MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus garvieae Lg2

Total Repeats: 719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017490	AAGAAA	2	12	3556	3567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831972
2	NC_017490	TGGAGC	2	12	4012	4023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831972
3	NC_017490	AAGCTG	2	12	4183	4194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831972
4	NC_017490	CAAAAG	2	12	18346	18357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385831982
5	NC_017490	CAGGTA	2	12	21575	21586	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831985
6	NC_017490	TGTCGG	2	12	21669	21680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385831985
7	NC_017490	TGTTAT	2	12	21867	21878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385831985
8	NC_017490	TGAACG	2	12	22209	22220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831985
9	NC_017490	GAGATA	2	12	25495	25506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385831987
10	NC_017490	ATCTTC	2	12	26227	26238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385831988
11	NC_017490	GTAGGC	2	12	28810	28821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831990
12	NC_017490	TCAATT	2	12	29037	29048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831991
13	NC_017490	CTGTGT	2	12	29802	29813	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385831992
14	NC_017490	TCATTA	2	12	32155	32166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831995
15	NC_017490	GTCTGT	2	12	34961	34972	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385831998
16	NC_017490	GATTGT	2	12	35998	36009	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385831999
17	NC_017490	GGAGCT	2	12	36458	36469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831999
18	NC_017490	ACCATT	2	12	36790	36801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831999
19	NC_017490	TTTGTT	2	12	44556	44567	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385832007
20	NC_017490	AGATGA	2	12	44918	44929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832007
21	NC_017490	TCCAAG	2	12	49182	49193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832010
22	NC_017490	TTCGGC	2	12	50198	50209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385832010
23	NC_017490	TCATAG	2	12	50370	50381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832010
24	NC_017490	CGGCTG	2	12	52238	52249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385832012
25	NC_017490	TTTCCT	2	12	54123	54134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385832014
26	NC_017490	TGGCAT	2	12	57291	57302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832016
27	NC_017490	TCTTGT	2	12	59619	59630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832018
28	NC_017490	GTCCTT	2	12	61973	61984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385832021
29	NC_017490	GTGCAA	2	12	66651	66662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832026
30	NC_017490	AAAAAT	2	12	68967	68978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832027
31	NC_017490	TAAGAT	2	12	69401	69412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832027
32	NC_017490	CTTAAC	2	12	71889	71900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385832031
33	NC_017490	ATCCCA	2	12	72618	72629	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385832031
34	NC_017490	TGTAAC	2	12	73850	73861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832031
35	NC_017490	TGCTGA	2	12	75488	75499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832033
36	NC_017490	TTTTTG	2	12	80312	80323	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385832038
37	NC_017490	CATGAC	2	12	83687	83698	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832044
38	NC_017490	GTTCAC	2	12	84151	84162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832045
39	NC_017490	GCTTAT	2	12	89077	89088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385832049
40	NC_017490	AGCCTT	2	12	89256	89267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832049
41	NC_017490	CGTGGT	2	12	98091	98102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385832058
42	NC_017490	ACTGAA	2	12	99125	99136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832059
43	NC_017490	AGAAGC	2	12	101596	101607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832061
44	NC_017490	TATACT	2	12	102542	102553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385832062
45	NC_017490	TTATCA	2	12	105579	105590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385832066
46	NC_017490	ATTTTT	2	12	108721	108732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385832068
47	NC_017490	TAGAAG	2	12	110007	110018	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832069
48	NC_017490	TTAACC	2	12	110084	110095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385832069
49	NC_017490	ATGGAC	2	12	110146	110157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832069
50	NC_017490	AGAAAC	2	12	113393	113404	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385832073
51	NC_017490	TCTTAC	2	12	117845	117856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385832079
52	NC_017490	TAAAAG	2	12	126526	126537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832088
53	NC_017490	TGTTCT	2	12	129371	129382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832090
54	NC_017490	GTTTAT	2	12	131612	131623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832093
55	NC_017490	CGGAAA	2	12	138837	138848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832099
56	NC_017490	ATAAGT	2	12	138925	138936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832100
57	NC_017490	ATTTAG	2	12	140943	140954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832101
58	NC_017490	ACGTAA	2	12	145601	145612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832104
59	NC_017490	ATTGCG	2	12	153111	153122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832114
60	NC_017490	TTCTTT	2	12	157953	157964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385832120
61	NC_017490	AGCTAA	2	12	159173	159184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832122
62	NC_017490	TAAAGG	2	12	159302	159313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832122
63	NC_017490	GCAATC	2	12	161995	162006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832127
64	NC_017490	TACGCA	2	12	166152	166163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832136
65	NC_017490	AAATGT	2	12	168315	168326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832137
66	NC_017490	AACAGT	2	12	170843	170854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832140
67	NC_017490	TAAAGG	2	12	171248	171259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832140
68	NC_017490	TTCGCG	2	12	171503	171514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385832141
69	NC_017490	CAAACA	2	12	171563	171574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385832141
70	NC_017490	TGCATC	2	12	171615	171626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832141
71	NC_017490	GGTAAA	2	12	173268	173279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832144
72	NC_017490	GACCAA	2	12	173421	173432	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385832144
73	NC_017490	CTTGAT	2	12	175634	175645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385832146
74	NC_017490	ATGCTG	2	12	177044	177055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832148
75	NC_017490	TGAAAA	2	12	180265	180276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832155
76	NC_017490	CGTAAA	2	12	183841	183852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832158
77	NC_017490	TCAAGG	2	12	184720	184731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832159
78	NC_017490	TGTTCT	2	12	185843	185854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385832160
79	NC_017490	TAAAAA	2	12	186453	186464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832160
80	NC_017490	CTCAAG	2	12	190944	190955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832164
81	NC_017490	ATGGAA	2	12	191233	191244	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385832165
82	NC_017490	AAATTC	2	12	197476	197487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385832167
83	NC_017490	TTGTCG	2	12	200387	200398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385832170
84	NC_017490	TTGAAA	2	12	201181	201192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385832170
85	NC_017490	TCAAGT	2	12	202653	202664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832172
86	NC_017490	GCAAGC	2	12	205186	205197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385832175
87	NC_017490	ATAGGG	2	12	209898	209909	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385832178
88	NC_017490	TTGACG	2	12	215419	215430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832184
89	NC_017490	AAAATA	2	12	217311	217322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832185
90	NC_017490	CAAAAC	2	12	217682	217693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385832185
91	NC_017490	CAACGT	2	12	221619	221630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832189
92	NC_017490	TTAAAT	2	12	224899	224910	50 %	50 %	0 %	0 %	385832192
93	NC_017490	GTAGCT	2	12	225625	225636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832192
94	NC_017490	TGATGC	2	12	228533	228544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832194
95	NC_017490	GGCAGA	2	12	230698	230709	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385832196
96	NC_017490	AATCAA	2	12	231016	231027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385832196
97	NC_017490	TACAAA	2	12	232953	232964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385832198
98	NC_017490	TTTGAA	2	12	233966	233977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832198
99	NC_017490	TTGAAC	2	12	234390	234401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385832198
100	NC_017490	GCACCA	2	12	235489	235500	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385832199
101	NC_017490	AAAGAA	2	12	237902	237913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385832202
102	NC_017490	GAAAGC	2	12	238856	238867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385832202
103	NC_017490	AGCCAT	2	12	240127	240138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832203
104	NC_017490	TTTTGA	2	12	242116	242127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832207
105	NC_017490	TTTGAA	2	12	246320	246331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385832212
106	NC_017490	CGATAC	2	12	252476	252487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385832218
107	NC_017490	CATAAT	2	12	252530	252541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385832218
108	NC_017490	CTTTCG	2	12	252572	252583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385832218
109	NC_017490	ATGTTG	2	12	255773	255784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385832219
110	NC_017490	CAAAGC	2	12	258165	258176	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385832221
111	NC_017490	GGCTTA	2	12	258969	258980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832222
112	NC_017490	GATTTT	2	12	270220	270231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832232
113	NC_017490	AACCAG	2	12	274059	274070	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385832237
114	NC_017490	TAAAAA	2	12	274121	274132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385832237
115	NC_017490	AGTTTT	2	12	274640	274651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385832238
116	NC_017490	TCAAAA	2	12	279840	279851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385832244
117	NC_017490	GATAAA	2	12	281364	281375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832246
118	NC_017490	ACTTAC	2	12	281658	281669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385832246
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121	NC_017490	AACGTA	2	12	290771	290782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385832255
122	NC_017490	TGATCG	2	12	291066	291077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832255
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130	NC_017490	CTTAAT	2	12	309784	309795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385832270
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231	NC_017490	CCAGTT	2	12	588518	588529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832540
232	NC_017490	ATGGAC	2	12	593490	593501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385832544
233	NC_017490	ATTGCC	2	12	593903	593914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385832544
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345	NC_017490	AAAGTA	2	12	894722	894733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385832835
346	NC_017490	TTGACG	2	12	896572	896583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385832837
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457	NC_017490	ATTTTT	2	12	1235852	1235863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385833217
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