MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus garvieae Lg2

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017490	GTATAT	2	12	23958	23969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017490	AGGTCA	2	12	54391	54402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017490	TTATAA	2	12	64797	64808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017490	AAAAAG	2	12	91475	91486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017490	CGTAAT	2	12	142131	142142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017490	AATTGT	2	12	167344	167355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017490	ATAGAG	2	12	168102	168113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017490	TTTTCT	2	12	170013	170024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017490	AGTTGA	2	12	245697	245708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017490	ATTTTT	2	12	260137	260148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017490	AAAAAG	2	12	297728	297739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017490	TAATAT	2	12	332390	332401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017490	AGAAAA	2	12	355020	355031	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017490	AATATA	2	12	386131	386142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017490	GGAGTT	2	12	397111	397122	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017490	GAAAAA	2	12	470464	470475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017490	AATATT	2	12	505319	505330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017490	AAAAAT	2	12	526971	526982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017490	CTAAAA	2	12	555854	555865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017490	TTAAAA	2	12	563528	563539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017490	AAAAGA	2	12	590211	590222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017490	TTGTTA	2	12	592138	592149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017490	AAATAA	2	12	626135	626146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017490	AAAATA	2	12	666891	666902	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017490	GTCAAT	2	12	675332	675343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017490	AAGCTT	2	12	717299	717310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017490	TTTTAA	2	12	725864	725875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017490	TTTTAA	2	12	735391	735402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017490	TGTAGT	2	12	742233	742244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017490	TAAAAA	2	12	769823	769834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017490	GCAGTC	2	12	770557	770568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017490	ATTTTA	2	12	775729	775740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017490	CTTTTT	2	12	788874	788885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017490	TCTCTT	2	12	805201	805212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017490	TCGAAC	2	12	848697	848708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017490	TTTTTA	2	12	850278	850289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017490	AACAAG	2	12	850303	850314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017490	TAAAAA	2	12	876218	876229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017490	TAAAAA	2	12	880733	880744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017490	CTTTAT	2	12	881610	881621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017490	TTATAA	2	12	897660	897671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017490	TAAAAT	2	12	907023	907034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017490	ATAAAT	2	12	908729	908740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017490	ATTTCT	2	12	909037	909048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017490	TAAAAA	2	12	911625	911636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017490	CTTCAC	2	12	916807	916818	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017490	TAGTTA	2	12	936595	936606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017490	ACTCCA	2	12	951431	951442	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017490	TATTTT	2	12	955314	955325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017490	TGTGAA	2	12	985879	985890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017490	AAAAAC	2	12	994052	994063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017490	GGAATG	2	12	1009457	1009468	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017490	AAATTA	2	12	1010453	1010464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017490	GTTTAA	2	12	1021323	1021334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017490	TTCTTT	2	12	1062180	1062191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017490	ATTAAA	2	12	1082807	1082818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017490	ATAAAA	2	12	1095479	1095490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017490	GTAAAG	2	12	1102873	1102884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017490	TCCTTC	2	12	1113808	1113819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017490	AGAAAT	2	12	1121086	1121097	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017490	TTAGTT	2	12	1141594	1141605	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017490	AGAAAA	2	12	1180895	1180906	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017490	AATAAA	2	12	1185423	1185434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017490	AAAAAC	2	12	1213745	1213756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017490	TAAGCT	2	12	1215096	1215107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017490	TCTTTC	2	12	1223933	1223944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017490	CTATTT	2	12	1226801	1226812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017490	TAAAAT	2	12	1262721	1262732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017490	TAAATG	2	12	1268479	1268490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017490	TTTTTA	2	12	1270195	1270206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017490	TAAAAA	2	12	1317176	1317187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017490	TTGCAA	2	12	1337275	1337286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017490	CATTTT	2	12	1396393	1396404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017490	TATATT	2	12	1404557	1404568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017490	TGAGCT	2	12	1503839	1503850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017490	TTCACT	2	12	1508025	1508036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017490	TACCTC	2	12	1524911	1524922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017490	CTTAGG	2	12	1525594	1525605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017490	CTTTTT	2	12	1554812	1554823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017490	ACTTCC	2	12	1580855	1580866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017490	AAGCCA	2	12	1587806	1587817	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017490	AACGTT	2	12	1594182	1594193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017490	ATTTTT	2	12	1634306	1634317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017490	CAAGTG	2	12	1634799	1634810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017490	ACTCTT	2	12	1653609	1653620	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017490	ATTTTT	2	12	1655627	1655638	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017490	TTTTTA	2	12	1707796	1707807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017490	AGTAAC	2	12	1710687	1710698	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017490	TTTATC	2	12	1737453	1737464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017490	TTTTAC	2	12	1754196	1754207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017490	AAATAA	2	12	1773931	1773942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017490	GTAAAT	2	12	1785677	1785688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017490	ACTTCC	2	12	1820009	1820020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017490	ACTTCC	2	12	1852501	1852512	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017490	TTATAA	2	12	1893401	1893412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017490	TCAACT	2	12	1896686	1896697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017490	ATTATA	2	12	1929779	1929790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017490	CCCGAA	2	12	1932921	1932932	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017490	ACTTCC	2	12	1933346	1933357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017490	TTTTAT	2	12	1940859	1940870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017490	TAAAAA	2	12	1944974	1944985	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017490	ACTTCC	2	12	1957854	1957865	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.