MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus garvieae Lg2

Total Repeats: 1559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017490	AAAAG	2	10	2831	2840	80 %	0 %	20 %	0 %	385831972
2	NC_017490	AAGAG	2	10	4037	4046	60 %	0 %	40 %	0 %	385831972
3	NC_017490	TCCTT	2	10	7442	7451	0 %	60 %	0 %	40 %	385831973
4	NC_017490	AACAA	2	10	8267	8276	80 %	0 %	0 %	20 %	385831973
5	NC_017490	GAAGC	2	10	8671	8680	40 %	0 %	40 %	20 %	385831973
6	NC_017490	AATCA	2	10	9646	9655	60 %	20 %	0 %	20 %	385831974
7	NC_017490	TTTTA	2	10	12383	12392	20 %	80 %	0 %	0 %	385831977
8	NC_017490	GAGCA	2	10	14605	14614	40 %	0 %	40 %	20 %	385831977
9	NC_017490	AGATG	2	10	14843	14852	40 %	20 %	40 %	0 %	385831977
10	NC_017490	TTTAG	2	10	15731	15740	20 %	60 %	20 %	0 %	385831979
11	NC_017490	ATGAA	2	10	17687	17696	60 %	20 %	20 %	0 %	385831981
12	NC_017490	AAGAT	2	10	19633	19642	60 %	20 %	20 %	0 %	385831983
13	NC_017490	TCTAT	2	10	21632	21641	20 %	60 %	0 %	20 %	385831985
14	NC_017490	TTGGT	2	10	22259	22268	0 %	60 %	40 %	0 %	385831985
15	NC_017490	CAAGC	2	10	25453	25462	40 %	0 %	20 %	40 %	385831987
16	NC_017490	ATTAA	2	10	25916	25925	60 %	40 %	0 %	0 %	385831987
17	NC_017490	TTCTA	2	10	25932	25941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017490	TAATT	2	10	25964	25973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017490	GCGGT	2	10	27353	27362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017490	TTATT	2	10	27556	27565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017490	TTTGA	2	10	30321	30330	20 %	60 %	20 %	0 %	385831992
22	NC_017490	GATTT	2	10	30854	30863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017490	AAAGT	2	10	40007	40016	60 %	20 %	20 %	0 %	385832002
24	NC_017490	GTTTT	2	10	42288	42297	0 %	80 %	20 %	0 %	385832005
25	NC_017490	TATAA	2	10	43525	43534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017490	AGACA	2	10	45371	45380	60 %	0 %	20 %	20 %	385832007
27	NC_017490	TTGTG	2	10	46606	46615	0 %	60 %	40 %	0 %	385832007
28	NC_017490	TTTGA	2	10	47234	47243	20 %	60 %	20 %	0 %	385832008
29	NC_017490	TCAGT	2	10	47791	47800	20 %	40 %	20 %	20 %	385832008
30	NC_017490	AGGTT	2	10	50128	50137	20 %	40 %	40 %	0 %	385832010
31	NC_017490	ATCAA	2	10	51279	51288	60 %	20 %	0 %	20 %	385832011
32	NC_017490	CAACC	10	50	51556	51605	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_017490	CAACA	2	10	51626	51635	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017490	AAAGG	2	10	51720	51729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017490	AGAAA	2	10	51751	51760	80 %	0 %	20 %	0 %	385832012
36	NC_017490	TTAAG	2	10	53512	53521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017490	TTTGA	2	10	54157	54166	20 %	60 %	20 %	0 %	385832014
38	NC_017490	CAAGC	2	10	54575	54584	40 %	0 %	20 %	40 %	385832015
39	NC_017490	TAGAG	2	10	54950	54959	40 %	20 %	40 %	0 %	385832015
40	NC_017490	TGAGC	2	10	55569	55578	20 %	20 %	40 %	20 %	385832015
41	NC_017490	ATCAT	2	10	57569	57578	40 %	40 %	0 %	20 %	385832016
42	NC_017490	TAAAA	2	10	61057	61066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017490	ACATT	2	10	64416	64425	40 %	40 %	0 %	20 %	385832023
44	NC_017490	AGTTG	2	10	64481	64490	20 %	40 %	40 %	0 %	385832023
45	NC_017490	TCTAT	2	10	67960	67969	20 %	60 %	0 %	20 %	385832027
46	NC_017490	AAATT	2	10	69498	69507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017490	AAAAT	2	10	69554	69563	80 %	20 %	0 %	0 %	385832028
48	NC_017490	AAATC	2	10	69567	69576	60 %	20 %	0 %	20 %	385832028
49	NC_017490	TTTCC	2	10	71667	71676	0 %	60 %	0 %	40 %	385832031
50	NC_017490	TAAAA	2	10	77372	77381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017490	ATCAC	2	10	77528	77537	40 %	20 %	0 %	40 %	385832035
52	NC_017490	TAATA	2	10	77954	77963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017490	TGGCT	2	10	79342	79351	0 %	40 %	40 %	20 %	385832037
54	NC_017490	CAAAG	2	10	80911	80920	60 %	0 %	20 %	20 %	385832039
55	NC_017490	TGTCT	2	10	84856	84865	0 %	60 %	20 %	20 %	385832045
56	NC_017490	TTGAC	2	10	87178	87187	20 %	40 %	20 %	20 %	385832048
57	NC_017490	GCCAC	2	10	90212	90221	20 %	0 %	20 %	60 %	385832050
58	NC_017490	ACAGA	2	10	91053	91062	60 %	0 %	20 %	20 %	385832050
59	NC_017490	ATCTT	2	10	91739	91748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017490	ATTTG	2	10	91985	91994	20 %	60 %	20 %	0 %	385832052
61	NC_017490	GGCTT	2	10	92163	92172	0 %	40 %	40 %	20 %	385832052
62	NC_017490	TGATA	2	10	92337	92346	40 %	40 %	20 %	0 %	385832052
63	NC_017490	GCCAA	2	10	94524	94533	40 %	0 %	20 %	40 %	385832055
64	NC_017490	AAATT	2	10	94964	94973	60 %	40 %	0 %	0 %	385832056
65	NC_017490	TAAAA	2	10	95461	95470	80 %	20 %	0 %	0 %	385832056
66	NC_017490	CGTGA	2	10	96019	96028	20 %	20 %	40 %	20 %	385832057
67	NC_017490	ACTTG	2	10	97904	97913	20 %	40 %	20 %	20 %	385832058
68	NC_017490	TTGGT	2	10	100696	100705	0 %	60 %	40 %	0 %	385832060
69	NC_017490	GTTTG	2	10	100946	100955	0 %	60 %	40 %	0 %	385832060
70	NC_017490	TGGTT	2	10	102388	102397	0 %	60 %	40 %	0 %	385832062
71	NC_017490	ACAGG	2	10	106482	106491	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017490	AAGAT	2	10	106642	106651	60 %	20 %	20 %	0 %	385832067
73	NC_017490	TTCAC	2	10	106795	106804	20 %	40 %	0 %	40 %	385832067
74	NC_017490	ACCAC	2	10	108892	108901	40 %	0 %	0 %	60 %	385832068
75	NC_017490	TAAAC	2	10	110444	110453	60 %	20 %	0 %	20 %	385832069
76	NC_017490	TGGTT	2	10	111864	111873	0 %	60 %	40 %	0 %	385832071
77	NC_017490	TTACA	2	10	112598	112607	40 %	40 %	0 %	20 %	385832072
78	NC_017490	TTTTA	2	10	112956	112965	20 %	80 %	0 %	0 %	385832073
79	NC_017490	TTTAC	2	10	113472	113481	20 %	60 %	0 %	20 %	385832073
80	NC_017490	TGAAA	2	10	113715	113724	60 %	20 %	20 %	0 %	385832073
81	NC_017490	TGTTA	2	10	115845	115854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017490	GTTTG	2	10	118848	118857	0 %	60 %	40 %	0 %	385832081
83	NC_017490	CTTAT	2	10	119060	119069	20 %	60 %	0 %	20 %	385832081
84	NC_017490	GCTAT	2	10	119183	119192	20 %	40 %	20 %	20 %	385832081
85	NC_017490	TGATT	2	10	122242	122251	20 %	60 %	20 %	0 %	385832084
86	NC_017490	TATCT	2	10	122924	122933	20 %	60 %	0 %	20 %	385832085
87	NC_017490	CTTTT	2	10	125355	125364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017490	TAAAA	2	10	125825	125834	80 %	20 %	0 %	0 %	385832088
89	NC_017490	ATGGA	2	10	126770	126779	40 %	20 %	40 %	0 %	385832089
90	NC_017490	AAAAT	2	10	127859	127868	80 %	20 %	0 %	0 %	385832089
91	NC_017490	TTTGA	2	10	129765	129774	20 %	60 %	20 %	0 %	385832090
92	NC_017490	TAATC	2	10	130524	130533	40 %	40 %	0 %	20 %	385832091
93	NC_017490	AAGTA	2	10	130967	130976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017490	AAGTC	2	10	131587	131596	40 %	20 %	20 %	20 %	385832093
95	NC_017490	AATCA	2	10	132830	132839	60 %	20 %	0 %	20 %	385832094
96	NC_017490	GCTAT	2	10	133077	133086	20 %	40 %	20 %	20 %	385832094
97	NC_017490	GAAAT	2	10	134202	134211	60 %	20 %	20 %	0 %	385832095
98	NC_017490	ATTTT	2	10	135243	135252	20 %	80 %	0 %	0 %	385832097
99	NC_017490	ATAAA	2	10	135812	135821	80 %	20 %	0 %	0 %	385832097
100	NC_017490	ATTTA	2	10	135831	135840	40 %	60 %	0 %	0 %	385832097
101	NC_017490	GGGCA	2	10	138951	138960	20 %	0 %	60 %	20 %	385832100
102	NC_017490	CTTAT	2	10	141181	141190	20 %	60 %	0 %	20 %	385832101
103	NC_017490	TGTTA	2	10	141484	141493	20 %	60 %	20 %	0 %	385832101
104	NC_017490	GGATT	2	10	142056	142065	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017490	TTTTA	2	10	143708	143717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017490	CTTGC	2	10	145210	145219	0 %	40 %	20 %	40 %	385832103
107	NC_017490	AAATG	2	10	145425	145434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017490	AAAGA	2	10	147829	147838	80 %	0 %	20 %	0 %	385832107
109	NC_017490	TTTTA	2	10	148144	148153	20 %	80 %	0 %	0 %	385832108
110	NC_017490	AAGAA	2	10	148409	148418	80 %	0 %	20 %	0 %	385832108
111	NC_017490	ATTTT	2	10	150673	150682	20 %	80 %	0 %	0 %	385832113
112	NC_017490	GTACC	2	10	152644	152653	20 %	20 %	20 %	40 %	385832114
113	NC_017490	AAATA	2	10	154537	154546	80 %	20 %	0 %	0 %	385832115
114	NC_017490	CTTTG	2	10	154615	154624	0 %	60 %	20 %	20 %	385832115
115	NC_017490	TAAAT	2	10	158457	158466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017490	GACAA	2	10	158486	158495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017490	ATAGA	2	10	158506	158515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017490	AAATT	2	10	158939	158948	60 %	40 %	0 %	0 %	385832121
119	NC_017490	TAAGT	2	10	161395	161404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017490	TCCAC	2	10	162765	162774	20 %	20 %	0 %	60 %	385832128
121	NC_017490	AGCTT	2	10	165459	165468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017490	ACACA	2	10	166601	166610	60 %	0 %	0 %	40 %	385832136
123	NC_017490	ATTAA	2	10	168060	168069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017490	AAACC	2	10	168972	168981	60 %	0 %	0 %	40 %	385832137
125	NC_017490	TCAAA	2	10	172335	172344	60 %	20 %	0 %	20 %	385832143
126	NC_017490	GAAGA	2	10	172640	172649	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017490	AAGAA	2	10	173384	173393	80 %	0 %	20 %	0 %	385832144
128	NC_017490	ATGAA	2	10	173907	173916	60 %	20 %	20 %	0 %	385832145
129	NC_017490	TAAAA	2	10	176535	176544	80 %	20 %	0 %	0 %	385832147
130	NC_017490	ACTTT	2	10	179969	179978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017490	TTCAA	2	10	180154	180163	40 %	40 %	0 %	20 %	385832155
132	NC_017490	AGAAA	2	10	181569	181578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017490	TAAAA	2	10	181626	181635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017490	TCTAC	2	10	182226	182235	20 %	40 %	0 %	40 %	385832157
135	NC_017490	GATTC	2	10	182430	182439	20 %	40 %	20 %	20 %	385832157
136	NC_017490	CCTTG	2	10	184771	184780	0 %	40 %	20 %	40 %	385832159
137	NC_017490	CATCA	2	10	186931	186940	40 %	20 %	0 %	40 %	385832161
138	NC_017490	ATAAA	2	10	187093	187102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017490	GCAAT	2	10	193758	193767	40 %	20 %	20 %	20 %	385832165
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147	NC_017490	AAAGA	2	10	198498	198507	80 %	0 %	20 %	0 %	385832168
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152	NC_017490	GTTTG	2	10	204397	204406	0 %	60 %	40 %	0 %	385832173
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161	NC_017490	AGCGA	2	10	213907	213916	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017490	AGCGA	2	10	213975	213984	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_017490	AGCGA	2	10	214043	214052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_017490	AGAAA	2	10	320089	320098	80 %	0 %	20 %	0 %	385832279
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262	NC_017490	CTGCT	2	10	337294	337303	0 %	40 %	20 %	40 %	385832298
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