MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	GTTTGA	2	12	704	715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385831932
2	NC_017487	TTCAAT	2	12	974	985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831932
3	NC_017487	ACGTTG	2	12	1668	1679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385831933
4	NC_017487	AAAAGA	2	12	2065	2076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831933
5	NC_017487	GCAGGT	2	12	5762	5773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831935
6	NC_017487	GAGGAA	2	12	6626	6637	50 %	0 %	50 %	0 %	385831935
7	NC_017487	ATATCC	2	12	7013	7024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831936
8	NC_017487	TTTCTT	2	12	12934	12945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385831941
9	NC_017487	TGACAA	2	12	17734	17745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385831944
10	NC_017487	TGCAGT	2	12	19317	19328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385831946
11	NC_017487	AAAAGA	2	12	21371	21382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831947
12	NC_017487	GCACTT	2	12	23998	24009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385831949
13	NC_017487	TTTATT	2	12	27604	27615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385831951
14	NC_017487	CTTCAT	2	12	30149	30160	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385831954
15	NC_017487	GCCTTT	2	12	30831	30842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385831954
16	NC_017487	GCTCAA	2	12	33434	33445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385831956

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.