MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	ATTTT	2	10	1805	1814	20 %	80 %	0 %	0 %	385831933
2	NC_017487	ACAAA	2	10	8492	8501	80 %	0 %	0 %	20 %	385831937
3	NC_017487	ATACA	2	10	8836	8845	60 %	20 %	0 %	20 %	385831937
4	NC_017487	TGCTG	2	10	9055	9064	0 %	40 %	40 %	20 %	385831937
5	NC_017487	TAGAT	2	10	10614	10623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017487	TTTAA	2	10	10929	10938	40 %	60 %	0 %	0 %	385831940
7	NC_017487	TTTTA	2	10	11047	11056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017487	TCATT	2	10	12991	13000	20 %	60 %	0 %	20 %	385831941
9	NC_017487	CAAAA	2	10	14475	14484	80 %	0 %	0 %	20 %	385831942
10	NC_017487	ATTTT	2	10	14890	14899	20 %	80 %	0 %	0 %	385831942
11	NC_017487	TTTAT	2	10	17370	17379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017487	CTCAA	2	10	17590	17599	40 %	20 %	0 %	40 %	385831944
13	NC_017487	TTTGA	2	10	19810	19819	20 %	60 %	20 %	0 %	385831946
14	NC_017487	TAAAA	2	10	20887	20896	80 %	20 %	0 %	0 %	385831946
15	NC_017487	CTAAA	2	10	22807	22816	60 %	20 %	0 %	20 %	385831948
16	NC_017487	CTTTA	2	10	23085	23094	20 %	60 %	0 %	20 %	385831948
17	NC_017487	ATTCT	2	10	23154	23163	20 %	60 %	0 %	20 %	385831948
18	NC_017487	ATTAT	2	10	23708	23717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017487	AAGCA	2	10	25869	25878	60 %	0 %	20 %	20 %	385831949
20	NC_017487	CAATC	2	10	29541	29550	40 %	20 %	0 %	40 %	385831954
21	NC_017487	TTCAT	2	10	31066	31075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017487	TTCTT	2	10	31823	31832	0 %	80 %	0 %	20 %	385831955
23	NC_017487	TATAG	2	10	32341	32350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017487	ATTTT	2	10	32832	32841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017487	CAATA	2	10	33182	33191	60 %	20 %	0 %	20 %	385831956
26	NC_017487	AAATC	2	10	33340	33349	60 %	20 %	0 %	20 %	385831956
27	NC_017487	AACCA	2	10	33691	33700	60 %	0 %	0 %	40 %	385831957
28	NC_017487	CTGTT	2	10	35055	35064	0 %	60 %	20 %	20 %	385831958

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.