MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 6175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TTTA	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	385833939
2	NC_017491	TCCA	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	385833939
3	NC_017491	GCCT	2	8	909	916	0 %	25 %	25 %	50 %	385833939
4	NC_017491	ATAG	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	385833941
5	NC_017491	TGAT	2	8	3756	3763	25 %	50 %	25 %	0 %	385833942
6	NC_017491	TTTG	2	8	4242	4249	0 %	75 %	25 %	0 %	385833943
7	NC_017491	AAGA	2	8	5060	5067	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
8	NC_017491	AAGA	2	8	5081	5088	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
9	NC_017491	GCCA	2	8	6830	6837	25 %	0 %	25 %	50 %	385833944
10	NC_017491	ACGT	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	385833945
11	NC_017491	ATGA	2	8	7231	7238	50 %	25 %	25 %	0 %	385833945
12	NC_017491	GATT	2	8	7503	7510	25 %	50 %	25 %	0 %	385833945
13	NC_017491	TATT	2	8	8911	8918	25 %	75 %	0 %	0 %	385833945
14	NC_017491	GCAC	2	8	9068	9075	25 %	0 %	25 %	50 %	385833945
15	NC_017491	CGAA	2	8	10465	10472	50 %	0 %	25 %	25 %	385833947
16	NC_017491	GCCG	2	8	11760	11767	0 %	0 %	50 %	50 %	385833949
17	NC_017491	CTGG	2	8	11843	11850	0 %	25 %	50 %	25 %	385833949
18	NC_017491	TTCA	2	8	12505	12512	25 %	50 %	0 %	25 %	385833951
19	NC_017491	TTGG	2	8	12632	12639	0 %	50 %	50 %	0 %	385833951
20	NC_017491	AGCG	2	8	13297	13304	25 %	0 %	50 %	25 %	385833952
21	NC_017491	GGAC	2	8	13764	13771	25 %	0 %	50 %	25 %	385833954
22	NC_017491	TGAA	2	8	13815	13822	50 %	25 %	25 %	0 %	385833954
23	NC_017491	TTTG	2	8	14020	14027	0 %	75 %	25 %	0 %	385833954
24	NC_017491	TCAA	2	8	14040	14047	50 %	25 %	0 %	25 %	385833954
25	NC_017491	TCGG	2	8	14626	14633	0 %	25 %	50 %	25 %	385833955
26	NC_017491	CTGG	2	8	15664	15671	0 %	25 %	50 %	25 %	385833955
27	NC_017491	CAAT	2	8	16245	16252	50 %	25 %	0 %	25 %	385833956
28	NC_017491	TGTT	2	8	16292	16299	0 %	75 %	25 %	0 %	385833956
29	NC_017491	TTTA	2	8	16726	16733	25 %	75 %	0 %	0 %	385833956
30	NC_017491	GTTT	2	8	17437	17444	0 %	75 %	25 %	0 %	385833958
31	NC_017491	AAGA	2	8	17681	17688	75 %	0 %	25 %	0 %	385833958
32	NC_017491	CAAC	2	8	18897	18904	50 %	0 %	0 %	50 %	385833961
33	NC_017491	TACA	2	8	19548	19555	50 %	25 %	0 %	25 %	385833962
34	NC_017491	TAAA	2	8	20216	20223	75 %	25 %	0 %	0 %	385833962
35	NC_017491	GAAA	2	8	20437	20444	75 %	0 %	25 %	0 %	385833963
36	NC_017491	TTGA	2	8	20611	20618	25 %	50 %	25 %	0 %	385833963
37	NC_017491	GCTG	2	8	20827	20834	0 %	25 %	50 %	25 %	385833963
38	NC_017491	ATCA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	0 %	25 %	385833963
39	NC_017491	TTGT	2	8	21913	21920	0 %	75 %	25 %	0 %	385833964
40	NC_017491	GTTG	2	8	22042	22049	0 %	50 %	50 %	0 %	385833964
41	NC_017491	GGCA	2	8	22466	22473	25 %	0 %	50 %	25 %	385833964
42	NC_017491	AGTT	2	8	22918	22925	25 %	50 %	25 %	0 %	385833964
43	NC_017491	GACG	2	8	23768	23775	25 %	0 %	50 %	25 %	385833965
44	NC_017491	TGCC	2	8	24614	24621	0 %	25 %	25 %	50 %	385833966
45	NC_017491	GTTG	2	8	24765	24772	0 %	50 %	50 %	0 %	385833966
46	NC_017491	CTTT	2	8	25241	25248	0 %	75 %	0 %	25 %	385833966
47	NC_017491	ACGA	2	8	26311	26318	50 %	0 %	25 %	25 %	385833968
48	NC_017491	TGAA	2	8	26916	26923	50 %	25 %	25 %	0 %	385833968
49	NC_017491	GGCA	2	8	27547	27554	25 %	0 %	50 %	25 %	385833968
50	NC_017491	CAGG	2	8	27762	27769	25 %	0 %	50 %	25 %	385833968
51	NC_017491	GATT	2	8	28023	28030	25 %	50 %	25 %	0 %	385833968
52	NC_017491	TGAC	2	8	28125	28132	25 %	25 %	25 %	25 %	385833968
53	NC_017491	AGCC	2	8	28740	28747	25 %	0 %	25 %	50 %	385833969
54	NC_017491	ATCC	2	8	28900	28907	25 %	25 %	0 %	50 %	385833969
55	NC_017491	GTCC	2	8	29588	29595	0 %	25 %	25 %	50 %	385833970
56	NC_017491	GAAA	2	8	29833	29840	75 %	0 %	25 %	0 %	385833971
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58	NC_017491	CCGG	2	8	30334	30341	0 %	0 %	50 %	50 %	385833971
59	NC_017491	CTTA	2	8	30749	30756	25 %	50 %	0 %	25 %	385833972
60	NC_017491	CAAT	2	8	31642	31649	50 %	25 %	0 %	25 %	385833973
61	NC_017491	AACC	2	8	31750	31757	50 %	0 %	0 %	50 %	385833973
62	NC_017491	ATTT	2	8	32459	32466	25 %	75 %	0 %	0 %	385833974
63	NC_017491	GCGA	2	8	32485	32492	25 %	0 %	50 %	25 %	385833974
64	NC_017491	TTAT	2	8	32566	32573	25 %	75 %	0 %	0 %	385833974
65	NC_017491	TTCA	2	8	33142	33149	25 %	50 %	0 %	25 %	385833975
66	NC_017491	GATT	2	8	34764	34771	25 %	50 %	25 %	0 %	385833977
67	NC_017491	GCAG	2	8	34887	34894	25 %	0 %	50 %	25 %	385833977
68	NC_017491	CTGG	2	8	35193	35200	0 %	25 %	50 %	25 %	385833977
69	NC_017491	TTAT	2	8	35979	35986	25 %	75 %	0 %	0 %	385833978
70	NC_017491	TTGG	2	8	36034	36041	0 %	50 %	50 %	0 %	385833978
71	NC_017491	TGGG	2	8	37885	37892	0 %	25 %	75 %	0 %	385833980
72	NC_017491	AGAA	2	8	37984	37991	75 %	0 %	25 %	0 %	385833980
73	NC_017491	AAAT	2	8	38210	38217	75 %	25 %	0 %	0 %	385833980
74	NC_017491	AGCT	2	8	39914	39921	25 %	25 %	25 %	25 %	385833981
75	NC_017491	AGTC	2	8	39944	39951	25 %	25 %	25 %	25 %	385833981
76	NC_017491	AAAC	2	8	40429	40436	75 %	0 %	0 %	25 %	385833981
77	NC_017491	CGAC	2	8	40777	40784	25 %	0 %	25 %	50 %	385833981
78	NC_017491	ATGA	2	8	42064	42071	50 %	25 %	25 %	0 %	385833982
79	NC_017491	GATC	2	8	42613	42620	25 %	25 %	25 %	25 %	385833982
80	NC_017491	CTGT	2	8	42732	42739	0 %	50 %	25 %	25 %	385833982
81	NC_017491	CTGC	2	8	42989	42996	0 %	25 %	25 %	50 %	385833983
82	NC_017491	TGGA	2	8	43395	43402	25 %	25 %	50 %	0 %	385833984
83	NC_017491	GCCG	2	8	43777	43784	0 %	0 %	50 %	50 %	385833984
84	NC_017491	AAAG	2	8	44287	44294	75 %	0 %	25 %	0 %	385833984
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88	NC_017491	TATC	2	8	46620	46627	25 %	50 %	0 %	25 %	385833985
89	NC_017491	TTGG	2	8	46766	46773	0 %	50 %	50 %	0 %	385833985
90	NC_017491	AGTA	2	8	46936	46943	50 %	25 %	25 %	0 %	385833985
91	NC_017491	TCAA	2	8	47128	47135	50 %	25 %	0 %	25 %	385833985
92	NC_017491	CGGG	2	8	47498	47505	0 %	0 %	75 %	25 %	385833985
93	NC_017491	CAGT	3	12	47709	47720	25 %	25 %	25 %	25 %	385833985
94	NC_017491	GGCA	2	8	48872	48879	25 %	0 %	50 %	25 %	385833985
95	NC_017491	GGCA	2	8	49088	49095	25 %	0 %	50 %	25 %	385833985
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97	NC_017491	AGCA	2	8	49751	49758	50 %	0 %	25 %	25 %	385833985
98	NC_017491	TTAC	2	8	50394	50401	25 %	50 %	0 %	25 %	385833986
99	NC_017491	TTAA	2	8	51010	51017	50 %	50 %	0 %	0 %	385833986
100	NC_017491	GGCT	2	8	51237	51244	0 %	25 %	50 %	25 %	385833987
101	NC_017491	TTGA	2	8	51433	51440	25 %	50 %	25 %	0 %	385833987
102	NC_017491	CGAT	2	8	51513	51520	25 %	25 %	25 %	25 %	385833987
103	NC_017491	CAGC	2	8	51651	51658	25 %	0 %	25 %	50 %	385833987
104	NC_017491	GCCA	2	8	51985	51992	25 %	0 %	25 %	50 %	385833987
105	NC_017491	CATT	2	8	52079	52086	25 %	50 %	0 %	25 %	385833987
106	NC_017491	GCTG	2	8	53056	53063	0 %	25 %	50 %	25 %	385833988
107	NC_017491	CATG	2	8	53921	53928	25 %	25 %	25 %	25 %	385833989
108	NC_017491	CAAG	2	8	55275	55282	50 %	0 %	25 %	25 %	385833990
109	NC_017491	ATCA	2	8	55524	55531	50 %	25 %	0 %	25 %	385833990
110	NC_017491	GTCA	2	8	55812	55819	25 %	25 %	25 %	25 %	385833990
111	NC_017491	GGCA	2	8	56025	56032	25 %	0 %	50 %	25 %	385833990
112	NC_017491	ATCA	2	8	56963	56970	50 %	25 %	0 %	25 %	385833991
113	NC_017491	TGGC	2	8	57328	57335	0 %	25 %	50 %	25 %	385833991
114	NC_017491	CTGG	2	8	57732	57739	0 %	25 %	50 %	25 %	385833991
115	NC_017491	ATCA	2	8	57911	57918	50 %	25 %	0 %	25 %	385833991
116	NC_017491	ACAA	2	8	58382	58389	75 %	0 %	0 %	25 %	385833992
117	NC_017491	ATTT	2	8	60825	60832	25 %	75 %	0 %	0 %	385833994
118	NC_017491	ATTA	2	8	61467	61474	50 %	50 %	0 %	0 %	385833994
119	NC_017491	GGCA	2	8	62096	62103	25 %	0 %	50 %	25 %	385833995
120	NC_017491	ATGG	2	8	63238	63245	25 %	25 %	50 %	0 %	385833995
121	NC_017491	CCAG	2	8	64517	64524	25 %	0 %	25 %	50 %	385833997
122	NC_017491	TTGG	2	8	64562	64569	0 %	50 %	50 %	0 %	385833997
123	NC_017491	ATGT	2	8	64674	64681	25 %	50 %	25 %	0 %	385833997
124	NC_017491	ATGA	2	8	64966	64973	50 %	25 %	25 %	0 %	385833998
125	NC_017491	GCTG	2	8	65691	65698	0 %	25 %	50 %	25 %	385833999
126	NC_017491	GTGA	2	8	65868	65875	25 %	25 %	50 %	0 %	385833999
127	NC_017491	AGCC	2	8	66014	66021	25 %	0 %	25 %	50 %	385833999
128	NC_017491	ATAA	2	8	67478	67485	75 %	25 %	0 %	0 %	385834000
129	NC_017491	GTAA	2	8	67512	67519	50 %	25 %	25 %	0 %	385834000
130	NC_017491	CAAC	2	8	67761	67768	50 %	0 %	0 %	50 %	385834000
131	NC_017491	AGTA	2	8	67975	67982	50 %	25 %	25 %	0 %	385834000
132	NC_017491	CAAA	2	8	68360	68367	75 %	0 %	0 %	25 %	385834000
133	NC_017491	AATA	2	8	68658	68665	75 %	25 %	0 %	0 %	385834001
134	NC_017491	TCGC	2	8	68936	68943	0 %	25 %	25 %	50 %	385834001
135	NC_017491	TTGA	2	8	68998	69005	25 %	50 %	25 %	0 %	385834001
136	NC_017491	TGTC	2	8	70053	70060	0 %	50 %	25 %	25 %	385834003
137	NC_017491	CAGC	2	8	70129	70136	25 %	0 %	25 %	50 %	385834003
138	NC_017491	AACG	2	8	70473	70480	50 %	0 %	25 %	25 %	385834003
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