MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	TA	3	6	712	717	50 %	50 %	0 %	0 %	385836927
2	NC_017493	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	385836929
3	NC_017493	AT	4	8	4117	4124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017493	TA	3	6	4175	4180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017493	GT	3	6	4417	4422	0 %	50 %	50 %	0 %	385836930
6	NC_017493	TA	3	6	6689	6694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017493	CA	3	6	8030	8035	50 %	0 %	0 %	50 %	385836932
8	NC_017493	TA	3	6	8953	8958	50 %	50 %	0 %	0 %	385836933
9	NC_017493	TA	3	6	9100	9105	50 %	50 %	0 %	0 %	385836933
10	NC_017493	CT	3	6	9563	9568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017493	AT	3	6	9844	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017493	AT	3	6	10184	10189	50 %	50 %	0 %	0 %	385836935
13	NC_017493	AT	3	6	10292	10297	50 %	50 %	0 %	0 %	385836935
14	NC_017493	CA	3	6	11226	11231	50 %	0 %	0 %	50 %	385836935
15	NC_017493	CT	3	6	12130	12135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017493	TA	3	6	12377	12382	50 %	50 %	0 %	0 %	385836937
17	NC_017493	TG	3	6	12696	12701	0 %	50 %	50 %	0 %	385836937
18	NC_017493	AT	3	6	12833	12838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017493	AT	3	6	15070	15075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017493	AT	3	6	16068	16073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017493	TA	3	6	18043	18048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017493	GA	3	6	18927	18932	50 %	0 %	50 %	0 %	385836942
23	NC_017493	GT	3	6	19155	19160	0 %	50 %	50 %	0 %	385836942
24	NC_017493	TG	3	6	19435	19440	0 %	50 %	50 %	0 %	385836942
25	NC_017493	AT	3	6	19675	19680	50 %	50 %	0 %	0 %	385836943
26	NC_017493	GA	3	6	20801	20806	50 %	0 %	50 %	0 %	385836943
27	NC_017493	CA	3	6	20853	20858	50 %	0 %	0 %	50 %	385836943
28	NC_017493	GA	3	6	21266	21271	50 %	0 %	50 %	0 %	385836943
29	NC_017493	AG	3	6	21620	21625	50 %	0 %	50 %	0 %	385836944
30	NC_017493	TA	3	6	24651	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017493	AT	3	6	26624	26629	50 %	50 %	0 %	0 %	385836950
32	NC_017493	CT	3	6	29173	29178	0 %	50 %	0 %	50 %	385836952
33	NC_017493	AT	3	6	30067	30072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017493	CA	3	6	30204	30209	50 %	0 %	0 %	50 %	385836954
35	NC_017493	TA	3	6	30523	30528	50 %	50 %	0 %	0 %	385836954
36	NC_017493	AT	3	6	31615	31620	50 %	50 %	0 %	0 %	385836955
37	NC_017493	AG	3	6	32768	32773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017493	TA	3	6	33231	33236	50 %	50 %	0 %	0 %	385836956
39	NC_017493	AT	3	6	33377	33382	50 %	50 %	0 %	0 %	385836956
40	NC_017493	AT	3	6	33566	33571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017493	GT	3	6	33796	33801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017493	GA	3	6	35332	35337	50 %	0 %	50 %	0 %	385836957
43	NC_017493	TA	3	6	35874	35879	50 %	50 %	0 %	0 %	385836958
44	NC_017493	TA	3	6	36021	36026	50 %	50 %	0 %	0 %	385836958
45	NC_017493	CT	3	6	36484	36489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017493	TA	5	10	38517	38526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017493	AT	3	6	39106	39111	50 %	50 %	0 %	0 %	385836961
48	NC_017493	TC	3	6	39407	39412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017493	GA	3	6	39743	39748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017493	AT	3	6	40170	40175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017493	AT	3	6	40247	40252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017493	AG	3	6	40784	40789	50 %	0 %	50 %	0 %	385836962
53	NC_017493	AG	4	8	40962	40969	50 %	0 %	50 %	0 %	385836962

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.