MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 470

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	AAATG	2	10	12223	12232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017492	GAAAA	2	10	14022	14031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017492	CTTAA	2	10	25608	25617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017492	AAGTC	2	10	25749	25758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017492	CAAAA	2	10	27908	27917	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017492	TATAA	2	10	36755	36764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017492	TTTAA	2	10	39159	39168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017492	TAATC	2	10	41239	41248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017492	AGTAA	2	10	42297	42306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017492	AGTTT	2	10	58007	58016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017492	GTCTT	2	10	59053	59062	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017492	CAAAT	2	10	61486	61495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017492	TACTA	2	10	66780	66789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017492	AATAT	2	10	68851	68860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017492	TGAAA	2	10	71512	71521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017492	AATTT	2	10	76189	76198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017492	CTTTT	2	10	79230	79239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017492	CTATT	2	10	79240	79249	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017492	ATTAA	2	10	82462	82471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017492	AAAGT	2	10	85068	85077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017492	CAAAT	2	10	86695	86704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017492	AGGAG	2	10	89319	89328	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017492	AAATA	2	10	109840	109849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017492	TATAT	2	10	113572	113581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017492	TAAAT	2	10	115730	115739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017492	GTAAA	2	10	118955	118964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017492	TCTTT	2	10	121135	121144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017492	ATAAA	2	10	129536	129545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017492	ATAGA	2	10	131404	131413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017492	TATGA	2	10	138718	138727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017492	TTATA	2	10	139938	139947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017492	TATTC	2	10	149918	149927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017492	AATAA	2	10	153033	153042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017492	ATTTG	2	10	156585	156594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017492	GCTCC	2	10	156888	156897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017492	TAAAA	2	10	156961	156970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017492	TTTTA	2	10	162971	162980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017492	TTTAC	2	10	166878	166887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017492	TTGTT	2	10	167825	167834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017492	TAACA	2	10	174048	174057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017492	AAAAC	2	10	181587	181596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017492	TGTTT	2	10	181620	181629	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017492	GAAAA	2	10	183684	183693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017492	TAATT	2	10	184026	184035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017492	AATAA	2	10	204488	204497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017492	ATTTA	2	10	209827	209836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017492	TAAAT	2	10	216767	216776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017492	GAAAG	2	10	225092	225101	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017492	AAAGT	2	10	230030	230039	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017492	CACTA	2	10	239048	239057	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017492	TAAAT	2	10	259091	259100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017492	TAAAG	2	10	259101	259110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017492	AAAAG	2	10	270352	270361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017492	ATAAA	2	10	276372	276381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017492	TGAAT	2	10	278100	278109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017492	TTGAT	2	10	285325	285334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017492	GCTAT	2	10	287085	287094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017492	TATTT	2	10	288423	288432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017492	GCAAA	2	10	306100	306109	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017492	AAATA	2	10	316964	316973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017492	AAAAG	2	10	320728	320737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017492	AAATA	2	10	330850	330859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017492	AATGA	2	10	332441	332450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017492	AAAGA	2	10	335724	335733	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017492	ATTGA	2	10	339729	339738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017492	CTTAT	2	10	341978	341987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017492	TTTTG	2	10	373169	373178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017492	TAAAA	2	10	380388	380397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017492	TAAAT	2	10	391268	391277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017492	TAAAA	2	10	398300	398309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017492	ATATA	2	10	399251	399260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017492	CTTTC	2	10	405601	405610	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017492	ATTAA	2	10	411356	411365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017492	TATAA	2	10	413099	413108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017492	ATTTT	2	10	421731	421740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017492	CTTTG	2	10	426126	426135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017492	TAAAA	2	10	433228	433237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017492	TTATA	2	10	447058	447067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017492	AAATC	2	10	458018	458027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017492	AAAAG	2	10	475392	475401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017492	CTTAT	2	10	475485	475494	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017492	AGGTT	2	10	486485	486494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017492	GCCTT	2	10	495874	495883	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017492	TTTTG	2	10	505710	505719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017492	ATTTT	2	10	509974	509983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017492	TAAAA	2	10	515889	515898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017492	GATTA	2	10	519496	519505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017492	AATTA	2	10	529922	529931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017492	TGAAC	2	10	529941	529950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017492	TAAAA	2	10	534953	534962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017492	ATTTT	2	10	536474	536483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017492	AAAGT	2	10	538515	538524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017492	AAGTG	2	10	538559	538568	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017492	AGAAA	2	10	539908	539917	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017492	GACTG	2	10	540016	540025	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017492	TCAAG	2	10	540047	540056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017492	ATTAT	2	10	547048	547057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017492	ATTAT	2	10	547059	547068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017492	TATAA	2	10	547077	547086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017492	TATAT	2	10	551393	551402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017492	TATAT	2	10	552400	552409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017492	ATGAT	2	10	552609	552618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017492	ATGTA	2	10	554552	554561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017492	AAAAT	2	10	558432	558441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017492	TAAAA	2	10	565624	565633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017492	TTTTA	2	10	569115	569124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017492	GCTTT	2	10	572010	572019	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017492	TAAAT	2	10	581312	581321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017492	AATTT	2	10	584051	584060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017492	AAAAT	2	10	584916	584925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017492	TATGG	2	10	589986	589995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017492	ATATA	2	10	595380	595389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017492	AGAGA	2	10	612809	612818	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017492	CGCTT	2	10	625838	625847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017492	ATTGC	2	10	636662	636671	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017492	AATGT	2	10	640100	640109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017492	ATAAA	2	10	659559	659568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017492	GTAAT	2	10	659880	659889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017492	ATAAA	2	10	659968	659977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017492	GTTAC	2	10	663109	663118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017492	TAAAA	2	10	665333	665342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017492	AAAAT	2	10	665837	665846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017492	TTATT	2	10	668961	668970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017492	TTTAA	2	10	673249	673258	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017492	TTTAT	2	10	687752	687761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017492	ATTGA	2	10	688692	688701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017492	CGACT	2	10	691997	692006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017492	AATAA	2	10	707358	707367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017492	AATTA	2	10	708379	708388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017492	TTTAT	2	10	718248	718257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017492	TAATA	2	10	726057	726066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017492	ATTAA	2	10	726458	726467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017492	AAATA	2	10	729360	729369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017492	CTAAT	2	10	747351	747360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017492	TATGA	3	15	748338	748352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017492	TTTAT	2	10	753984	753993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017492	AAAAT	2	10	764188	764197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017492	GATAA	2	10	767709	767718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017492	AAATT	2	10	780801	780810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017492	AATAG	2	10	791374	791383	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017492	TAAAT	2	10	810818	810827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017492	AGATG	2	10	814172	814181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017492	TATAA	2	10	814416	814425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017492	AAGTA	2	10	816897	816906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017492	GAAAG	2	10	818798	818807	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017492	TTTTA	2	10	836816	836825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017492	AGATG	2	10	846978	846987	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017492	AAAAT	2	10	848800	848809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017492	TTTTA	2	10	2318302	2318311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017492	TTTTA	2	10	2323642	2323651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017492	TCTTA	2	10	2331764	2331773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
432	NC_017492	TCCCT	2	10	2333095	2333104	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
433	NC_017492	CACGA	2	10	2336603	2336612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
434	NC_017492	CTCTC	2	10	2337011	2337020	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
435	NC_017492	CATTT	2	10	2343462	2343471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
436	NC_017492	CAATC	2	10	2344647	2344656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
437	NC_017492	TCTAT	2	10	2344662	2344671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
438	NC_017492	TCTAT	2	10	2347477	2347486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
439	NC_017492	CTAAA	2	10	2347525	2347534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
440	NC_017492	AGGCA	2	10	2354314	2354323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
441	NC_017492	TTTTA	2	10	2355387	2355396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017492	CAAAA	2	10	2356189	2356198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017492	GCTTT	2	10	2360026	2360035	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
444	NC_017492	AGGCA	2	10	2361301	2361310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
445	NC_017492	GATAG	2	10	2367234	2367243	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
446	NC_017492	GATAA	2	10	2373901	2373910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017492	CTTAT	2	10	2403494	2403503	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
448	NC_017492	TTATT	2	10	2405348	2405357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017492	ATTTT	2	10	2406281	2406290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017492	TAAAT	2	10	2406302	2406311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017492	TAAAA	2	10	2415191	2415200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017492	TTTTA	2	10	2416337	2416346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017492	AATTA	2	10	2417138	2417147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017492	ACCTT	2	10	2418747	2418756	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
455	NC_017492	TAAAA	2	10	2421606	2421615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017492	TTATG	2	10	2423203	2423212	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017492	TCCCT	2	10	2424108	2424117	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
458	NC_017492	CACGA	2	10	2427616	2427625	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
459	NC_017492	CTCTC	2	10	2428024	2428033	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
460	NC_017492	TAAAT	2	10	2429007	2429016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017492	AAAAC	2	10	2440123	2440132	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_017492	TAATA	2	10	2441519	2441528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017492	TAAAA	2	10	2441828	2441837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017492	AAAAT	2	10	2442648	2442657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017492	TCCCT	2	10	2447563	2447572	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
466	NC_017492	CACGA	2	10	2451071	2451080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
467	NC_017492	CTCTC	2	10	2451477	2451486	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
468	NC_017492	AATTA	2	10	2452464	2452473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017492	CTTTT	2	10	2452508	2452517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_017492	ATTTT	2	10	2452578	2452587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.