MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	CTC	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836927
2	NC_017493	ATA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
3	NC_017493	ATT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
4	NC_017493	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836927
5	NC_017493	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
6	NC_017493	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
7	NC_017493	GAA	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
8	NC_017493	ATA	2	6	810	815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
9	NC_017493	TGA	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
10	NC_017493	TAG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
11	NC_017493	ATG	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
12	NC_017493	GAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
13	NC_017493	TGT	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836927
14	NC_017493	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
15	NC_017493	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
16	NC_017493	GGT	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836928
17	NC_017493	ATA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
18	NC_017493	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
19	NC_017493	CTA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
20	NC_017493	AGA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
21	NC_017493	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
22	NC_017493	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
23	NC_017493	TTA	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
24	NC_017493	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836928
25	NC_017493	ATG	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836928
26	NC_017493	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
27	NC_017493	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836928
28	NC_017493	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
29	NC_017493	AGA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
30	NC_017493	CAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
31	NC_017493	TGA	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
32	NC_017493	CAT	2	6	2897	2902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
33	NC_017493	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
34	NC_017493	TCA	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
35	NC_017493	TTC	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
36	NC_017493	AAT	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
37	NC_017493	TTC	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
38	NC_017493	AAT	2	6	3189	3194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
39	NC_017493	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
40	NC_017493	AGA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836929
41	NC_017493	TAA	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
42	NC_017493	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
43	NC_017493	GAT	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
44	NC_017493	ACT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
45	NC_017493	GAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836929
46	NC_017493	ACA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836930
47	NC_017493	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836930
48	NC_017493	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836930
49	NC_017493	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
50	NC_017493	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
51	NC_017493	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
52	NC_017493	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
53	NC_017493	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
54	NC_017493	AGA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
55	NC_017493	TTA	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
56	NC_017493	ATT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
57	NC_017493	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
58	NC_017493	TCA	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836931
59	NC_017493	ATT	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836931
60	NC_017493	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836931
61	NC_017493	TGA	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836931
62	NC_017493	TAA	2	6	6903	6908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
63	NC_017493	GAA	3	9	7084	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
64	NC_017493	AAG	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
65	NC_017493	ATT	2	6	7112	7117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836932
66	NC_017493	ACA	2	6	7204	7209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
67	NC_017493	ATG	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
68	NC_017493	TAA	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
69	NC_017493	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
70	NC_017493	AAC	2	6	7741	7746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
71	NC_017493	AAG	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
72	NC_017493	CAA	2	6	8014	8019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
73	NC_017493	TGA	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
74	NC_017493	AAG	2	6	8102	8107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
75	NC_017493	CGA	2	6	8178	8183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836932
76	NC_017493	TAC	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836932
77	NC_017493	AAC	2	6	8265	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
78	NC_017493	GAA	2	6	8368	8373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
79	NC_017493	AGT	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836932
80	NC_017493	CAA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
81	NC_017493	AGA	2	6	8457	8462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
82	NC_017493	GAA	2	6	8647	8652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
83	NC_017493	CTA	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836932
84	NC_017493	CAA	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836932
85	NC_017493	AAT	2	6	8677	8682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836932
86	NC_017493	GAA	3	9	8769	8777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836932
87	NC_017493	TTC	2	6	8938	8943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836933
88	NC_017493	CGT	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836933
89	NC_017493	GCT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836933
90	NC_017493	TCT	2	6	9361	9366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836933
91	NC_017493	GTA	2	6	9417	9422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836933
92	NC_017493	GTA	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836934
93	NC_017493	AAT	2	6	9509	9514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836934
94	NC_017493	ACA	2	6	10023	10028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836935
95	NC_017493	GCT	2	6	10299	10304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836935
96	NC_017493	GTC	2	6	10476	10481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836935
97	NC_017493	TTA	2	6	10489	10494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
98	NC_017493	ATT	2	6	10514	10519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
99	NC_017493	GTT	2	6	10520	10525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836935
100	NC_017493	TGG	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836935
101	NC_017493	ATT	2	6	10722	10727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
102	NC_017493	CAT	2	6	10936	10941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836935
103	NC_017493	TCT	2	6	11018	11023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836935
104	NC_017493	ATT	2	6	11030	11035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
105	NC_017493	ATT	2	6	11193	11198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
106	NC_017493	TCT	2	6	11263	11268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836935
107	NC_017493	ATT	2	6	11300	11305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
108	NC_017493	ATG	2	6	11307	11312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836935
109	NC_017493	TCG	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836935
110	NC_017493	TAC	2	6	11515	11520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836935
111	NC_017493	ATT	2	6	11535	11540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836935
112	NC_017493	TGA	2	6	11611	11616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836936
113	NC_017493	TTA	2	6	12027	12032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836936
114	NC_017493	GTT	2	6	12154	12159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836937
115	NC_017493	TTC	2	6	12215	12220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836937
116	NC_017493	CGT	2	6	12304	12309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836937
117	NC_017493	AGC	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836937
118	NC_017493	GAT	2	6	12650	12655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836937
119	NC_017493	ATA	2	6	12768	12773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836937
120	NC_017493	AAT	2	6	12786	12791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836937
121	NC_017493	TGA	2	6	13102	13107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836938
122	NC_017493	TAA	2	6	13154	13159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836938
123	NC_017493	GCA	2	6	13242	13247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836938
124	NC_017493	ACA	2	6	13362	13367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836938
125	NC_017493	CTA	2	6	13378	13383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836938
126	NC_017493	GAA	3	9	13477	13485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836938
127	NC_017493	TAA	2	6	13582	13587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836938
128	NC_017493	CAT	2	6	13603	13608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836938
129	NC_017493	GTA	2	6	13627	13632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836938
130	NC_017493	CAT	2	6	13652	13657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836938
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250	NC_017493	CTT	2	6	24480	24485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836948
251	NC_017493	CAA	3	9	24540	24548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836948
252	NC_017493	CGA	2	6	25056	25061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836949
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