MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 1409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	GCAAG	2	10	3999	4008	40 %	0 %	40 %	20 %	385833943
2	NC_017491	GATCG	2	10	4189	4198	20 %	20 %	40 %	20 %	385833943
3	NC_017491	GAAAA	2	10	7921	7930	80 %	0 %	20 %	0 %	385833945
4	NC_017491	CCGGT	2	10	16082	16091	0 %	20 %	40 %	40 %	385833956
5	NC_017491	AGCAG	2	10	18111	18120	40 %	0 %	40 %	20 %	385833960
6	NC_017491	TGGTG	2	10	22568	22577	0 %	40 %	60 %	0 %	385833964
7	NC_017491	AACTG	2	10	25227	25236	40 %	20 %	20 %	20 %	385833966
8	NC_017491	GATGC	2	10	25477	25486	20 %	20 %	40 %	20 %	385833966
9	NC_017491	GAATA	2	10	25948	25957	60 %	20 %	20 %	0 %	385833968
10	NC_017491	AAAAC	2	10	28799	28808	80 %	0 %	0 %	20 %	385833969
11	NC_017491	ATGAC	2	10	29481	29490	40 %	20 %	20 %	20 %	385833970
12	NC_017491	CTGAT	2	10	30246	30255	20 %	40 %	20 %	20 %	385833971
13	NC_017491	TTTTC	2	10	37076	37085	0 %	80 %	0 %	20 %	385833979
14	NC_017491	GATCG	2	10	44153	44162	20 %	20 %	40 %	20 %	385833984
15	NC_017491	AAAGC	2	10	45589	45598	60 %	0 %	20 %	20 %	385833985
16	NC_017491	AGACA	2	10	48576	48585	60 %	0 %	20 %	20 %	385833985
17	NC_017491	AGCCA	2	10	48783	48792	40 %	0 %	20 %	40 %	385833985
18	NC_017491	ACAGT	2	10	49259	49268	40 %	20 %	20 %	20 %	385833985
19	NC_017491	CATCG	2	10	52576	52585	20 %	20 %	20 %	40 %	385833988
20	NC_017491	AGCCC	2	10	55605	55614	20 %	0 %	20 %	60 %	385833990
21	NC_017491	TTGGC	2	10	55688	55697	0 %	40 %	40 %	20 %	385833990
22	NC_017491	CCGAT	2	10	58915	58924	20 %	20 %	20 %	40 %	385833992
23	NC_017491	GGCGT	2	10	61392	61401	0 %	20 %	60 %	20 %	385833994
24	NC_017491	AAGTG	2	10	62769	62778	40 %	20 %	40 %	0 %	385833995
25	NC_017491	CATAG	2	10	68376	68385	40 %	20 %	20 %	20 %	385834000
26	NC_017491	CTGAG	2	10	71500	71509	20 %	20 %	40 %	20 %	385834003
27	NC_017491	TTGGA	2	10	71982	71991	20 %	40 %	40 %	0 %	385834003
28	NC_017491	AATGG	2	10	73757	73766	40 %	20 %	40 %	0 %	385834004
29	NC_017491	GATCC	2	10	76389	76398	20 %	20 %	20 %	40 %	385834007
30	NC_017491	GTGGC	2	10	77730	77739	0 %	20 %	60 %	20 %	385834009
31	NC_017491	GCCAA	2	10	78665	78674	40 %	0 %	20 %	40 %	385834010
32	NC_017491	AGTTC	2	10	78899	78908	20 %	40 %	20 %	20 %	385834011
33	NC_017491	AAACC	2	10	79127	79136	60 %	0 %	0 %	40 %	385834011
34	NC_017491	AGATC	2	10	81141	81150	40 %	20 %	20 %	20 %	385834013
35	NC_017491	CGTTT	2	10	84639	84648	0 %	60 %	20 %	20 %	385834016
36	NC_017491	TGGGA	2	10	88343	88352	20 %	20 %	60 %	0 %	385834020
37	NC_017491	GAAAA	2	10	89157	89166	80 %	0 %	20 %	0 %	385834022
38	NC_017491	GAATC	2	10	90412	90421	40 %	20 %	20 %	20 %	385834022
39	NC_017491	GTTTT	2	10	100483	100492	0 %	80 %	20 %	0 %	385834033
40	NC_017491	CGAAG	2	10	101205	101214	40 %	0 %	40 %	20 %	385834033
41	NC_017491	CCCAT	2	10	101221	101230	20 %	20 %	0 %	60 %	385834033
42	NC_017491	AGTCG	2	10	101359	101368	20 %	20 %	40 %	20 %	385834033
43	NC_017491	GCTTG	2	10	105168	105177	0 %	40 %	40 %	20 %	385834036
44	NC_017491	GTTTC	2	10	106100	106109	0 %	60 %	20 %	20 %	385834037
45	NC_017491	TGGGC	2	10	113619	113628	0 %	20 %	60 %	20 %	385834046
46	NC_017491	AGGGC	2	10	113672	113681	20 %	0 %	60 %	20 %	385834046
47	NC_017491	GCTTT	2	10	114326	114335	0 %	60 %	20 %	20 %	385834046
48	NC_017491	TAACG	2	10	117610	117619	40 %	20 %	20 %	20 %	385834049
49	NC_017491	CCTTG	2	10	118118	118127	0 %	40 %	20 %	40 %	385834050
50	NC_017491	TCTTT	2	10	120500	120509	0 %	80 %	0 %	20 %	385834053
51	NC_017491	ATTGT	2	10	122066	122075	20 %	60 %	20 %	0 %	385834054
52	NC_017491	AGCTG	2	10	125965	125974	20 %	20 %	40 %	20 %	385834058
53	NC_017491	AAAAC	2	10	126919	126928	80 %	0 %	0 %	20 %	385834059
54	NC_017491	CGTGG	2	10	132452	132461	0 %	20 %	60 %	20 %	385834063
55	NC_017491	ACCGC	2	10	134820	134829	20 %	0 %	20 %	60 %	385834065
56	NC_017491	GCATC	2	10	136249	136258	20 %	20 %	20 %	40 %	385834066
57	NC_017491	AGGCT	2	10	136502	136511	20 %	20 %	40 %	20 %	385834066
58	NC_017491	GAATC	2	10	137075	137084	40 %	20 %	20 %	20 %	385834067
59	NC_017491	TGGCG	2	10	137270	137279	0 %	20 %	60 %	20 %	385834067
60	NC_017491	AATCA	2	10	138808	138817	60 %	20 %	0 %	20 %	385834068
61	NC_017491	TTTTC	2	10	139125	139134	0 %	80 %	0 %	20 %	385834068
62	NC_017491	GTTTG	2	10	139865	139874	0 %	60 %	40 %	0 %	385834069
63	NC_017491	GGTCA	2	10	140380	140389	20 %	20 %	40 %	20 %	385834070
64	NC_017491	CAGCT	2	10	140603	140612	20 %	20 %	20 %	40 %	385834070
65	NC_017491	CAGCA	2	10	143183	143192	40 %	0 %	20 %	40 %	385834071
66	NC_017491	GGGAT	2	10	144507	144516	20 %	20 %	60 %	0 %	385834072
67	NC_017491	CTCAA	2	10	146654	146663	40 %	20 %	0 %	40 %	385834073
68	NC_017491	GTGCC	2	10	148264	148273	0 %	20 %	40 %	40 %	385834075
69	NC_017491	TAATT	2	10	151848	151857	40 %	60 %	0 %	0 %	385834078
70	NC_017491	ATCGG	2	10	152837	152846	20 %	20 %	40 %	20 %	385834079
71	NC_017491	GTTCG	2	10	154366	154375	0 %	40 %	40 %	20 %	385834081
72	NC_017491	CGGTG	2	10	155325	155334	0 %	20 %	60 %	20 %	385834082
73	NC_017491	TGCTG	2	10	164872	164881	0 %	40 %	40 %	20 %	385834091
74	NC_017491	ACGCT	2	10	164909	164918	20 %	20 %	20 %	40 %	385834091
75	NC_017491	ATTGC	2	10	167131	167140	20 %	40 %	20 %	20 %	385834093
76	NC_017491	GCAAT	2	10	168947	168956	40 %	20 %	20 %	20 %	385834095
77	NC_017491	GCGTG	2	10	171937	171946	0 %	20 %	60 %	20 %	385834100
78	NC_017491	GAAGA	2	10	172169	172178	60 %	0 %	40 %	0 %	385834100
79	NC_017491	CAAAC	2	10	173384	173393	60 %	0 %	0 %	40 %	385834101
80	NC_017491	AATTT	2	10	174120	174129	40 %	60 %	0 %	0 %	385834101
81	NC_017491	GGCAA	3	15	175200	175214	40 %	0 %	40 %	20 %	385834102
82	NC_017491	AATCA	2	10	175994	176003	60 %	20 %	0 %	20 %	385834103
83	NC_017491	TTGGT	2	10	177645	177654	0 %	60 %	40 %	0 %	385834106
84	NC_017491	TCACT	2	10	180881	180890	20 %	40 %	0 %	40 %	385834110
85	NC_017491	TTCAT	2	10	182431	182440	20 %	60 %	0 %	20 %	385834111
86	NC_017491	TCGAC	2	10	182908	182917	20 %	20 %	20 %	40 %	385834111
87	NC_017491	CAAGC	2	10	185918	185927	40 %	0 %	20 %	40 %	385834114
88	NC_017491	CACAA	2	10	190860	190869	60 %	0 %	0 %	40 %	385834119
89	NC_017491	AATAA	2	10	191309	191318	80 %	20 %	0 %	0 %	385834120
90	NC_017491	GTGAT	2	10	192486	192495	20 %	40 %	40 %	0 %	385834120
91	NC_017491	TGGTC	2	10	193717	193726	0 %	40 %	40 %	20 %	385834122
92	NC_017491	TTCGG	2	10	195929	195938	0 %	40 %	40 %	20 %	385834123
93	NC_017491	GGCCG	2	10	196777	196786	0 %	0 %	60 %	40 %	385834124
94	NC_017491	ATGCG	2	10	198953	198962	20 %	20 %	40 %	20 %	385834126
95	NC_017491	GCCGA	2	10	199543	199552	20 %	0 %	40 %	40 %	385834127
96	NC_017491	CCGTT	2	10	199616	199625	0 %	40 %	20 %	40 %	385834127
97	NC_017491	TTGTT	2	10	203200	203209	0 %	80 %	20 %	0 %	385834133
98	NC_017491	CAGCC	2	10	209353	209362	20 %	0 %	20 %	60 %	385834138
99	NC_017491	GCTAT	2	10	210550	210559	20 %	40 %	20 %	20 %	385834139
100	NC_017491	GACGG	2	10	210917	210926	20 %	0 %	60 %	20 %	385834140
101	NC_017491	TTATT	2	10	211104	211113	20 %	80 %	0 %	0 %	385834140
102	NC_017491	CAGAT	2	10	212840	212849	40 %	20 %	20 %	20 %	385834142
103	NC_017491	TCTTT	2	10	217355	217364	0 %	80 %	0 %	20 %	385834147
104	NC_017491	CAAAG	2	10	223014	223023	60 %	0 %	20 %	20 %	385834154
105	NC_017491	TTCAT	2	10	223633	223642	20 %	60 %	0 %	20 %	385834155
106	NC_017491	TGATC	2	10	226354	226363	20 %	40 %	20 %	20 %	385834161
107	NC_017491	GTTGC	2	10	231153	231162	0 %	40 %	40 %	20 %	385834169
108	NC_017491	AGAGA	2	10	236353	236362	60 %	0 %	40 %	0 %	385834177
109	NC_017491	CGATT	2	10	236797	236806	20 %	40 %	20 %	20 %	385834178
110	NC_017491	AAAGC	2	10	244542	244551	60 %	0 %	20 %	20 %	385834187
111	NC_017491	TCCGG	2	10	244619	244628	0 %	20 %	40 %	40 %	385834187
112	NC_017491	CGAAC	2	10	244715	244724	40 %	0 %	20 %	40 %	385834187
113	NC_017491	GGTTT	2	10	245861	245870	0 %	60 %	40 %	0 %	385834188
114	NC_017491	ACGGT	2	10	248604	248613	20 %	20 %	40 %	20 %	385834192
115	NC_017491	ACCGT	2	10	251626	251635	20 %	20 %	20 %	40 %	385834195
116	NC_017491	GCATC	2	10	251741	251750	20 %	20 %	20 %	40 %	385834195
117	NC_017491	CGGTT	2	10	255943	255952	0 %	40 %	40 %	20 %	385834199
118	NC_017491	AAATG	2	10	259912	259921	60 %	20 %	20 %	0 %	385834202
119	NC_017491	AGTCA	2	10	260013	260022	40 %	20 %	20 %	20 %	385834202
120	NC_017491	GGTTA	2	10	265064	265073	20 %	40 %	40 %	0 %	385834208
121	NC_017491	AATCT	2	10	265448	265457	40 %	40 %	0 %	20 %	385834208
122	NC_017491	TTTGA	2	10	267203	267212	20 %	60 %	20 %	0 %	385834210
123	NC_017491	CCGGT	2	10	267600	267609	0 %	20 %	40 %	40 %	385834210
124	NC_017491	CATTT	2	10	275089	275098	20 %	60 %	0 %	20 %	385834217
125	NC_017491	AAAGA	2	10	277937	277946	80 %	0 %	20 %	0 %	385834219
126	NC_017491	GTGGA	2	10	278157	278166	20 %	20 %	60 %	0 %	385834219
127	NC_017491	GACCA	2	10	279287	279296	40 %	0 %	20 %	40 %	385834221
128	NC_017491	AGCTT	2	10	280188	280197	20 %	40 %	20 %	20 %	385834221
129	NC_017491	CGGCA	2	10	282827	282836	20 %	0 %	40 %	40 %	385834224
130	NC_017491	TGATG	2	10	283394	283403	20 %	40 %	40 %	0 %	385834225
131	NC_017491	GGGAT	2	10	283409	283418	20 %	20 %	60 %	0 %	385834225
132	NC_017491	AATGA	2	10	287195	287204	60 %	20 %	20 %	0 %	385834230
133	NC_017491	AGGTG	2	10	289429	289438	20 %	20 %	60 %	0 %	385834231
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