MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus garvieae Lg2

Total Repeats: 821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017490	AAGAAA	2	12	3556	3567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831972
2	NC_017490	TGGAGC	2	12	4012	4023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831972
3	NC_017490	AAGCTG	2	12	4183	4194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831972
4	NC_017490	CAAAAG	2	12	18346	18357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385831982
5	NC_017490	CAGGTA	2	12	21575	21586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831985
6	NC_017490	TGTCGG	2	12	21669	21680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385831985
7	NC_017490	TGTTAT	2	12	21867	21878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385831985
8	NC_017490	TGAACG	2	12	22209	22220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831985
9	NC_017490	GTATAT	2	12	23958	23969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017490	GAGATA	2	12	25495	25506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385831987
11	NC_017490	ATCTTC	2	12	26227	26238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385831988
12	NC_017490	GTAGGC	2	12	28810	28821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831990
13	NC_017490	TCAATT	2	12	29037	29048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831991
14	NC_017490	CTGTGT	2	12	29802	29813	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385831992
15	NC_017490	TCATTA	2	12	32155	32166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831995
16	NC_017490	GTCTGT	2	12	34961	34972	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385831998
17	NC_017490	GATTGT	2	12	35998	36009	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385831999
18	NC_017490	GGAGCT	2	12	36458	36469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831999
19	NC_017490	ACCATT	2	12	36790	36801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831999
20	NC_017490	TTTGTT	2	12	44556	44567	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385832007
21	NC_017490	AGATGA	2	12	44918	44929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832007
22	NC_017490	TCCAAG	2	12	49182	49193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832010
23	NC_017490	TTCGGC	2	12	50198	50209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385832010
24	NC_017490	TCATAG	2	12	50370	50381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832010
25	NC_017490	CGGCTG	2	12	52238	52249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385832012
26	NC_017490	TTTCCT	2	12	54123	54134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385832014
27	NC_017490	AGGTCA	2	12	54391	54402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017490	TGGCAT	2	12	57291	57302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832016
29	NC_017490	TCTTGT	2	12	59619	59630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832018
30	NC_017490	GTCCTT	2	12	61973	61984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385832021
31	NC_017490	TTATAA	2	12	64797	64808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017490	GTGCAA	2	12	66651	66662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832026
33	NC_017490	AAAAAT	2	12	68967	68978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832027
34	NC_017490	TAAGAT	2	12	69401	69412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832027
35	NC_017490	CTTAAC	2	12	71889	71900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385832031
36	NC_017490	ATCCCA	2	12	72618	72629	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385832031
37	NC_017490	TGTAAC	2	12	73850	73861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832031
38	NC_017490	TGCTGA	2	12	75488	75499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832033
39	NC_017490	TTTTTG	2	12	80312	80323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385832038
40	NC_017490	CATGAC	2	12	83687	83698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832044
41	NC_017490	GTTCAC	2	12	84151	84162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832045
42	NC_017490	GCTTAT	2	12	89077	89088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385832049
43	NC_017490	AGCCTT	2	12	89256	89267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832049
44	NC_017490	AAAAAG	2	12	91475	91486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017490	CGTGGT	2	12	98091	98102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385832058
46	NC_017490	ACTGAA	2	12	99125	99136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832059
47	NC_017490	AGAAGC	2	12	101596	101607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832061
48	NC_017490	TATACT	2	12	102542	102553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385832062
49	NC_017490	TTATCA	2	12	105579	105590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385832066
50	NC_017490	ATTTTT	2	12	108721	108732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385832068
51	NC_017490	TAGAAG	2	12	110007	110018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832069
52	NC_017490	TTAACC	2	12	110084	110095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385832069
53	NC_017490	ATGGAC	2	12	110146	110157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832069
54	NC_017490	AGAAAC	2	12	113393	113404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385832073
55	NC_017490	TCTTAC	2	12	117845	117856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385832079
56	NC_017490	TAAAAG	2	12	126526	126537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832088
57	NC_017490	TGTTCT	2	12	129371	129382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832090
58	NC_017490	GTTTAT	2	12	131612	131623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832093
59	NC_017490	CGGAAA	2	12	138837	138848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832099
60	NC_017490	ATAAGT	2	12	138925	138936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832100
61	NC_017490	ATTTAG	2	12	140943	140954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832101
62	NC_017490	CGTAAT	2	12	142131	142142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017490	ACGTAA	2	12	145601	145612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832104
64	NC_017490	ATTGCG	2	12	153111	153122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832114
65	NC_017490	TTCTTT	2	12	157953	157964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385832120
66	NC_017490	AGCTAA	2	12	159173	159184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832122
67	NC_017490	TAAAGG	2	12	159302	159313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832122
68	NC_017490	GCAATC	2	12	161995	162006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832127
69	NC_017490	TACGCA	2	12	166152	166163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832136
70	NC_017490	AATTGT	2	12	167344	167355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017490	ATAGAG	2	12	168102	168113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017490	AAATGT	2	12	168315	168326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832137
73	NC_017490	TTTTCT	2	12	170013	170024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017490	AACAGT	2	12	170843	170854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832140
75	NC_017490	TAAAGG	2	12	171248	171259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832140
76	NC_017490	TTCGCG	2	12	171503	171514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385832141
77	NC_017490	CAAACA	2	12	171563	171574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385832141
78	NC_017490	TGCATC	2	12	171615	171626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832141
79	NC_017490	GGTAAA	2	12	173268	173279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832144
80	NC_017490	GACCAA	2	12	173421	173432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385832144
81	NC_017490	CTTGAT	2	12	175634	175645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385832146
82	NC_017490	ATGCTG	2	12	177044	177055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832148
83	NC_017490	TGAAAA	2	12	180265	180276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832155
84	NC_017490	CGTAAA	2	12	183841	183852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832158
85	NC_017490	TCAAGG	2	12	184720	184731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832159
86	NC_017490	TGTTCT	2	12	185843	185854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832160
87	NC_017490	TAAAAA	2	12	186453	186464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832160
88	NC_017490	CTCAAG	2	12	190944	190955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832164
89	NC_017490	ATGGAA	2	12	191233	191244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832165
90	NC_017490	AAATTC	2	12	197476	197487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385832167
91	NC_017490	TTGTCG	2	12	200387	200398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385832170
92	NC_017490	TTGAAA	2	12	201181	201192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832170
93	NC_017490	TCAAGT	2	12	202653	202664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832172
94	NC_017490	GCAAGC	2	12	205186	205197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385832175
95	NC_017490	ATAGGG	2	12	209898	209909	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385832178
96	NC_017490	TTGACG	2	12	215419	215430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832184
97	NC_017490	AAAATA	2	12	217311	217322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832185
98	NC_017490	CAAAAC	2	12	217682	217693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385832185
99	NC_017490	CAACGT	2	12	221619	221630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832189
100	NC_017490	TTAAAT	2	12	224899	224910	50 %	50 %	0 %	0 %	385832192
101	NC_017490	GTAGCT	2	12	225625	225636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832192
102	NC_017490	TGATGC	2	12	228533	228544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832194
103	NC_017490	GGCAGA	2	12	230698	230709	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385832196
104	NC_017490	AATCAA	2	12	231016	231027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385832196
105	NC_017490	TACAAA	2	12	232953	232964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385832198
106	NC_017490	TTTGAA	2	12	233966	233977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832198
107	NC_017490	TTGAAC	2	12	234390	234401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832198
108	NC_017490	GCACCA	2	12	235489	235500	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385832199
109	NC_017490	AAAGAA	2	12	237902	237913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385832202
110	NC_017490	GAAAGC	2	12	238856	238867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832202
111	NC_017490	AGCCAT	2	12	240127	240138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832203
112	NC_017490	TTTTGA	2	12	242116	242127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832207
113	NC_017490	AGTTGA	2	12	245697	245708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017490	TTTGAA	2	12	246320	246331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832212
115	NC_017490	CGATAC	2	12	252476	252487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832218
116	NC_017490	CATAAT	2	12	252530	252541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385832218
117	NC_017490	CTTTCG	2	12	252572	252583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385832218
118	NC_017490	ATGTTG	2	12	255773	255784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385832219
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121	NC_017490	ATTTTT	2	12	260137	260148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017490	GATTTT	2	12	270220	270231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832232
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