MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	TC	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
2	NC_017487	CA	3	6	824	829	50 %	0 %	0 %	50 %	385831932
3	NC_017487	GA	3	6	941	946	50 %	0 %	50 %	0 %	385831932
4	NC_017487	CT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
5	NC_017487	CT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	0 %	50 %	385831934
6	NC_017487	TA	3	6	4216	4221	50 %	50 %	0 %	0 %	385831934
7	NC_017487	TC	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	385831935
8	NC_017487	TC	3	6	6979	6984	0 %	50 %	0 %	50 %	385831936
9	NC_017487	TA	3	6	7219	7224	50 %	50 %	0 %	0 %	385831936
10	NC_017487	AT	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	385831936
11	NC_017487	AT	3	6	8278	8283	50 %	50 %	0 %	0 %	385831937
12	NC_017487	AT	3	6	9848	9853	50 %	50 %	0 %	0 %	385831938
13	NC_017487	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	385831938
14	NC_017487	TA	3	6	10454	10459	50 %	50 %	0 %	0 %	385831939
15	NC_017487	TA	3	6	10712	10717	50 %	50 %	0 %	0 %	385831940
16	NC_017487	TC	3	6	14680	14685	0 %	50 %	0 %	50 %	385831942
17	NC_017487	TA	3	6	16387	16392	50 %	50 %	0 %	0 %	385831943
18	NC_017487	TA	3	6	16536	16541	50 %	50 %	0 %	0 %	385831943
19	NC_017487	AC	3	6	17923	17928	50 %	0 %	0 %	50 %	385831944
20	NC_017487	AT	3	6	18153	18158	50 %	50 %	0 %	0 %	385831944
21	NC_017487	TA	3	6	18341	18346	50 %	50 %	0 %	0 %	385831945
22	NC_017487	AT	3	6	20103	20108	50 %	50 %	0 %	0 %	385831946
23	NC_017487	AT	3	6	21878	21883	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
24	NC_017487	TA	3	6	22529	22534	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
25	NC_017487	CT	3	6	24047	24052	0 %	50 %	0 %	50 %	385831949
26	NC_017487	TG	3	6	24109	24114	0 %	50 %	50 %	0 %	385831949
27	NC_017487	GC	3	6	24331	24336	0 %	0 %	50 %	50 %	385831949
28	NC_017487	TA	3	6	24383	24388	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
29	NC_017487	AT	3	6	24589	24594	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
30	NC_017487	GA	3	6	25359	25364	50 %	0 %	50 %	0 %	385831949
31	NC_017487	AT	3	6	25531	25536	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
32	NC_017487	GA	4	8	26579	26586	50 %	0 %	50 %	0 %	385831949
33	NC_017487	AT	3	6	27943	27948	50 %	50 %	0 %	0 %	385831952
34	NC_017487	TG	3	6	29730	29735	0 %	50 %	50 %	0 %	385831954
35	NC_017487	AT	3	6	30664	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	385831954
36	NC_017487	AT	3	6	30772	30777	50 %	50 %	0 %	0 %	385831954
37	NC_017487	CT	3	6	33221	33226	0 %	50 %	0 %	50 %	385831956
38	NC_017487	GA	3	6	34086	34091	50 %	0 %	50 %	0 %	385831957
39	NC_017487	GA	3	6	34241	34246	50 %	0 %	50 %	0 %	385831957
40	NC_017487	AG	3	6	35314	35319	50 %	0 %	50 %	0 %	385831958
41	NC_017487	AT	3	6	35595	35600	50 %	50 %	0 %	0 %	385831959

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.