MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus garvieae Lg2

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017490	TTCTA	2	10	25932	25941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017490	TAATT	2	10	25964	25973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017490	GCGGT	2	10	27353	27362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017490	TTATT	2	10	27556	27565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017490	GATTT	2	10	30854	30863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017490	TATAA	2	10	43525	43534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017490	CAACC	10	50	51556	51605	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017490	CAACA	2	10	51626	51635	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017490	AAAGG	2	10	51720	51729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017490	TTAAG	2	10	53512	53521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017490	TAAAA	2	10	61057	61066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017490	AAATT	2	10	69498	69507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017490	TAAAA	2	10	77372	77381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017490	TAATA	2	10	77954	77963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017490	ATCTT	2	10	91739	91748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017490	ACAGG	2	10	106482	106491	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017490	TGTTA	2	10	115845	115854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017490	CTTTT	2	10	125355	125364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017490	AAGTA	2	10	130967	130976	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017490	GGATT	2	10	142056	142065	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017490	TTTTA	2	10	143708	143717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017490	AAATG	2	10	145425	145434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017490	TAAAT	2	10	158457	158466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017490	GACAA	2	10	158486	158495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017490	ATAGA	2	10	158506	158515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017490	TAAGT	2	10	161395	161404	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017490	AGCTT	2	10	165459	165468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017490	ATTAA	2	10	168060	168069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017490	GAAGA	2	10	172640	172649	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017490	ACTTT	2	10	179969	179978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017490	AGAAA	2	10	181569	181578	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017490	TAAAA	2	10	181626	181635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017490	ATAAA	2	10	187093	187102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017490	TAAAG	2	10	194949	194958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017490	GAGCG	2	10	197759	197768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017490	AGCGA	2	10	197828	197837	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017490	TAAAA	3	15	204822	204836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017490	AGCGA	2	10	213839	213848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017490	AGCGA	2	10	213907	213916	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017490	AGCGA	2	10	213975	213984	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017490	AGCGA	2	10	214043	214052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017490	AGCGA	2	10	216025	216034	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017490	ATTTT	2	10	229140	229149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017490	TAGGA	2	10	236947	236956	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017490	TATAA	2	10	237858	237867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017490	GTTCT	2	10	244546	244555	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017490	GGCTA	2	10	246760	246769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017490	TCTTT	2	10	246775	246784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017490	TAAAA	2	10	249090	249099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017490	AAATG	2	10	254018	254027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017490	ACAGC	19	95	283964	284058	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017490	TATAA	2	10	298669	298678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017490	AGAGA	2	10	315664	315673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017490	TAGAC	2	10	319701	319710	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017490	TTTAT	2	10	319889	319898	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017490	TATAA	2	10	322803	322812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017490	GGAGA	2	10	327566	327575	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017490	AGAAA	2	10	332421	332430	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017490	AAGAG	2	10	336526	336535	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017490	TAATA	2	10	355009	355018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017490	AATTA	2	10	360969	360978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017490	GAAAT	2	10	366536	366545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017490	CGATA	2	10	377084	377093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017490	TATAA	2	10	381022	381031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017490	ACAGA	2	10	383674	383683	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017490	TTCTA	2	10	389289	389298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017490	TATAA	2	10	398984	398993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017490	ATATA	2	10	401245	401254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017490	AGAAA	2	10	405362	405371	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017490	AAAGC	2	10	417528	417537	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017490	TGTAG	2	10	431499	431508	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017490	AAAAG	2	10	437276	437285	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017490	AATAA	2	10	437887	437896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017490	TAAAA	2	10	439752	439761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017490	TATAA	2	10	440426	440435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017490	AAAAT	2	10	444568	444577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017490	ATTAT	2	10	445165	445174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017490	AAAAG	2	10	445202	445211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017490	TAGGA	2	10	451599	451608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017490	ACATG	2	10	473507	473516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017490	TAAAA	2	10	473601	473610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017490	ATGCC	2	10	490491	490500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017490	TGTTA	2	10	490722	490731	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017490	ATAAA	2	10	505258	505267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017490	TTTTC	2	10	510529	510538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017490	CCGTT	2	10	510648	510657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017490	ATAAA	2	10	517032	517041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017490	GGAAA	2	10	523028	523037	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017490	TTGTA	2	10	548396	548405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017490	AATTT	2	10	556931	556940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017490	TAAAA	2	10	556970	556979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017490	TCTTA	2	10	559000	559009	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017490	ATAAA	2	10	563508	563517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017490	ATATA	2	10	564607	564616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017490	AATGA	2	10	571542	571551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017490	ACAGC	9	45	575870	575914	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017490	AATGA	2	10	586549	586558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017490	TCATG	2	10	590295	590304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017490	AGGGA	2	10	600678	600687	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017490	ATAGA	2	10	626744	626753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017490	TTTTA	2	10	638859	638868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017490	AGATA	2	10	638892	638901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017490	TATAG	2	10	645658	645667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017490	TAATT	2	10	671651	671660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017490	TATAG	2	10	681003	681012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017490	CACTC	2	10	682621	682630	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017490	CAGTA	2	10	689120	689129	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017490	AATAA	2	10	691196	691205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017490	AAAGA	2	10	706912	706921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017490	TATAA	2	10	726123	726132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017490	ACAGC	38	190	752266	752455	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017490	AGAAA	2	10	752607	752616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017490	CTCTC	2	10	752636	752645	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_017490	TATAG	2	10	753908	753917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017490	GATAT	2	10	757614	757623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017490	CATAA	2	10	770479	770488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017490	ATAAA	2	10	778973	778982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017490	TGAGT	2	10	783690	783699	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017490	AATGA	2	10	783733	783742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017490	TAAAA	2	10	792571	792580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017490	AGCAG	2	10	808301	808310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017490	TTGAA	2	10	809385	809394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017490	TAGAA	2	10	810707	810716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017490	CACAG	2	10	826619	826628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017490	AATTT	2	10	826632	826641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017490	GCTAA	2	10	850340	850349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017490	ACAGC	2	10	851070	851079	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017490	CAAAA	2	10	854117	854126	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017490	TATAA	2	10	866816	866825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017490	GGAAA	2	10	879451	879460	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017490	AAATT	2	10	880714	880723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017490	AAAAT	2	10	881536	881545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017490	AATTT	2	10	893574	893583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017490	TATAG	2	10	905405	905414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017490	TTTTG	2	10	906724	906733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017490	ATATA	2	10	906752	906761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017490	TTTTG	2	10	911601	911610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017490	GGTTT	2	10	933824	933833	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017490	AATAT	2	10	936718	936727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017490	CTTTT	2	10	936756	936765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017490	AAAAT	2	10	944476	944485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017490	CAACA	2	10	946353	946362	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017490	ACTTC	2	10	948775	948784	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017490	AATTG	2	10	950287	950296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017490	TCATA	2	10	950485	950494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017490	TTTTA	2	10	955875	955884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017490	ATAGA	2	10	958349	958358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017490	AATAG	2	10	958366	958375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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359	NC_017490	CTCTC	2	10	1961925	1961934	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.