MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 38632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TTA	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017491	GAG	2	6	150	155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017491	GTG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833939
4	NC_017491	TCA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833939
5	NC_017491	CAA	2	6	464	469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833939
6	NC_017491	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
7	NC_017491	CGG	2	6	613	618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
8	NC_017491	AAT	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833939
9	NC_017491	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833939
10	NC_017491	TTC	2	6	815	820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
11	NC_017491	AAG	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
12	NC_017491	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
13	NC_017491	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
14	NC_017491	CCG	2	6	986	991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833939
15	NC_017491	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
16	NC_017491	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
17	NC_017491	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833939
18	NC_017491	ACC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833939
19	NC_017491	ACG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017491	AGG	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017491	GCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
22	NC_017491	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
23	NC_017491	TTC	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833940
24	NC_017491	AAC	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
25	NC_017491	CAG	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
26	NC_017491	CAT	3	9	2283	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833940
27	NC_017491	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833940
28	NC_017491	AGC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
29	NC_017491	CGT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
30	NC_017491	GAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833940
31	NC_017491	CAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
32	NC_017491	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833941
33	NC_017491	ATG	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833941
34	NC_017491	TCC	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017491	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017491	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017491	GAT	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017491	TGG	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017491	CGA	3	9	3684	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833942
40	NC_017491	CAC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833942
41	NC_017491	GCG	2	6	3765	3770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833942
42	NC_017491	CGT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833942
43	NC_017491	GAT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833942
44	NC_017491	CAA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
45	NC_017491	ATT	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833943
46	NC_017491	TCA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
47	NC_017491	CGG	2	6	4294	4299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
48	NC_017491	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
49	NC_017491	TGC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
50	NC_017491	TGC	3	9	4518	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
51	NC_017491	CAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
52	NC_017491	AGC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
53	NC_017491	GAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833943
54	NC_017491	CAG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
55	NC_017491	CAC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833943
56	NC_017491	GAC	3	9	4926	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
57	NC_017491	ATC	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
58	NC_017491	GAG	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017491	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
60	NC_017491	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833944
61	NC_017491	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
62	NC_017491	CAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
63	NC_017491	GTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
64	NC_017491	GGT	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
65	NC_017491	CGG	2	6	5425	5430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
66	NC_017491	GTT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
67	NC_017491	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
68	NC_017491	TGA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
69	NC_017491	GCG	2	6	5723	5728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
70	NC_017491	GGC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
71	NC_017491	GAA	3	9	5791	5799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
72	NC_017491	CTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
73	NC_017491	GAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
74	NC_017491	GTT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
75	NC_017491	GGT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
76	NC_017491	CAA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
77	NC_017491	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833944
78	NC_017491	GCT	2	6	6251	6256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
79	NC_017491	AAG	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
80	NC_017491	ACA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
81	NC_017491	GGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
82	NC_017491	GAA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
83	NC_017491	ATC	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
84	NC_017491	GTT	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
85	NC_017491	ATG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
86	NC_017491	GCC	2	6	6775	6780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833944
87	NC_017491	ACC	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833944
88	NC_017491	CGG	2	6	6953	6958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
89	NC_017491	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
90	NC_017491	TTG	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
91	NC_017491	AAC	2	6	6995	7000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
92	NC_017491	GAG	2	6	7057	7062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017491	GAT	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
94	NC_017491	AAG	2	6	7267	7272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
95	NC_017491	TCG	2	6	7283	7288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
96	NC_017491	GCG	3	9	7426	7434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833945
97	NC_017491	CAA	2	6	7491	7496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833945
98	NC_017491	GTT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833945
99	NC_017491	CTG	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
100	NC_017491	ACC	2	6	7612	7617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833945
101	NC_017491	CCG	2	6	7624	7629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
102	NC_017491	ATC	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833945
103	NC_017491	CCA	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833945
104	NC_017491	CCG	2	6	7691	7696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
105	NC_017491	GGT	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
106	NC_017491	TTA	2	6	7853	7858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833945
107	NC_017491	CAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833945
108	NC_017491	TGG	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
109	NC_017491	TGA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
110	NC_017491	CCG	2	6	7995	8000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
111	NC_017491	AAT	2	6	8026	8031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833945
112	NC_017491	TGG	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
113	NC_017491	CGG	3	9	8161	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833945
114	NC_017491	GAA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
115	NC_017491	TGA	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
116	NC_017491	ATT	2	6	8260	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833945
117	NC_017491	ATT	2	6	8473	8478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833945
118	NC_017491	ATG	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
119	NC_017491	CTG	2	6	8533	8538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
120	NC_017491	AAG	2	6	8582	8587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
121	NC_017491	GGT	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
122	NC_017491	GAT	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
123	NC_017491	TCG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
124	NC_017491	ATG	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
125	NC_017491	CTT	2	6	8748	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833945
126	NC_017491	CAA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833945
127	NC_017491	GCA	2	6	8777	8782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833945
128	NC_017491	ATG	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
129	NC_017491	GCA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833945
130	NC_017491	CGG	2	6	9276	9281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833945
131	NC_017491	GAA	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
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259	NC_017491	TGG	2	6	18780	18785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833961
260	NC_017491	AAT	2	6	18862	18867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833961
261	NC_017491	ATC	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833961
262	NC_017491	TTC	2	6	18914	18919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833961
263	NC_017491	GAA	2	6	18955	18960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833961
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270	NC_017491	CTT	2	6	19506	19511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833962
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289	NC_017491	CAT	2	6	20544	20549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833963
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295	NC_017491	AAT	2	6	21366	21371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_017491	GGC	2	6	21429	21434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_017491	AAT	3	9	21459	21467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017491	AAC	2	6	21486	21491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_017491	CTG	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_017491	CAA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_017491	TCC	2	6	21616	21621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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381	NC_017491	GAT	2	6	27187	27192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833968
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