MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	TTAAAT	2	12	10847	10858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017486	TAGTTT	2	12	71533	71544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017486	TGAAAT	2	12	121520	121531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017486	ATTTTT	2	12	130030	130041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017486	TAAAAA	2	12	160550	160561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017486	TAAAAA	2	12	208964	208975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017486	AAATAG	2	12	213797	213808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017486	AGTTCA	2	12	225730	225741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017486	TAAAAA	2	12	230385	230396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017486	AAAAGA	2	12	240417	240428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017486	TAAATT	2	12	245299	245310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017486	ATTCTA	2	12	253351	253362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017486	TGAAAA	2	12	302726	302737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017486	ATTTAA	2	12	345556	345567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017486	TTAAAA	2	12	363485	363496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017486	TAAAAT	2	12	365760	365771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017486	AATAAA	2	12	365916	365927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017486	TAAAAA	2	12	400703	400714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017486	ATGAAA	2	12	403878	403889	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017486	TTTTTA	2	12	408707	408718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017486	ACACCG	2	12	414352	414363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017486	AAATAA	2	12	420137	420148	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017486	TGTTTT	2	12	436360	436371	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017486	TTTTAG	2	12	442314	442325	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017486	TGGAAG	2	12	475271	475282	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017486	GTAAAG	2	12	494077	494088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017486	ATTTTT	2	12	506382	506393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017486	AGAAAA	2	12	521494	521505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017486	ATGTAA	2	12	529066	529077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017486	ATTTAT	2	12	530648	530659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017486	GGTTAA	2	12	547137	547148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017486	GATTTA	2	12	567463	567474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017486	TATAAA	2	12	594927	594938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017486	AATAAA	2	12	626339	626350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017486	TATTGC	2	12	627279	627290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017486	ATTATA	2	12	628788	628799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017486	AGGATA	2	12	640269	640280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017486	GAAGCG	2	12	649374	649385	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017486	GCTAAT	2	12	650516	650527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017486	TCAAGG	2	12	651206	651217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017486	CAATAA	2	12	651302	651313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017486	AACATA	2	12	708007	708018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017486	ATTTAT	2	12	716036	716047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017486	TTACAA	2	12	717455	717466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017486	AATTAA	2	12	722807	722818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017486	CAAAAA	2	12	730003	730014	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017486	ATTTAA	2	12	731188	731199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017486	AGCATT	2	12	731218	731229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017486	AATTTA	2	12	751102	751113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017486	GAATTG	2	12	782487	782498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017486	AGATTT	2	12	807402	807413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017486	TTTGAA	2	12	807746	807757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017486	TATAAA	2	12	824421	824432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017486	CAAAAG	2	12	834778	834789	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017486	TCAAAA	2	12	835274	835285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017486	TAAAAA	2	12	863747	863758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017486	TGAAAA	2	12	878305	878316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017486	GAGATA	2	12	892825	892836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017486	AAAAGT	2	12	900275	900286	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017486	AATAGT	2	12	904588	904599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017486	TAAAAA	2	12	914977	914988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017486	TAAATA	2	12	917875	917886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017486	AGATTT	2	12	929224	929235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017486	AAGAAA	2	12	929479	929490	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017486	TTTAAT	2	12	934010	934021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017486	TAAAAA	2	12	1001590	1001601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017486	TTTAAA	2	12	1004871	1004882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017486	TAAAAA	2	12	1018847	1018858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017486	AAAGAA	2	12	1019659	1019670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017486	TACAAA	2	12	1054983	1054994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017486	TTTTAA	2	12	1056870	1056881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017486	ATTTTT	2	12	1063286	1063297	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017486	TTTTTA	2	12	1085567	1085578	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017486	AGTAAA	2	12	1147957	1147968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017486	AAAAAT	2	12	1174593	1174604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017486	TATTGT	2	12	1177247	1177258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017486	GTTTTC	2	12	1188340	1188351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017486	GATAGC	2	12	1189288	1189299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017486	CAAGTA	2	12	1250303	1250314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017486	AGGATA	2	12	1262580	1262591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017486	ATTATA	2	12	1283776	1283787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017486	TTAATT	2	12	1329740	1329751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017486	TTTTTA	2	12	1342842	1342853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017486	CTTTTT	2	12	1362093	1362104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017486	TCTTTT	2	12	1374529	1374540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017486	TAAAAA	2	12	1380517	1380528	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017486	TAAGTT	2	12	1396368	1396379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017486	TAAAAA	2	12	1397081	1397092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017486	AATTTT	2	12	1397122	1397133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017486	CATTTT	2	12	1413049	1413060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017486	TAAATC	2	12	1414304	1414315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017486	ATTTTT	2	12	1417250	1417261	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017486	TAATAG	2	12	1419841	1419852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017486	ACGTTT	2	12	1441880	1441891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017486	TATTTT	2	12	1465903	1465914	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017486	TTTTGG	2	12	1480503	1480514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017486	CAATAT	2	12	1480916	1480927	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017486	ATTGTA	2	12	1481075	1481086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017486	ATATTA	2	12	1481256	1481267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017486	TAAAAA	2	12	1492851	1492862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017486	TCCACT	2	12	1493407	1493418	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017486	CTATTT	2	12	1539156	1539167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017486	TTTTAC	2	12	1546774	1546785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017486	TTTTTC	2	12	1546907	1546918	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017486	TATTTT	2	12	1547464	1547475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017486	TTAGAA	2	12	1547529	1547540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017486	TATAAG	2	12	1548597	1548608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017486	TTTACA	2	12	1556755	1556766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017486	TAAAAA	2	12	1568796	1568807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017486	CTTCGG	2	12	1572536	1572547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017486	TAAAAA	2	12	1610776	1610787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017486	CAAAAA	2	12	1637487	1637498	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017486	ATTTTT	2	12	1646128	1646139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017486	TAACAA	2	12	1652502	1652513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017486	TATGAA	2	12	1652910	1652921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017486	CTTTCT	2	12	1657108	1657119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017486	CATTTT	2	12	1661140	1661151	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017486	AAAATA	2	12	1684811	1684822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017486	TTAAAA	2	12	1685967	1685978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017486	TATTTT	2	12	1717872	1717883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017486	CATTTT	2	12	1820638	1820649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017486	ATTTTA	2	12	1836792	1836803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017486	TAAAAT	2	12	1841450	1841461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017486	TATTTT	2	12	1867390	1867401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017486	TAAAAA	2	12	1922220	1922231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017486	AAAATA	2	12	1939416	1939427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017486	TTATCT	2	12	1954431	1954442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017486	CTTCCA	2	12	1959053	1959064	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017486	TTTTCA	2	12	1968897	1968908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017486	ATTAAA	2	12	1976051	1976062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017486	TTTTTA	2	12	1989608	1989619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017486	TACAAA	2	12	1996863	1996874	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017486	TTTTTA	2	12	2031928	2031939	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017486	CTTCCA	2	12	2250153	2250164	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.