MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	GCAG	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	385831932
2	NC_017487	AATC	2	8	803	810	50 %	25 %	0 %	25 %	385831932
3	NC_017487	GATT	2	8	1133	1140	25 %	50 %	25 %	0 %	385831932
4	NC_017487	TACC	2	8	1500	1507	25 %	25 %	0 %	50 %	385831932
5	NC_017487	AAGC	2	8	1586	1593	50 %	0 %	25 %	25 %	385831933
6	NC_017487	GAAA	2	8	2186	2193	75 %	0 %	25 %	0 %	385831934
7	NC_017487	AATT	2	8	2267	2274	50 %	50 %	0 %	0 %	385831934
8	NC_017487	TCAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	0 %	25 %	385831934
9	NC_017487	TTTA	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	385831934
10	NC_017487	TTTG	2	8	2813	2820	0 %	75 %	25 %	0 %	385831934
11	NC_017487	ATTT	2	8	2987	2994	25 %	75 %	0 %	0 %	385831934
12	NC_017487	CACT	2	8	3833	3840	25 %	25 %	0 %	50 %	385831934
13	NC_017487	TGAT	2	8	3937	3944	25 %	50 %	25 %	0 %	385831934
14	NC_017487	GAAA	2	8	4334	4341	75 %	0 %	25 %	0 %	385831934
15	NC_017487	AGTG	2	8	4514	4521	25 %	25 %	50 %	0 %	385831934
16	NC_017487	AATG	2	8	5024	5031	50 %	25 %	25 %	0 %	385831934
17	NC_017487	GATG	2	8	5266	5273	25 %	25 %	50 %	0 %	385831935
18	NC_017487	CTAC	2	8	6516	6523	25 %	25 %	0 %	50 %	385831935
19	NC_017487	TTGA	2	8	6719	6726	25 %	50 %	25 %	0 %	385831935
20	NC_017487	TTGA	2	8	6758	6765	25 %	50 %	25 %	0 %	385831935
21	NC_017487	GAAG	2	8	7197	7204	50 %	0 %	50 %	0 %	385831936
22	NC_017487	TAAA	2	8	7828	7835	75 %	25 %	0 %	0 %	385831936
23	NC_017487	TGTT	2	8	7981	7988	0 %	75 %	25 %	0 %	385831936
24	NC_017487	CATA	2	8	8080	8087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017487	TATT	2	8	8116	8123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017487	ATTT	2	8	8139	8146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017487	ACGA	2	8	8268	8275	50 %	0 %	25 %	25 %	385831937
28	NC_017487	ATTC	2	8	8509	8516	25 %	50 %	0 %	25 %	385831937
29	NC_017487	CTTC	2	8	9222	9229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017487	TTTA	2	8	10691	10698	25 %	75 %	0 %	0 %	385831940
31	NC_017487	ATGT	2	8	10898	10905	25 %	50 %	25 %	0 %	385831940
32	NC_017487	AAAT	2	8	11006	11013	75 %	25 %	0 %	0 %	385831940
33	NC_017487	CAAA	2	8	11283	11290	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017487	ATAG	2	8	11869	11876	50 %	25 %	25 %	0 %	385831941
35	NC_017487	TCAT	2	8	11925	11932	25 %	50 %	0 %	25 %	385831941
36	NC_017487	TAAA	2	8	11935	11942	75 %	25 %	0 %	0 %	385831941
37	NC_017487	AAAG	2	8	11993	12000	75 %	0 %	25 %	0 %	385831941
38	NC_017487	AGTG	2	8	12115	12122	25 %	25 %	50 %	0 %	385831941
39	NC_017487	GCAT	2	8	12735	12742	25 %	25 %	25 %	25 %	385831941
40	NC_017487	ATAA	2	8	13096	13103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017487	TTTA	2	8	13190	13197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017487	GAAA	2	8	13645	13652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017487	CTTT	2	8	14611	14618	0 %	75 %	0 %	25 %	385831942
44	NC_017487	AACA	2	8	14865	14872	75 %	0 %	0 %	25 %	385831942
45	NC_017487	TTAT	2	8	15068	15075	25 %	75 %	0 %	0 %	385831942
46	NC_017487	TGTC	2	8	15141	15148	0 %	50 %	25 %	25 %	385831942
47	NC_017487	TGAT	2	8	15534	15541	25 %	50 %	25 %	0 %	385831942
48	NC_017487	TAGA	2	8	16224	16231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017487	GTTG	2	8	16398	16405	0 %	50 %	50 %	0 %	385831943
50	NC_017487	AAGC	2	8	16437	16444	50 %	0 %	25 %	25 %	385831943
51	NC_017487	TAAA	2	8	16609	16616	75 %	25 %	0 %	0 %	385831943
52	NC_017487	ATAA	2	8	17945	17952	75 %	25 %	0 %	0 %	385831944
53	NC_017487	TTTC	2	8	18621	18628	0 %	75 %	0 %	25 %	385831945
54	NC_017487	ATTT	2	8	20291	20298	25 %	75 %	0 %	0 %	385831946
55	NC_017487	ACTT	2	8	20642	20649	25 %	50 %	0 %	25 %	385831946
56	NC_017487	AAAC	2	8	20854	20861	75 %	0 %	0 %	25 %	385831946
57	NC_017487	AAAG	2	8	21123	21130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017487	ACAA	2	8	21601	21608	75 %	0 %	0 %	25 %	385831947
59	NC_017487	ATTC	2	8	21794	21801	25 %	50 %	0 %	25 %	385831948
60	NC_017487	ATTT	2	8	21847	21854	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
61	NC_017487	ATTT	2	8	21968	21975	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
62	NC_017487	AAAC	2	8	22104	22111	75 %	0 %	0 %	25 %	385831948
63	NC_017487	TCTA	2	8	22128	22135	25 %	50 %	0 %	25 %	385831948
64	NC_017487	TTAT	2	8	22498	22505	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
65	NC_017487	AATT	2	8	22628	22635	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
66	NC_017487	TTGG	2	8	22912	22919	0 %	50 %	50 %	0 %	385831948
67	NC_017487	ACTC	2	8	23318	23325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017487	GAAA	2	8	23600	23607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017487	TTAC	2	8	23787	23794	25 %	50 %	0 %	25 %	385831949
70	NC_017487	GATA	2	8	24611	24618	50 %	25 %	25 %	0 %	385831949
71	NC_017487	GAAT	2	8	24658	24665	50 %	25 %	25 %	0 %	385831949
72	NC_017487	ACTG	2	8	24766	24773	25 %	25 %	25 %	25 %	385831949
73	NC_017487	GTTT	2	8	25415	25422	0 %	75 %	25 %	0 %	385831949
74	NC_017487	TCTT	2	8	25423	25430	0 %	75 %	0 %	25 %	385831949
75	NC_017487	TAAT	2	8	25439	25446	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
76	NC_017487	ATTA	2	8	25455	25462	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
77	NC_017487	ATTG	2	8	25792	25799	25 %	50 %	25 %	0 %	385831949
78	NC_017487	TAAA	2	8	25857	25864	75 %	25 %	0 %	0 %	385831949
79	NC_017487	ATTA	2	8	26274	26281	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
80	NC_017487	CTTA	2	8	26415	26422	25 %	50 %	0 %	25 %	385831949
81	NC_017487	AATT	2	8	27086	27093	50 %	50 %	0 %	0 %	385831950
82	NC_017487	TCTA	2	8	27122	27129	25 %	50 %	0 %	25 %	385831950
83	NC_017487	AATT	2	8	27140	27147	50 %	50 %	0 %	0 %	385831950
84	NC_017487	TTTA	2	8	27424	27431	25 %	75 %	0 %	0 %	385831951
85	NC_017487	CATA	2	8	28104	28111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017487	GTTT	2	8	28115	28122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017487	TTGT	2	8	28209	28216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017487	AAAT	2	8	28442	28449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017487	AAAT	2	8	28672	28679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017487	TTGT	2	8	29134	29141	0 %	75 %	25 %	0 %	385831953
91	NC_017487	GCTT	2	8	29270	29277	0 %	50 %	25 %	25 %	385831953
92	NC_017487	ATTA	2	8	29379	29386	50 %	50 %	0 %	0 %	385831954
93	NC_017487	ATGA	2	8	29841	29848	50 %	25 %	25 %	0 %	385831954
94	NC_017487	AGAA	2	8	29934	29941	75 %	0 %	25 %	0 %	385831954
95	NC_017487	AAAC	2	8	30362	30369	75 %	0 %	0 %	25 %	385831954
96	NC_017487	TAAA	2	8	30504	30511	75 %	25 %	0 %	0 %	385831954
97	NC_017487	GACT	2	8	30925	30932	25 %	25 %	25 %	25 %	385831954
98	NC_017487	CCTT	2	8	30958	30965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017487	GAAT	2	8	31084	31091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017487	TTAT	2	8	31462	31469	25 %	75 %	0 %	0 %	385831955
101	NC_017487	ACTT	2	8	31515	31522	25 %	50 %	0 %	25 %	385831955
102	NC_017487	AATG	2	8	32566	32573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017487	TGAA	2	8	32664	32671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017487	AACA	2	8	32702	32709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017487	GTTC	2	8	32728	32735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017487	AAAG	2	8	32813	32820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017487	CAAA	2	8	33146	33153	75 %	0 %	0 %	25 %	385831956
108	NC_017487	TCAA	2	8	33360	33367	50 %	25 %	0 %	25 %	385831956
109	NC_017487	AGCG	2	8	33501	33508	25 %	0 %	50 %	25 %	385831957
110	NC_017487	AGAC	2	8	33531	33538	50 %	0 %	25 %	25 %	385831957
111	NC_017487	CATG	2	8	33540	33547	25 %	25 %	25 %	25 %	385831957
112	NC_017487	GTGG	2	8	33622	33629	0 %	25 %	75 %	0 %	385831957
113	NC_017487	GAAA	2	8	33917	33924	75 %	0 %	25 %	0 %	385831957
114	NC_017487	ATGA	2	8	33967	33974	50 %	25 %	25 %	0 %	385831957
115	NC_017487	CAAA	2	8	34534	34541	75 %	0 %	0 %	25 %	385831957
116	NC_017487	GAAA	2	8	34919	34926	75 %	0 %	25 %	0 %	385831958

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.