493	TAG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
13	NC_017493	ATG	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
14	NC_017493	GAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
15	NC_017493	TGT	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836927
16	NC_017493	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
17	NC_017493	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
18	NC_017493	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017493	AGT	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017493	GGT	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836928
21	NC_017493	ATA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
22	NC_017493	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
23	NC_017493	CTA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
24	NC_017493	AGA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
25	NC_017493	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
26	NC_017493	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
27	NC_017493	TTA	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
28	NC_017493	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836928
29	NC_017493	ATG	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836928
30	NC_017493	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
31	NC_017493	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836928
32	NC_017493	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
33	NC_017493	AGA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
34	NC_017493	CAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
35	NC_017493	ATA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017493	AGT	2	6	2383	2388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017493	ATA	2	6	2406	2411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017493	ATT	2	6	2525	2530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017493	GAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017493	AGA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017493	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017493	GAT	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017493	TGA	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
44	NC_017493	CAT	2	6	2897	2902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
45	NC_017493	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
46	NC_017493	TCA	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
47	NC_017493	TTC	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
48	NC_017493	AAT	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
49	NC_017493	TTC	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
50	NC_017493	AAT	2	6	3189	3194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
51	NC_017493	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
52	NC_017493	AGA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836929
53	NC_017493	TAA	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
54	NC_017493	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
55	NC_017493	GAT	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
56	NC_017493	ACT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
57	NC_017493	GAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836929
58	NC_017493	CAA	2	6	3770	3775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017493	GTT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017493	GTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017493	ATA	2	6	4291	4296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017493	ACA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836930
63	NC_017493	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836930
64	NC_017493	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836930
65	NC_017493	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
66	NC_017493	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
67	NC_017493	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
68	NC_017493	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
69	NC_017493	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
70	NC_017493	AGA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
71	NC_017493	TTA	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
72	NC_017493	ATT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
73	NC_017493	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
74	NC_017493	TTG	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017493	AGA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017493	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017493	TAA	2	6	5759	5764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017493	AAT	2	6	5823	5828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017493	TGG	2	6	5913	5918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017493	AAT	2	6	5977	5982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017493	TCA	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836931
82	NC_017493	ATT	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836931
83	NC_017493	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836931
84	NC_017493	TGA	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836931
85	NC_017493	TTG	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017493	TTC	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017493	TGT	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017493	TAA	2	6	6644	6649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017493	TAA	2	6	6903	6908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
90	NC_017493	GAA	3	9	7084	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
91	NC_017493	AAG	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
92	NC_017493	ATT	2	6	7112	7117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836932
93	NC_017493	ACA	2	6	7204	7209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
94	NC_017493	ATG	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
95	NC_017493	TAA	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
96	NC_017493	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
97	NC_017493	AAC	2	6	7741	7746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
98	NC_017493	AAG	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
99	NC_017493	CAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
100	NC_017493	TGA	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
101	NC_017493	AAG	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
102	NC_017493	CGA	2	6	8178	8183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836932
103	NC_017493	TAC	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836932
104	NC_017493	AAC	2	6	8265	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
105	NC_017493	GAA	2	6	8368	8373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
106	NC_017493	AGT	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
107	NC_017493	CAA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
108	NC_017493	AGA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
109	NC_017493	GAA	2	6	8647	8652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
110	NC_017493	CTA	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836932
111	NC_017493	CAA	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
112	NC_017493	AAT	2	6	8677	8682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
113	NC_017493	GAA	3	9	8769	8777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
114	NC_017493	TTC	2	6	8938	8943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836933
115	NC_017493	CGT	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836933
116	NC_017493	GCT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836933
117	NC_017493	TCT	2	6	9361	9366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836933
118	NC_017493	GTA	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836933
119	NC_017493	GTA	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836934
120	NC_017493	AAT	2	6	9509	9514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836934
121	NC_017493	TCG	2	6	9685	9690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017493	CAA	2	6	9801	9806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017493	ATA	2	6	9899	9904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017493	GTG	2	6	9971	9976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017493	ACA	2	6	10023	10028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836935
126	NC_017493	GCT	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836935
127	NC_017493	GTC	2	6	10476	10481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836935
128	NC_017493	TTA	2	6	10489	10494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
129	NC_017493	ATT	2	6	10514	10519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
130	NC_017493	GTT	2	6	10520	10525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836935
131	NC_017493	TGG	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836935
132	NC_017493	ATT	2	6	10722	10727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
133	NC_017493	CAT	2	6	10936	10941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836935
134	NC_017493	TCT	2	6	11018	11023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836935
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263	NC_017493	TGA	2	6	21361	21366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836944
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265	NC_017493	TCA	2	6	21392	21397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836944
266	NC_017493	CAT	2	6	21414	21419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836944
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272	NC_017493	TCA	2	6	21724	21729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836945
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