MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	TTA	2	6	191	196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017493	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017493	AGT	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017493	ATA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017493	AGT	2	6	2383	2388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017493	ATA	2	6	2406	2411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017493	ATT	2	6	2525	2530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017493	GAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017493	AGA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017493	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017493	GAT	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017493	CAA	2	6	3770	3775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017493	GTT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017493	GTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017493	ATA	2	6	4291	4296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017493	TTG	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017493	AGA	2	6	5591	5596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017493	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017493	TAA	2	6	5759	5764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017493	AAT	2	6	5823	5828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017493	TGG	2	6	5913	5918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017493	AAT	2	6	5977	5982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017493	TTG	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017493	TTC	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017493	TGT	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017493	TAA	2	6	6644	6649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017493	TCG	2	6	9685	9690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017493	CAA	2	6	9801	9806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017493	ATA	2	6	9899	9904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017493	GTG	2	6	9971	9976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017493	ATA	2	6	12047	12052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017493	TGG	2	6	12092	12097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017493	ATT	2	6	12907	12912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017493	AAT	2	6	14043	14048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017493	TAA	3	9	14058	14066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017493	ATT	2	6	14085	14090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017493	ACA	2	6	15151	15156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017493	ATA	2	6	15169	15174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017493	CTG	2	6	15197	15202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017493	CAA	2	6	15276	15281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017493	TAT	2	6	15326	15331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017493	TGA	2	6	15453	15458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017493	ATG	2	6	15498	15503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017493	TAT	2	6	15532	15537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017493	GAG	2	6	15552	15557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017493	TGT	2	6	15571	15576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017493	TAA	2	6	15687	15692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017493	GGT	2	6	15728	15733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017493	ATT	2	6	15741	15746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017493	TGA	2	6	15834	15839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017493	TAA	2	6	15859	15864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017493	CTT	2	6	15990	15995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017493	GCA	2	6	16050	16055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017493	AAT	2	6	16133	16138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017493	ATA	2	6	16244	16249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017493	ACA	2	6	16333	16338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017493	TTA	2	6	16352	16357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017493	ATT	2	6	16513	16518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017493	ATC	2	6	16751	16756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017493	CAT	2	6	16764	16769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017493	GAA	2	6	16844	16849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017493	AAT	2	6	17849	17854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017493	TAC	2	6	17978	17983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017493	TAA	2	6	18037	18042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017493	ATT	2	6	18084	18089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017493	TCC	2	6	21652	21657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017493	CCT	2	6	24564	24569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017493	TCA	2	6	24635	24640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017493	ATT	2	6	24746	24751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017493	TCA	2	6	24919	24924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017493	ACT	2	6	25836	25841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017493	AAT	2	6	25846	25851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017493	ATT	2	6	25941	25946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017493	CTA	2	6	25991	25996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017493	AGT	2	6	26105	26110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017493	TAA	2	6	26906	26911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017493	ACG	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017493	CAA	2	6	27087	27092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017493	GAA	2	6	27188	27193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017493	TCA	2	6	27583	27588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017493	AAT	2	6	29454	29459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017493	TTA	2	6	29479	29484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017493	AAG	2	6	30760	30765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017493	TAG	2	6	32705	32710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017493	TCA	2	6	33532	33537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017493	CAG	2	6	33581	33586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017493	CGA	2	6	33616	33621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017493	TTA	2	6	33714	33719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017493	GTT	2	6	33734	33739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017493	TTA	2	6	33804	33809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017493	AAC	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017493	GTT	2	6	34081	34086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017493	TAT	2	6	34095	34100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017493	TGT	2	6	34101	34106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017493	CGA	2	6	34212	34217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017493	TAA	2	6	34368	34373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017493	AGT	2	6	34389	34394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017493	AAT	2	6	35682	35687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017493	GTT	2	6	35694	35699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017493	AAC	2	6	35700	35705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017493	TTG	2	6	35708	35713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017493	ATA	4	12	35718	35729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017493	TAA	2	6	38383	38388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017493	CTT	2	6	38443	38448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017493	TTC	2	6	39549	39554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017493	TGG	2	6	39624	39629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017493	TTA	2	6	39664	39669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017493	TCC	2	6	39699	39704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017493	AAT	2	6	39711	39716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017493	ATG	2	6	39853	39858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017493	TTA	2	6	39867	39872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017493	ACC	2	6	40030	40035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017493	CTG	2	6	40037	40042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017493	GAT	2	6	40060	40065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017493	ATT	2	6	40228	40233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017493	AAG	2	6	42178	42183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017493	AAT	2	6	44096	44101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017493	TGT	2	6	44187	44192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017493	TAA	2	6	48032	48037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017493	CTT	2	6	48045	48050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017493	ACA	2	6	48128	48133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017493	GGA	2	6	48139	48144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017493	AAT	2	6	48145	48150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017493	TAT	2	6	48181	48186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017493	AAT	2	6	49162	49167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.