MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	TAATAT	2	12	34469	34480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017492	TGAAAA	2	12	35823	35834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017492	TTTTAA	2	12	36413	36424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017492	TATATT	2	12	36579	36590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017492	TAAAAT	2	12	43569	43580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017492	TAAAAA	2	12	76081	76092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017492	TTTTAG	2	12	84823	84834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017492	AAAATT	2	12	86588	86599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017492	AATAGC	2	12	151529	151540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017492	TAAAAA	2	12	173536	173547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017492	TTATTT	2	12	208526	208537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017492	TATAAA	2	12	212760	212771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017492	TGATTT	2	12	224980	224991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017492	AACAAA	2	12	237975	237986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017492	TAAAAA	2	12	260850	260861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017492	AAATAG	2	12	265684	265695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017492	TGAAAA	2	12	271673	271684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017492	ATTCTA	2	12	299860	299871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017492	TTTAAA	2	12	324582	324593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017492	AAGTTT	2	12	354583	354594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017492	TTGTTT	2	12	355022	355033	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017492	ATTTTT	2	12	374105	374116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017492	ATAAAA	2	12	407882	407893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017492	TAAAAT	2	12	422809	422820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017492	TAAAAA	2	12	441775	441786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017492	ATGAAA	2	12	466360	466371	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017492	TTTTTA	2	12	471196	471207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017492	TTTTAA	2	12	476843	476854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017492	ACACCG	2	12	476936	476947	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017492	AGGATA	2	12	516308	516319	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017492	AAAATC	2	12	519570	519581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017492	TATTTT	2	12	552559	552570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017492	TAAAAA	2	12	560419	560430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017492	ATTTTA	2	12	560950	560961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017492	CTTTTA	2	12	569138	569149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017492	AAATGA	2	12	584989	585000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017492	TTAAAT	2	12	591798	591809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017492	TAAAAA	2	12	617461	617472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017492	ACTAGA	2	12	626447	626458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017492	AAAAAT	2	12	657047	657058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017492	CAAATA	2	12	659094	659105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017492	ATAAAT	2	12	665352	665363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017492	TATTTT	2	12	671258	671269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017492	ACAAAA	2	12	674184	674195	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017492	GTTTAA	2	12	747473	747484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017492	AAAATG	2	12	760196	760207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017492	AACAAA	2	12	813562	813573	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017492	TAAAAA	2	12	844057	844068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017492	TAAAAA	2	12	861764	861775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017492	ATTTTT	2	12	865371	865382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017492	ATTTTA	2	12	886796	886807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017492	ATATAA	2	12	889852	889863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017492	ATAAAT	2	12	896521	896532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017492	TTTCTA	2	12	954228	954239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017492	CATTTA	2	12	978557	978568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017492	TATAAA	2	12	984259	984270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017492	TGATAT	2	12	986105	986116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017492	ATAAAT	2	12	1047526	1047537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017492	TAAAAA	2	12	1048752	1048763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017492	AACTGC	2	12	1053097	1053108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017492	TATTTT	2	12	1058212	1058223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017492	ATTTGA	2	12	1063803	1063814	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017492	ATAAAA	2	12	1068792	1068803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017492	TTTTAA	2	12	1074255	1074266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017492	TTAAAA	2	12	1083858	1083869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017492	CTTTTC	2	12	1090291	1090302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017492	GTTTTT	2	12	1142335	1142346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017492	TTTTCC	3	18	1143514	1143531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017492	GTATCA	2	12	1178857	1178868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017492	AGAAAT	2	12	1210390	1210401	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017492	TTAAAT	2	12	1223679	1223690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017492	TTTTTA	2	12	1232921	1232932	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017492	TTATTT	2	12	1260567	1260578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017492	TTTAAT	2	12	1276806	1276817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017492	TTCCTT	2	12	1296903	1296914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017492	ATAAAA	2	12	1305348	1305359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017492	ATTTTA	2	12	1351632	1351643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017492	TAAAAA	2	12	1362541	1362552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017492	CTTTTT	2	12	1372236	1372247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017492	TTATAT	2	12	1422926	1422937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017492	CTTATA	2	12	1448385	1448396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017492	GGTTAT	2	12	1519896	1519907	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017492	TTAAAT	2	12	1553034	1553045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017492	AAGCTT	2	12	1556192	1556203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017492	TAAATT	2	12	1557373	1557384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017492	TTGATT	2	12	1563639	1563650	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017492	TAAAAA	2	12	1564198	1564209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017492	GTTACT	2	12	1577724	1577735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017492	ATTTTG	2	12	1605659	1605670	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017492	TTGCGA	2	12	1660287	1660298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017492	TCAAAT	2	12	1676611	1676622	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017492	TAAAAA	2	12	1687698	1687709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017492	TTTTAT	2	12	1703772	1703783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017492	ATTTTT	2	12	1737074	1737085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017492	ATTTTG	2	12	1744595	1744606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017492	TTATTT	2	12	1744995	1745006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017492	AAAATT	2	12	1795713	1795724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017492	CTTTCT	2	12	1820217	1820228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017492	AAATCA	2	12	1830527	1830538	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017492	ATTAAC	2	12	1833686	1833697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017492	CTTAAC	2	12	1843876	1843887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017492	CTTCCA	2	12	1913615	1913626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017492	AAATAA	2	12	1952439	1952450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017492	CTCCAA	2	12	1955205	1955216	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017492	AAAAAC	2	12	1965405	1965416	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017492	TATTTG	3	18	1970139	1970156	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017492	TTTTGC	2	12	1995293	1995304	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017492	TTTACA	2	12	2030938	2030949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017492	TATTCT	2	12	2031146	2031157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017492	CTTCCA	2	12	2033205	2033216	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017492	AAAACA	2	12	2072247	2072258	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017492	CATTTT	2	12	2073612	2073623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017492	ATAAAA	2	12	2077654	2077665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017492	TGGGAG	2	12	2084146	2084157	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017492	TCTTTT	2	12	2085704	2085715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017492	TGTTTT	2	12	2113521	2113532	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017492	TGAAAA	2	12	2120777	2120788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017492	TTTTTA	2	12	2132737	2132748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017492	ACAATT	2	12	2143154	2143165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017492	TTTTTA	2	12	2143287	2143298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017492	ATATTT	2	12	2218545	2218556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017492	TTTTTA	2	12	2227262	2227273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017492	TGATTT	2	12	2228020	2228031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017492	TAAATT	2	12	2249804	2249815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017492	TAAAAA	2	12	2286040	2286051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017492	CTTCCA	2	12	2288189	2288200	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017492	ATTTAT	2	12	2302474	2302485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017492	TAAATA	2	12	2307409	2307420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017492	CTTCCA	2	12	2332987	2332998	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017492	ATGTTT	2	12	2393649	2393660	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017492	CCCGAA	2	12	2423580	2423591	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017492	CTTCCA	2	12	2424000	2424011	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017492	CTTCCA	2	12	2447455	2447466	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.