MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 453

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	GAT	2	6	58	63	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017487	TCT	2	6	145	150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017487	AAT	2	6	191	196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017487	TAT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017487	TAT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017487	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017487	GAA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017487	TCG	2	6	328	333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017487	AGT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
10	NC_017487	GAA	2	6	546	551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
11	NC_017487	AGA	2	6	584	589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
12	NC_017487	ATG	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
13	NC_017487	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831932
14	NC_017487	GAA	2	6	1071	1076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
15	NC_017487	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831932
16	NC_017487	AAG	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
17	NC_017487	GCT	2	6	1286	1291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831932
18	NC_017487	ACT	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831932
19	NC_017487	ATG	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
20	NC_017487	TTA	2	6	1692	1697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831933
21	NC_017487	CAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831933
22	NC_017487	GAC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831933
23	NC_017487	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831933
24	NC_017487	TGA	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831933
25	NC_017487	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831933
26	NC_017487	AGA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
27	NC_017487	AGG	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831933
28	NC_017487	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
29	NC_017487	AGA	3	9	2044	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
30	NC_017487	TGG	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831933
31	NC_017487	GAA	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
32	NC_017487	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
33	NC_017487	AGG	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
34	NC_017487	CTT	3	9	2476	2484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831934
35	NC_017487	TTA	2	6	2618	2623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
36	NC_017487	AGA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
37	NC_017487	ACT	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
38	NC_017487	GAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
39	NC_017487	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831934
40	NC_017487	AGG	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
41	NC_017487	ATT	2	6	3044	3049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
42	NC_017487	GTT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
43	NC_017487	TTG	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
44	NC_017487	CCT	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831934
45	NC_017487	ATC	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
46	NC_017487	TAA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831934
47	NC_017487	CAA	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
48	NC_017487	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
49	NC_017487	TTG	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
50	NC_017487	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
51	NC_017487	GAA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
52	NC_017487	ACG	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831934
53	NC_017487	GAT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
54	NC_017487	AGA	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
55	NC_017487	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
56	NC_017487	ATT	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
57	NC_017487	TGA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
58	NC_017487	TCA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
59	NC_017487	TAG	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
60	NC_017487	TAA	2	6	4100	4105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831934
61	NC_017487	TTG	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
62	NC_017487	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
63	NC_017487	GAT	2	6	4502	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
64	NC_017487	AGT	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
65	NC_017487	GAG	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
66	NC_017487	GAG	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
67	NC_017487	TTC	2	6	4727	4732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831934
68	NC_017487	CGT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831934
69	NC_017487	CAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
70	NC_017487	TAC	2	6	4904	4909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
71	NC_017487	GAA	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
72	NC_017487	AGA	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
73	NC_017487	AGA	3	9	5133	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
74	NC_017487	AGA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
75	NC_017487	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
76	NC_017487	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
77	NC_017487	CAA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831935
78	NC_017487	ACT	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
79	NC_017487	GAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
80	NC_017487	GAA	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
81	NC_017487	CAA	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831935
82	NC_017487	CAT	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
83	NC_017487	TCA	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
84	NC_017487	ACG	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831935
85	NC_017487	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
86	NC_017487	CCT	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831935
87	NC_017487	TTA	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831935
88	NC_017487	GAA	2	6	6406	6411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
89	NC_017487	TCG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831935
90	NC_017487	TGA	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831935
91	NC_017487	GAA	2	6	6683	6688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
92	NC_017487	CAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831935
93	NC_017487	TCT	2	6	6775	6780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831935
94	NC_017487	ATG	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831935
95	NC_017487	GAT	2	6	6840	6845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831936
96	NC_017487	GAA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831936
97	NC_017487	GAA	2	6	6924	6929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831936
98	NC_017487	GAA	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831936
99	NC_017487	TGT	2	6	7073	7078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831936
100	NC_017487	ATG	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831936
101	NC_017487	AAT	2	6	7146	7151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831936
102	NC_017487	GAC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831936
103	NC_017487	TCA	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831936
104	NC_017487	TTG	2	6	7341	7346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831936
105	NC_017487	AAT	2	6	7494	7499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831936
106	NC_017487	CCT	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831936
107	NC_017487	ATT	2	6	7532	7537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831936
108	NC_017487	GAT	2	6	7638	7643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831936
109	NC_017487	CAC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385831936
110	NC_017487	GGT	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831936
111	NC_017487	AGA	2	6	7868	7873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831936
112	NC_017487	CAA	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831936
113	NC_017487	TTC	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831936
114	NC_017487	CAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831936
115	NC_017487	TCA	2	6	7925	7930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831936
116	NC_017487	TTG	2	6	7944	7949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831936
117	NC_017487	ATA	2	6	8012	8017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017487	CAA	2	6	8127	8132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017487	AGG	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017487	ATT	2	6	8209	8214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831937
121	NC_017487	TGT	2	6	8248	8253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831937
122	NC_017487	TGA	2	6	8335	8340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831937
123	NC_017487	GAT	2	6	8359	8364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831937
124	NC_017487	GAC	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831937
125	NC_017487	TGT	2	6	8452	8457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831937
126	NC_017487	ATG	2	6	8544	8549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831937
127	NC_017487	GAC	2	6	8612	8617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831937
128	NC_017487	TGA	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831937
129	NC_017487	CAA	2	6	8733	8738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831937
130	NC_017487	ACC	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385831937
131	NC_017487	TGA	2	6	8827	8832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831937
132	NC_017487	ATT	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831937
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259	NC_017487	CTA	2	6	19014	19019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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