MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 7149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	CTTT	2	8	254	261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017492	TGTC	2	8	453	460	0 %	50 %	25 %	25 %	385836970
3	NC_017492	CTTG	2	8	481	488	0 %	50 %	25 %	25 %	385836970
4	NC_017492	AATC	2	8	629	636	50 %	25 %	0 %	25 %	385836970
5	NC_017492	ATGC	2	8	842	849	25 %	25 %	25 %	25 %	385836970
6	NC_017492	ACTT	2	8	987	994	25 %	50 %	0 %	25 %	385836970
7	NC_017492	TCAA	2	8	2021	2028	50 %	25 %	0 %	25 %	385836971
8	NC_017492	GAAA	2	8	2290	2297	75 %	0 %	25 %	0 %	385836971
9	NC_017492	TTGA	2	8	2594	2601	25 %	50 %	25 %	0 %	385836971
10	NC_017492	CAAC	2	8	2724	2731	50 %	0 %	0 %	50 %	385836971
11	NC_017492	TATC	2	8	2844	2851	25 %	50 %	0 %	25 %	385836971
12	NC_017492	TGAT	2	8	2871	2878	25 %	50 %	25 %	0 %	385836971
13	NC_017492	GTAC	2	8	2993	3000	25 %	25 %	25 %	25 %	385836971
14	NC_017492	AATT	2	8	3002	3009	50 %	50 %	0 %	0 %	385836971
15	NC_017492	GAAA	2	8	3241	3248	75 %	0 %	25 %	0 %	385836972
16	NC_017492	TTAT	2	8	3722	3729	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
17	NC_017492	AAAT	2	8	3850	3857	75 %	25 %	0 %	0 %	385836972
18	NC_017492	GAAA	2	8	4135	4142	75 %	0 %	25 %	0 %	385836972
19	NC_017492	GACT	2	8	5527	5534	25 %	25 %	25 %	25 %	385836972
20	NC_017492	TATT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
21	NC_017492	TCAT	2	8	5857	5864	25 %	50 %	0 %	25 %	385836972
22	NC_017492	TTTA	2	8	5964	5971	25 %	75 %	0 %	0 %	385836972
23	NC_017492	AACC	2	8	5981	5988	50 %	0 %	0 %	50 %	385836972
24	NC_017492	CAAT	2	8	6219	6226	50 %	25 %	0 %	25 %	385836972
25	NC_017492	TCAG	2	8	6256	6263	25 %	25 %	25 %	25 %	385836972
26	NC_017492	ATGA	2	8	6329	6336	50 %	25 %	25 %	0 %	385836972
27	NC_017492	TTAT	2	8	6848	6855	25 %	75 %	0 %	0 %	385836973
28	NC_017492	TGAT	2	8	7606	7613	25 %	50 %	25 %	0 %	385836973
29	NC_017492	GAAA	2	8	7799	7806	75 %	0 %	25 %	0 %	385836973
30	NC_017492	ATCT	2	8	8266	8273	25 %	50 %	0 %	25 %	385836973
31	NC_017492	TTTG	2	8	8297	8304	0 %	75 %	25 %	0 %	385836973
32	NC_017492	TCAA	2	8	8449	8456	50 %	25 %	0 %	25 %	385836973
33	NC_017492	GGCA	2	8	8575	8582	25 %	0 %	50 %	25 %	385836973
34	NC_017492	TAAA	2	8	8950	8957	75 %	25 %	0 %	0 %	385836973
35	NC_017492	GGAA	2	8	9104	9111	50 %	0 %	50 %	0 %	385836973
36	NC_017492	AGGT	2	8	9439	9446	25 %	25 %	50 %	0 %	385836973
37	NC_017492	CAGT	2	8	9457	9464	25 %	25 %	25 %	25 %	385836973
38	NC_017492	ATTT	2	8	9583	9590	25 %	75 %	0 %	0 %	385836973
39	NC_017492	AAAT	2	8	10333	10340	75 %	25 %	0 %	0 %	385836975
40	NC_017492	TGAG	2	8	10767	10774	25 %	25 %	50 %	0 %	385836975
41	NC_017492	TAAT	2	8	11069	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017492	AAAT	2	8	11360	11367	75 %	25 %	0 %	0 %	385836976
43	NC_017492	AATT	2	8	11503	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	385836976
44	NC_017492	ACTT	2	8	11964	11971	25 %	50 %	0 %	25 %	385836976
45	NC_017492	GTGC	2	8	11991	11998	0 %	25 %	50 %	25 %	385836976
46	NC_017492	CAAA	2	8	12282	12289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017492	AAGG	2	8	12315	12322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017492	TCAG	2	8	12373	12380	25 %	25 %	25 %	25 %	385836977
49	NC_017492	ATCT	2	8	12416	12423	25 %	50 %	0 %	25 %	385836977
50	NC_017492	GGTT	2	8	12587	12594	0 %	50 %	50 %	0 %	385836977
51	NC_017492	TTGT	2	8	13092	13099	0 %	75 %	25 %	0 %	385836978
52	NC_017492	TTTA	2	8	13188	13195	25 %	75 %	0 %	0 %	385836978
53	NC_017492	GCTA	2	8	13520	13527	25 %	25 %	25 %	25 %	385836978
54	NC_017492	TATG	2	8	13543	13550	25 %	50 %	25 %	0 %	385836978
55	NC_017492	TAGA	2	8	13885	13892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017492	TAAA	2	8	13946	13953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017492	ATGA	2	8	14239	14246	50 %	25 %	25 %	0 %	385836979
58	NC_017492	CATG	2	8	14310	14317	25 %	25 %	25 %	25 %	385836979
59	NC_017492	GCGT	2	8	14342	14349	0 %	25 %	50 %	25 %	385836979
60	NC_017492	TGAT	2	8	15911	15918	25 %	50 %	25 %	0 %	385836980
61	NC_017492	AGTA	2	8	16219	16226	50 %	25 %	25 %	0 %	385836980
62	NC_017492	TCAA	2	8	16453	16460	50 %	25 %	0 %	25 %	385836980
63	NC_017492	AACC	2	8	16971	16978	50 %	0 %	0 %	50 %	385836980
64	NC_017492	AAAC	2	8	17006	17013	75 %	0 %	0 %	25 %	385836980
65	NC_017492	TGAG	2	8	18029	18036	25 %	25 %	50 %	0 %	385836980
66	NC_017492	TAAA	2	8	18293	18300	75 %	25 %	0 %	0 %	385836981
67	NC_017492	CAAA	2	8	18382	18389	75 %	0 %	0 %	25 %	385836981
68	NC_017492	GAAT	2	8	19540	19547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017492	CTAT	2	8	19957	19964	25 %	50 %	0 %	25 %	385836985
70	NC_017492	AACT	2	8	20072	20079	50 %	25 %	0 %	25 %	385836985
71	NC_017492	AATA	2	8	20442	20449	75 %	25 %	0 %	0 %	385836985
72	NC_017492	TGCT	2	8	20512	20519	0 %	50 %	25 %	25 %	385836985
73	NC_017492	TGGT	2	8	20620	20627	0 %	50 %	50 %	0 %	385836985
74	NC_017492	GAGG	2	8	20652	20659	25 %	0 %	75 %	0 %	385836985
75	NC_017492	AATT	2	8	21351	21358	50 %	50 %	0 %	0 %	385836986
76	NC_017492	ATTT	2	8	21607	21614	25 %	75 %	0 %	0 %	385836986
77	NC_017492	CAAA	2	8	21617	21624	75 %	0 %	0 %	25 %	385836986
78	NC_017492	AGTA	2	8	21679	21686	50 %	25 %	25 %	0 %	385836986
79	NC_017492	ATTG	2	8	22311	22318	25 %	50 %	25 %	0 %	385836987
80	NC_017492	GAAG	2	8	22539	22546	50 %	0 %	50 %	0 %	385836987
81	NC_017492	TACT	2	8	22748	22755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017492	AATC	2	8	22999	23006	50 %	25 %	0 %	25 %	385836988
83	NC_017492	TGCT	2	8	23612	23619	0 %	50 %	25 %	25 %	385836988
84	NC_017492	ATCA	2	8	23748	23755	50 %	25 %	0 %	25 %	385836988
85	NC_017492	ATGG	2	8	23857	23864	25 %	25 %	50 %	0 %	385836988
86	NC_017492	AAAC	2	8	24024	24031	75 %	0 %	0 %	25 %	385836988
87	NC_017492	TGAA	2	8	24110	24117	50 %	25 %	25 %	0 %	385836988
88	NC_017492	AAGA	2	8	24208	24215	75 %	0 %	25 %	0 %	385836988
89	NC_017492	TCAA	2	8	24222	24229	50 %	25 %	0 %	25 %	385836988
90	NC_017492	CAAC	2	8	24382	24389	50 %	0 %	0 %	50 %	385836988
91	NC_017492	TGAT	2	8	24638	24645	25 %	50 %	25 %	0 %	385836988
92	NC_017492	GCGT	2	8	25335	25342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017492	TTTA	2	8	25977	25984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017492	TGCT	2	8	26214	26221	0 %	50 %	25 %	25 %	385836989
95	NC_017492	CAAT	2	8	26661	26668	50 %	25 %	0 %	25 %	385836989
96	NC_017492	TGGC	2	8	26907	26914	0 %	25 %	50 %	25 %	385836989
97	NC_017492	GATT	2	8	27875	27882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017492	AGGA	2	8	28097	28104	50 %	0 %	50 %	0 %	385836991
99	NC_017492	ATTG	2	8	28197	28204	25 %	50 %	25 %	0 %	385836991
100	NC_017492	AAGC	2	8	28471	28478	50 %	0 %	25 %	25 %	385836991
101	NC_017492	AAGA	2	8	28939	28946	75 %	0 %	25 %	0 %	385836991
102	NC_017492	GTAA	2	8	29095	29102	50 %	25 %	25 %	0 %	385836991
103	NC_017492	TTCA	2	8	29582	29589	25 %	50 %	0 %	25 %	385836991
104	NC_017492	ATCA	2	8	29936	29943	50 %	25 %	0 %	25 %	385836992
105	NC_017492	AATT	2	8	29968	29975	50 %	50 %	0 %	0 %	385836992
106	NC_017492	GCTG	2	8	30289	30296	0 %	25 %	50 %	25 %	385836992
107	NC_017492	TAAA	2	8	30466	30473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017492	AGTA	2	8	30479	30486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017492	AGAA	2	8	31246	31253	75 %	0 %	25 %	0 %	385836993
110	NC_017492	AGTC	2	8	31515	31522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017492	CGAA	2	8	31842	31849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017492	ACTA	2	8	32388	32395	50 %	25 %	0 %	25 %	385836994
113	NC_017492	TTTA	2	8	32538	32545	25 %	75 %	0 %	0 %	385836994
114	NC_017492	TTGT	2	8	32793	32800	0 %	75 %	25 %	0 %	385836994
115	NC_017492	ATGA	2	8	33306	33313	50 %	25 %	25 %	0 %	385836995
116	NC_017492	TCAG	2	8	33928	33935	25 %	25 %	25 %	25 %	385836995
117	NC_017492	CTAG	2	8	33987	33994	25 %	25 %	25 %	25 %	385836995
118	NC_017492	TTTG	2	8	34304	34311	0 %	75 %	25 %	0 %	385836995
119	NC_017492	ATAA	2	8	35465	35472	75 %	25 %	0 %	0 %	385836996
120	NC_017492	ATAA	2	8	35673	35680	75 %	25 %	0 %	0 %	385836997
121	NC_017492	ATTT	2	8	35747	35754	25 %	75 %	0 %	0 %	385836997
122	NC_017492	GGGA	2	8	35862	35869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017492	AAGA	2	8	36298	36305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017492	TAAA	2	8	36770	36777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017492	AGAA	2	8	36865	36872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017492	AATT	2	8	37034	37041	50 %	50 %	0 %	0 %	385836999
127	NC_017492	TATT	2	8	37091	37098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017492	GATG	2	8	37835	37842	25 %	25 %	50 %	0 %	385837000
129	NC_017492	TTTG	2	8	38416	38423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017492	AAGT	2	8	39473	39480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017492	TGAT	2	8	39512	39519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017492	TAAA	2	8	39523	39530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017492	GATA	2	8	39613	39620	50 %	25 %	25 %	0 %	385837004
134	NC_017492	ACCA	2	8	39629	39636	50 %	0 %	0 %	50 %	385837004
135	NC_017492	CATT	2	8	39679	39686	25 %	50 %	0 %	25 %	385837004
136	NC_017492	ATCA	2	8	39734	39741	50 %	25 %	0 %	25 %	385837004
137	NC_017492	ATCA	2	8	39761	39768	50 %	25 %	0 %	25 %	385837004
138	NC_017492	TTCG	2	8	39919	39926	0 %	50 %	25 %	25 %	385837004
139	NC_017492	ATTT	2	8	40078	40085	25 %	75 %	0 %	0 %	385837004
140	NC_017492	CATT	3	12	40110	40121	25 %	50 %	0 %	25 %	385837004
141	NC_017492	ATTT	2	8	40475	40482	25 %	75 %	0 %	0 %	385837004
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143	NC_017492	CATT	2	8	40903	40910	25 %	50 %	0 %	25 %	385837004
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