MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	CATA	2	8	8080	8087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017487	TATT	2	8	8116	8123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017487	ATTT	2	8	8139	8146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017487	CTTC	2	8	9222	9229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017487	CAAA	2	8	11283	11290	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017487	ATAA	2	8	13096	13103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017487	TTTA	2	8	13190	13197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017487	GAAA	2	8	13645	13652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017487	TAGA	2	8	16224	16231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017487	AAAG	2	8	21123	21130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017487	ACTC	2	8	23318	23325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017487	GAAA	2	8	23600	23607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017487	CATA	2	8	28104	28111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017487	GTTT	2	8	28115	28122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017487	TTGT	2	8	28209	28216	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017487	AAAT	2	8	28442	28449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017487	AAAT	2	8	28672	28679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017487	CCTT	2	8	30958	30965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017487	GAAT	2	8	31084	31091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017487	AATG	2	8	32566	32573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017487	TGAA	2	8	32664	32671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017487	AACA	2	8	32702	32709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017487	GTTC	2	8	32728	32735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017487	AAAG	2	8	32813	32820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.