MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 1493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	GTCTT	2	10	4976	4985	0 %	60 %	20 %	20 %	385836972
2	NC_017492	ATGGT	2	10	13026	13035	20 %	40 %	40 %	0 %	385836978
3	NC_017492	ATTTT	2	10	15287	15296	20 %	80 %	0 %	0 %	385836980
4	NC_017492	TGCGA	2	10	16542	16551	20 %	20 %	40 %	20 %	385836980
5	NC_017492	TACTT	2	10	17187	17196	20 %	60 %	0 %	20 %	385836980
6	NC_017492	TGATT	2	10	19254	19263	20 %	60 %	20 %	0 %	385836984
7	NC_017492	TTTGG	2	10	22608	22617	0 %	60 %	40 %	0 %	385836987
8	NC_017492	TGGTA	2	10	24549	24558	20 %	40 %	40 %	0 %	385836988
9	NC_017492	TGGCT	2	10	26547	26556	0 %	40 %	40 %	20 %	385836989
10	NC_017492	ATTTT	2	10	26642	26651	20 %	80 %	0 %	0 %	385836989
11	NC_017492	AGAGA	2	10	27560	27569	60 %	0 %	40 %	0 %	385836990
12	NC_017492	TAGAG	2	10	38075	38084	40 %	20 %	40 %	0 %	385837001
13	NC_017492	TAAGC	2	10	38821	38830	40 %	20 %	20 %	20 %	385837002
14	NC_017492	TGGAT	2	10	39384	39393	20 %	40 %	40 %	0 %	385837003
15	NC_017492	AAAAG	2	10	39850	39859	80 %	0 %	20 %	0 %	385837004
16	NC_017492	TCAAA	2	10	40018	40027	60 %	20 %	0 %	20 %	385837004
17	NC_017492	GTGAG	2	10	41594	41603	20 %	20 %	60 %	0 %	385837005
18	NC_017492	TTTAT	2	10	42635	42644	20 %	80 %	0 %	0 %	385837006
19	NC_017492	AATTA	2	10	43009	43018	60 %	40 %	0 %	0 %	385837006
20	NC_017492	ATTAT	2	10	43282	43291	40 %	60 %	0 %	0 %	385837006
21	NC_017492	AATCA	2	10	45122	45131	60 %	20 %	0 %	20 %	385837008
22	NC_017492	TTTAA	2	10	45717	45726	40 %	60 %	0 %	0 %	385837008
23	NC_017492	GCTTG	2	10	48803	48812	0 %	40 %	40 %	20 %	385837011
24	NC_017492	TCCAT	2	10	49154	49163	20 %	40 %	0 %	40 %	385837011
25	NC_017492	TTGTA	2	10	52936	52945	20 %	60 %	20 %	0 %	385837016
26	NC_017492	GCTTC	2	10	53737	53746	0 %	40 %	20 %	40 %	385837017
27	NC_017492	AATTG	2	10	54118	54127	40 %	40 %	20 %	0 %	385837018
28	NC_017492	AAAAT	2	10	55800	55809	80 %	20 %	0 %	0 %	385837020
29	NC_017492	ATTAA	2	10	58782	58791	60 %	40 %	0 %	0 %	385837024
30	NC_017492	CAAGC	2	10	63667	63676	40 %	0 %	20 %	40 %	385837028
31	NC_017492	CCATT	2	10	65907	65916	20 %	40 %	0 %	40 %	385837030
32	NC_017492	CAAGA	2	10	67131	67140	60 %	0 %	20 %	20 %	385837032
33	NC_017492	TCCAA	2	10	67286	67295	40 %	20 %	0 %	40 %	385837032
34	NC_017492	TGAGT	2	10	70996	71005	20 %	40 %	40 %	0 %	385837035
35	NC_017492	AATTT	2	10	73937	73946	40 %	60 %	0 %	0 %	385837039
36	NC_017492	ACTGG	2	10	74768	74777	20 %	20 %	40 %	20 %	385837040
37	NC_017492	AATTA	2	10	76236	76245	60 %	40 %	0 %	0 %	385837042
38	NC_017492	TATTT	2	10	77134	77143	20 %	80 %	0 %	0 %	385837042
39	NC_017492	CAAAC	2	10	77241	77250	60 %	0 %	0 %	40 %	385837042
40	NC_017492	TTTTC	2	10	78943	78952	0 %	80 %	0 %	20 %	385837044
41	NC_017492	ATGCT	2	10	79084	79093	20 %	40 %	20 %	20 %	385837044
42	NC_017492	AAGAG	2	10	79573	79582	60 %	0 %	40 %	0 %	385837045
43	NC_017492	CTTTA	2	10	80149	80158	20 %	60 %	0 %	20 %	385837046
44	NC_017492	TCCGG	2	10	81263	81272	0 %	20 %	40 %	40 %	385837047
45	NC_017492	ATTGG	2	10	83486	83495	20 %	40 %	40 %	0 %	385837049
46	NC_017492	TTCGT	2	10	83522	83531	0 %	60 %	20 %	20 %	385837049
47	NC_017492	AAAAT	2	10	87187	87196	80 %	20 %	0 %	0 %	385837052
48	NC_017492	AGGTT	2	10	87855	87864	20 %	40 %	40 %	0 %	385837053
49	NC_017492	CTCAA	2	10	87944	87953	40 %	20 %	0 %	40 %	385837053
50	NC_017492	GAGTA	2	10	89269	89278	40 %	20 %	40 %	0 %	385837054
51	NC_017492	ACTGA	2	10	93501	93510	40 %	20 %	20 %	20 %	385837058
52	NC_017492	TTTGA	2	10	97920	97929	20 %	60 %	20 %	0 %	385837063
53	NC_017492	ATAAA	2	10	98055	98064	80 %	20 %	0 %	0 %	385837063
54	NC_017492	ATATG	2	10	100007	100016	40 %	40 %	20 %	0 %	385837065
55	NC_017492	TTAAA	2	10	105164	105173	60 %	40 %	0 %	0 %	385837071
56	NC_017492	ATTTT	2	10	105474	105483	20 %	80 %	0 %	0 %	385837072
57	NC_017492	TGCTT	2	10	107523	107532	0 %	60 %	20 %	20 %	385837073
58	NC_017492	TTCTG	2	10	108529	108538	0 %	60 %	20 %	20 %	385837075
59	NC_017492	CTTTA	2	10	111003	111012	20 %	60 %	0 %	20 %	385837077
60	NC_017492	TTGTA	2	10	111177	111186	20 %	60 %	20 %	0 %	385837078
61	NC_017492	ATTTT	2	10	111816	111825	20 %	80 %	0 %	0 %	385837078
62	NC_017492	GCTTC	2	10	111978	111987	0 %	40 %	20 %	40 %	385837079
63	NC_017492	TAGAG	2	10	115193	115202	40 %	20 %	40 %	0 %	385837083
64	NC_017492	TTTTA	2	10	116889	116898	20 %	80 %	0 %	0 %	385837086
65	NC_017492	TTATT	2	10	119949	119958	20 %	80 %	0 %	0 %	385837090
66	NC_017492	TTGCT	2	10	121436	121445	0 %	60 %	20 %	20 %	385837091
67	NC_017492	ACGAG	2	10	122767	122776	40 %	0 %	40 %	20 %	385837093
68	NC_017492	TGAGT	2	10	122810	122819	20 %	40 %	40 %	0 %	385837093
69	NC_017492	GCAGA	2	10	123425	123434	40 %	0 %	40 %	20 %	385837094
70	NC_017492	TTTTA	2	10	125979	125988	20 %	80 %	0 %	0 %	385837097
71	NC_017492	AAGCT	2	10	126152	126161	40 %	20 %	20 %	20 %	385837097
72	NC_017492	TGGAT	2	10	127147	127156	20 %	40 %	40 %	0 %	385837098
73	NC_017492	CAAGA	2	10	130533	130542	60 %	0 %	20 %	20 %	385837103
74	NC_017492	AAAGA	2	10	135023	135032	80 %	0 %	20 %	0 %	385837107
75	NC_017492	AGAGT	2	10	135433	135442	40 %	20 %	40 %	0 %	385837108
76	NC_017492	TGGTT	2	10	136106	136115	0 %	60 %	40 %	0 %	385837108
77	NC_017492	ATTTG	2	10	136441	136450	20 %	60 %	20 %	0 %	385837109
78	NC_017492	TCGTA	2	10	139173	139182	20 %	40 %	20 %	20 %	385837112
79	NC_017492	GATTT	2	10	143027	143036	20 %	60 %	20 %	0 %	385837115
80	NC_017492	TCAAA	2	10	145457	145466	60 %	20 %	0 %	20 %	385837118
81	NC_017492	TCGCA	2	10	149085	149094	20 %	20 %	20 %	40 %	385837122
82	NC_017492	TTTTA	2	10	152092	152101	20 %	80 %	0 %	0 %	385837126
83	NC_017492	CTCTA	2	10	153249	153258	20 %	40 %	0 %	40 %	385837127
84	NC_017492	TGGAT	2	10	157090	157099	20 %	40 %	40 %	0 %	385837130
85	NC_017492	GAAGG	2	10	157169	157178	40 %	0 %	60 %	0 %	385837130
86	NC_017492	AATTA	2	10	158071	158080	60 %	40 %	0 %	0 %	385837130
87	NC_017492	ATTTT	2	10	158977	158986	20 %	80 %	0 %	0 %	385837131
88	NC_017492	TTTTC	2	10	160281	160290	0 %	80 %	0 %	20 %	385837132
89	NC_017492	CCAAA	2	10	160826	160835	60 %	0 %	0 %	40 %	385837132
90	NC_017492	TGGCT	2	10	161790	161799	0 %	40 %	40 %	20 %	385837134
91	NC_017492	TCAAA	2	10	162368	162377	60 %	20 %	0 %	20 %	385837135
92	NC_017492	TTTTA	2	10	162641	162650	20 %	80 %	0 %	0 %	385837135
93	NC_017492	CAGGT	2	10	164843	164852	20 %	20 %	40 %	20 %	385837138
94	NC_017492	GTTTG	2	10	164904	164913	0 %	60 %	40 %	0 %	385837138
95	NC_017492	TTATT	2	10	166358	166367	20 %	80 %	0 %	0 %	385837140
96	NC_017492	TAAAA	2	10	168205	168214	80 %	20 %	0 %	0 %	385837143
97	NC_017492	TTTTC	2	10	172650	172659	0 %	80 %	0 %	20 %	385837150
98	NC_017492	TTAGG	2	10	172993	173002	20 %	40 %	40 %	0 %	385837150
99	NC_017492	TTAAC	2	10	175911	175920	40 %	40 %	0 %	20 %	385837154
100	NC_017492	AAACA	2	10	176667	176676	80 %	0 %	0 %	20 %	385837154
101	NC_017492	GAAAT	2	10	177423	177432	60 %	20 %	20 %	0 %	385837154
102	NC_017492	TTCAC	2	10	179793	179802	20 %	40 %	0 %	40 %	385837154
103	NC_017492	TTCAC	2	10	180078	180087	20 %	40 %	0 %	40 %	385837154
104	NC_017492	AAGAA	2	10	181146	181155	80 %	0 %	20 %	0 %	385837154
105	NC_017492	AATAT	2	10	182860	182869	60 %	40 %	0 %	0 %	385837155
106	NC_017492	AAAGA	2	10	182997	183006	80 %	0 %	20 %	0 %	385837155
107	NC_017492	AAATA	2	10	183247	183256	80 %	20 %	0 %	0 %	385837155
108	NC_017492	CTTCC	2	10	183824	183833	0 %	40 %	0 %	60 %	385837156
109	NC_017492	GAAGT	2	10	184514	184523	40 %	20 %	40 %	0 %	385837158
110	NC_017492	ATGGA	2	10	187027	187036	40 %	20 %	40 %	0 %	385837161
111	NC_017492	TACAG	2	10	187362	187371	40 %	20 %	20 %	20 %	385837161
112	NC_017492	ATTTT	2	10	193276	193285	20 %	80 %	0 %	0 %	385837169
113	NC_017492	TAATT	2	10	197774	197783	40 %	60 %	0 %	0 %	385837174
114	NC_017492	TACAA	2	10	198716	198725	60 %	20 %	0 %	20 %	385837175
115	NC_017492	TTTTA	2	10	199476	199485	20 %	80 %	0 %	0 %	385837176
116	NC_017492	TGATT	2	10	201094	201103	20 %	60 %	20 %	0 %	385837178
117	NC_017492	GATTG	2	10	202486	202495	20 %	40 %	40 %	0 %	385837179
118	NC_017492	TGGTT	2	10	202624	202633	0 %	60 %	40 %	0 %	385837179
119	NC_017492	AGCCA	2	10	204590	204599	40 %	0 %	20 %	40 %	385837181
120	NC_017492	TTGGC	2	10	205485	205494	0 %	40 %	40 %	20 %	385837181
121	NC_017492	AAAGT	2	10	206361	206370	60 %	20 %	20 %	0 %	385837183
122	NC_017492	AATTT	2	10	206520	206529	40 %	60 %	0 %	0 %	385837183
123	NC_017492	CCAAA	2	10	211623	211632	60 %	0 %	0 %	40 %	385837189
124	NC_017492	GTAAA	2	10	213820	213829	60 %	20 %	20 %	0 %	385837192
125	NC_017492	AAATT	2	10	214974	214983	60 %	40 %	0 %	0 %	385837193
126	NC_017492	TCCTT	2	10	222160	222169	0 %	60 %	0 %	40 %	385837201
127	NC_017492	AAAAT	2	10	222175	222184	80 %	20 %	0 %	0 %	385837201
128	NC_017492	ACTAA	2	10	222214	222223	60 %	20 %	0 %	20 %	385837201
129	NC_017492	AAAAG	2	10	222714	222723	80 %	0 %	20 %	0 %	385837201
130	NC_017492	AAACC	2	10	226752	226761	60 %	0 %	0 %	40 %	385837204
131	NC_017492	TGATT	2	10	231820	231829	20 %	60 %	20 %	0 %	385837212
132	NC_017492	CTTAT	2	10	232062	232071	20 %	60 %	0 %	20 %	385837212
133	NC_017492	TTATG	2	10	234214	234223	20 %	60 %	20 %	0 %	385837214
134	NC_017492	AAAGC	2	10	235816	235825	60 %	0 %	20 %	20 %	385837215
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