MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 1259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	CTTT	2	8	254	261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017492	TAAT	2	8	11069	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017492	CAAA	2	8	12282	12289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017492	AAGG	2	8	12315	12322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017492	TAGA	2	8	13885	13892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017492	TAAA	2	8	13946	13953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017492	GAAT	2	8	19540	19547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017492	TACT	2	8	22748	22755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017492	GCGT	2	8	25335	25342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017492	TTTA	2	8	25977	25984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017492	GATT	2	8	27875	27882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017492	TAAA	2	8	30466	30473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017492	AGTA	2	8	30479	30486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017492	AGTC	2	8	31515	31522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017492	CGAA	2	8	31842	31849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017492	GGGA	2	8	35862	35869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017492	AAGA	2	8	36298	36305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017492	TAAA	2	8	36770	36777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017492	AGAA	2	8	36865	36872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017492	TATT	2	8	37091	37098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017492	TTTG	2	8	38416	38423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017492	AAGT	2	8	39473	39480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017492	TGAT	2	8	39512	39519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017492	TAAA	2	8	39523	39530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017492	TAGA	2	8	41282	41289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017492	AAAT	2	8	41313	41320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017492	GGCT	2	8	41947	41954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017492	TTTA	2	8	46064	46071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017492	CATT	2	8	46182	46189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017492	TTAT	2	8	56861	56868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017492	AATG	2	8	62418	62425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017492	AAGC	2	8	64518	64525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017492	TAAA	2	8	64712	64719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017492	ATTT	2	8	65980	65987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017492	CATT	2	8	66710	66717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017492	TATT	2	8	66790	66797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017492	TAAA	2	8	68898	68905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017492	TTTG	2	8	71365	71372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017492	TTTA	2	8	71473	71480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017492	GTTT	2	8	71571	71578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017492	TTAT	2	8	72630	72637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017492	TAAA	2	8	74233	74240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017492	TGGT	2	8	76052	76059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017492	AAAG	2	8	77530	77537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017492	CTTT	2	8	79205	79212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017492	TTGC	2	8	79813	79820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017492	TATT	2	8	81661	81668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017492	TTCT	2	8	81786	81793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017492	TGGA	2	8	81843	81850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017492	TATT	2	8	81988	81995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017492	TTCT	2	8	82113	82120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017492	TATT	2	8	82315	82322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017492	AAAG	2	8	82382	82389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017492	TTCG	2	8	84752	84759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017492	ATTT	2	8	84932	84939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017492	TAAT	2	8	85004	85011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017492	TAAG	2	8	85239	85246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017492	ATGA	2	8	86637	86644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017492	ATCT	2	8	92181	92188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017492	TTAA	2	8	92250	92257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017492	TGCC	2	8	92284	92291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017492	AGTT	2	8	92424	92431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017492	AACG	2	8	92435	92442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017492	GAAA	2	8	92471	92478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017492	AGGG	2	8	105218	105225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017492	CAGT	2	8	106756	106763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017492	TTAT	2	8	107766	107773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017492	AATT	2	8	109774	109781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017492	TTTA	2	8	113502	113509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017492	AATT	2	8	113687	113694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017492	TATT	2	8	114209	114216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017492	TTGC	2	8	115795	115802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017492	TACA	2	8	115905	115912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017492	CAAT	2	8	118107	118114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017492	TTGA	2	8	118173	118180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017492	TAGA	2	8	118312	118319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017492	TCTA	2	8	118326	118333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017492	ATTT	2	8	118345	118352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017492	CTTT	2	8	118363	118370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017492	ATTT	2	8	118419	118426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017492	GTAA	2	8	119080	119087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017492	CAAA	2	8	119172	119179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017492	CAAT	2	8	124158	124165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017492	TTAT	2	8	124773	124780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017492	AGAA	2	8	125328	125335	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017492	TAAA	2	8	134896	134903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017492	CAGC	2	8	139951	139958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017492	CGAG	2	8	140034	140041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017492	ACAA	2	8	140764	140771	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017492	TTAT	2	8	140890	140897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017492	AATT	2	8	143516	143523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017492	AAAT	2	8	143568	143575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017492	AATT	2	8	143580	143587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017492	GATA	2	8	144866	144873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017492	GGGT	2	8	148232	148239	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017492	GGAA	2	8	149887	149894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017492	TGGA	2	8	150030	150037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017492	AATA	2	8	151028	151035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017492	CATC	2	8	153481	153488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017492	TTTA	2	8	156135	156142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017492	TACC	2	8	156152	156159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017492	TTAA	2	8	156551	156558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017492	TACA	2	8	156720	156727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017492	AATA	2	8	157004	157011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017492	CAAA	2	8	161657	161664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017492	AACA	2	8	161673	161680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017492	ATTA	2	8	164324	164331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017492	TTTA	2	8	166847	166854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017492	AATT	2	8	170898	170905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017492	TCTA	2	8	173916	173923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017492	TACC	2	8	174005	174012	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017492	ATTT	2	8	175471	175478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017492	AACA	2	8	181503	181510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017492	CAAA	2	8	181826	181833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017492	AAAG	2	8	182337	182344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017492	TAAA	2	8	182496	182503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017492	AGCA	2	8	191037	191044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017492	TATT	2	8	191122	191129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017492	CTTT	2	8	193105	193112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017492	AATT	2	8	194665	194672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017492	GAAA	2	8	197065	197072	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017492	TAAA	2	8	205868	205875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017492	TATT	2	8	209767	209774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017492	TTAT	2	8	211173	211180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017492	AGCA	2	8	212709	212716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017492	AGTG	2	8	214793	214800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017492	AATA	2	8	218897	218904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017492	ATAA	2	8	219757	219764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017492	ATGA	2	8	219777	219784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017492	ATCA	2	8	220945	220952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017492	AAAG	2	8	224266	224273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017492	CAAT	2	8	225072	225079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017492	TTAC	2	8	225082	225089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017492	TAAA	2	8	225544	225551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017492	TAAA	2	8	227728	227735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017492	TGAC	2	8	227743	227750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017492	TTTA	2	8	227884	227891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017492	TAAA	2	8	227909	227916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017492	ATTA	2	8	229121	229128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017492	TGAA	2	8	230366	230373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017492	ATTG	2	8	232567	232574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017492	AAAT	2	8	232575	232582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017492	TGAG	2	8	252942	252949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017492	AAGT	2	8	252998	253005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017492	TAAA	2	8	255737	255744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017492	AAAT	2	8	260583	260590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017492	TTAT	2	8	268282	268289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017492	TAAA	2	8	270926	270933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017492	ATTA	2	8	276364	276371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017492	AAAG	2	8	280975	280982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017492	ATTT	2	8	285236	285243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017492	TGAC	2	8	287002	287009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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