MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 1990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	AACTG	2	10	615	624	40 %	20 %	20 %	20 %	385829590
2	NC_017486	ATAAA	2	10	7401	7410	80 %	20 %	0 %	0 %	385829593
3	NC_017486	AAGAT	2	10	10187	10196	60 %	20 %	20 %	0 %	385829594
4	NC_017486	AGTAA	2	10	10330	10339	60 %	20 %	20 %	0 %	385829595
5	NC_017486	TAATA	2	10	10514	10523	60 %	40 %	0 %	0 %	385829595
6	NC_017486	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017486	ATTAA	2	10	12753	12762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017486	TATCA	2	10	12847	12856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017486	AATTT	2	10	13446	13455	40 %	60 %	0 %	0 %	385829599
10	NC_017486	ATAGG	2	10	13972	13981	40 %	20 %	40 %	0 %	385829599
11	NC_017486	ACTCT	2	10	14256	14265	20 %	40 %	0 %	40 %	385829599
12	NC_017486	TAAAT	2	10	15327	15336	60 %	40 %	0 %	0 %	385829600
13	NC_017486	ATTTT	2	10	17837	17846	20 %	80 %	0 %	0 %	385829603
14	NC_017486	AAATG	2	10	18075	18084	60 %	20 %	20 %	0 %	385829603
15	NC_017486	TACTT	2	10	19737	19746	20 %	60 %	0 %	20 %	385829603
16	NC_017486	TTTAG	2	10	21809	21818	20 %	60 %	20 %	0 %	385829606
17	NC_017486	CTATT	2	10	22427	22436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017486	ATGGA	2	10	22510	22519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017486	GGGTT	2	10	23105	23114	0 %	40 %	60 %	0 %	385829608
20	NC_017486	ATTTT	2	10	24742	24751	20 %	80 %	0 %	0 %	385829609
21	NC_017486	TTTGG	2	10	25596	25605	0 %	60 %	40 %	0 %	385829610
22	NC_017486	TGGTA	2	10	27537	27546	20 %	40 %	40 %	0 %	385829611
23	NC_017486	CTTAA	2	10	28595	28604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017486	AAGTC	2	10	28736	28745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017486	TTTTA	2	10	30084	30093	20 %	80 %	0 %	0 %	385829612
26	NC_017486	TAATC	2	10	35392	35401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017486	TCATT	2	10	37059	37068	20 %	60 %	0 %	20 %	385829617
28	NC_017486	CGTTT	2	10	37318	37327	0 %	60 %	20 %	20 %	385829617
29	NC_017486	ATTTT	2	10	37421	37430	20 %	80 %	0 %	0 %	385829617
30	NC_017486	CTTTC	2	10	38261	38270	0 %	60 %	0 %	40 %	385829618
31	NC_017486	CAATC	2	10	40118	40127	40 %	20 %	0 %	40 %	385829620
32	NC_017486	TGCCT	2	10	41116	41125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017486	CATGC	2	10	41662	41671	20 %	20 %	20 %	40 %	385829623
34	NC_017486	TTAAA	2	10	42158	42167	60 %	40 %	0 %	0 %	385829623
35	NC_017486	TACCC	2	10	42182	42191	20 %	20 %	0 %	60 %	385829623
36	NC_017486	TAACT	2	10	43583	43592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017486	ATGAA	2	10	45216	45225	60 %	20 %	20 %	0 %	385829629
38	NC_017486	TTTGA	2	10	45691	45700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017486	TTTTG	2	10	46174	46183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017486	AAAAT	2	10	46945	46954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017486	TGCCT	2	10	48494	48503	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017486	AATAA	2	10	49674	49683	80 %	20 %	0 %	0 %	385829635
43	NC_017486	ACTTT	2	10	50595	50604	20 %	60 %	0 %	20 %	385829636
44	NC_017486	GATTG	2	10	50856	50865	20 %	40 %	40 %	0 %	385829637
45	NC_017486	ATTCA	2	10	51932	51941	40 %	40 %	0 %	20 %	385829638
46	NC_017486	AAATT	2	10	52285	52294	60 %	40 %	0 %	0 %	385829638
47	NC_017486	GAAAT	2	10	52723	52732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017486	ATCAA	2	10	53261	53270	60 %	20 %	0 %	20 %	385829639
49	NC_017486	AGTAA	2	10	53757	53766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017486	GGATT	2	10	54574	54583	20 %	40 %	40 %	0 %	385829640
51	NC_017486	ATTAT	2	10	54742	54751	40 %	60 %	0 %	0 %	385829640
52	NC_017486	CTTAT	2	10	54935	54944	20 %	60 %	0 %	20 %	385829640
53	NC_017486	ATAGA	2	10	56333	56342	60 %	20 %	20 %	0 %	385829642
54	NC_017486	TTTAT	2	10	57089	57098	20 %	80 %	0 %	0 %	385829643
55	NC_017486	TTTGG	2	10	59145	59154	0 %	60 %	40 %	0 %	385829644
56	NC_017486	TCATC	2	10	59194	59203	20 %	40 %	0 %	40 %	385829644
57	NC_017486	CTTAT	2	10	59271	59280	20 %	60 %	0 %	20 %	385829644
58	NC_017486	TATTG	2	10	60642	60651	20 %	60 %	20 %	0 %	385829645
59	NC_017486	TTTAA	2	10	60775	60784	40 %	60 %	0 %	0 %	385829645
60	NC_017486	TTAAT	2	10	61761	61770	40 %	60 %	0 %	0 %	385829646
61	NC_017486	CAAAA	2	10	62954	62963	80 %	0 %	0 %	20 %	385829647
62	NC_017486	TAGTA	2	10	63232	63241	40 %	40 %	20 %	0 %	385829647
63	NC_017486	GCTTG	2	10	63848	63857	0 %	40 %	40 %	20 %	385829648
64	NC_017486	TCCAT	2	10	64199	64208	20 %	40 %	0 %	40 %	385829648
65	NC_017486	GGCTT	2	10	66977	66986	0 %	40 %	40 %	20 %	385829650
66	NC_017486	AATTA	2	10	67481	67490	60 %	40 %	0 %	0 %	385829651
67	NC_017486	GTTTT	2	10	68094	68103	0 %	80 %	20 %	0 %	385829652
68	NC_017486	TTTCA	2	10	68137	68146	20 %	60 %	0 %	20 %	385829652
69	NC_017486	ATTCA	2	10	69393	69402	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017486	AAATT	2	10	69734	69743	60 %	40 %	0 %	0 %	385829653
71	NC_017486	CTTAA	2	10	70008	70017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017486	GGTTC	2	10	71157	71166	0 %	40 %	40 %	20 %	385829654
73	NC_017486	CTTTA	2	10	71192	71201	20 %	60 %	0 %	20 %	385829654
74	NC_017486	ATTTT	2	10	71365	71374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017486	CAAAT	2	10	72828	72837	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017486	AGTTT	2	10	75674	75683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017486	AATAA	2	10	75828	75837	80 %	20 %	0 %	0 %	385829658
78	NC_017486	AATCA	2	10	76561	76570	60 %	20 %	0 %	20 %	385829659
79	NC_017486	CCATT	2	10	78647	78656	20 %	40 %	0 %	40 %	385829660
80	NC_017486	TGAAA	2	10	78866	78875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017486	GAAGT	2	10	79369	79378	40 %	20 %	40 %	0 %	385829661
82	NC_017486	ATGAT	2	10	80382	80391	40 %	40 %	20 %	0 %	385829663
83	NC_017486	TGGTT	2	10	81378	81387	0 %	60 %	40 %	0 %	385829664
84	NC_017486	GTAAA	2	10	83874	83883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017486	TTACT	2	10	84352	84361	20 %	60 %	0 %	20 %	385829670
86	NC_017486	ATTTA	2	10	86130	86139	40 %	60 %	0 %	0 %	385829671
87	NC_017486	TTTTA	2	10	88956	88965	20 %	80 %	0 %	0 %	385829674
88	NC_017486	AAAGA	2	10	92767	92776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017486	TCAAG	2	10	93752	93761	40 %	20 %	20 %	20 %	385829680
90	NC_017486	GTTTG	2	10	94390	94399	0 %	60 %	40 %	0 %	385829680
91	NC_017486	ATAGA	2	10	94624	94633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017486	ATCTT	2	10	97951	97960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017486	TAGCT	2	10	98451	98460	20 %	40 %	20 %	20 %	385829683
94	NC_017486	AGTTG	2	10	98505	98514	20 %	40 %	40 %	0 %	385829683
95	NC_017486	TAAAA	2	10	98626	98635	80 %	20 %	0 %	0 %	385829684
96	NC_017486	CAGGT	2	10	100461	100470	20 %	20 %	40 %	20 %	385829686
97	NC_017486	TCTGG	2	10	101001	101010	0 %	40 %	40 %	20 %	385829686
98	NC_017486	TATGA	2	10	101858	101867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017486	GTTTG	2	10	102054	102063	0 %	60 %	40 %	0 %	385829687
100	NC_017486	TTTAC	2	10	105164	105173	20 %	60 %	0 %	20 %	385829690
101	NC_017486	ACAAT	2	10	105955	105964	60 %	20 %	0 %	20 %	385829690
102	NC_017486	GATTT	2	10	106026	106035	20 %	60 %	20 %	0 %	385829690
103	NC_017486	CTAAT	2	10	110259	110268	40 %	40 %	0 %	20 %	385829694
104	NC_017486	AATAG	2	10	111309	111318	60 %	20 %	20 %	0 %	385829696
105	NC_017486	TGACC	2	10	111919	111928	20 %	20 %	20 %	40 %	385829696
106	NC_017486	TATTC	2	10	112523	112532	20 %	60 %	0 %	20 %	385829697
107	NC_017486	TTTTA	2	10	113256	113265	20 %	80 %	0 %	0 %	385829698
108	NC_017486	TGGAT	2	10	114380	114389	20 %	40 %	40 %	0 %	385829699
109	NC_017486	ATCTT	2	10	115838	115847	20 %	60 %	0 %	20 %	385829700
110	NC_017486	GAAAA	2	10	117289	117298	80 %	0 %	20 %	0 %	385829701
111	NC_017486	CCAAA	2	10	118117	118126	60 %	0 %	0 %	40 %	385829701
112	NC_017486	TGGCT	2	10	119079	119088	0 %	40 %	40 %	20 %	385829703
113	NC_017486	GCCAT	2	10	119279	119288	20 %	20 %	20 %	40 %	385829703
114	NC_017486	CAAAT	2	10	119658	119667	60 %	20 %	0 %	20 %	385829704
115	NC_017486	TTTTA	2	10	120260	120269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017486	TAAAA	2	10	124121	124130	80 %	20 %	0 %	0 %	385829710
117	NC_017486	CGTCG	2	10	128107	128116	0 %	20 %	40 %	40 %	385829716
118	NC_017486	ATAAA	2	10	129477	129486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017486	ACCAA	2	10	129537	129546	60 %	0 %	0 %	40 %	385829717
120	NC_017486	TGTAT	2	10	130206	130215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017486	ACAAA	2	10	132493	132502	80 %	0 %	0 %	20 %	385829718
122	NC_017486	AAATT	2	10	133342	133351	60 %	40 %	0 %	0 %	385829718
123	NC_017486	GCAAA	2	10	133564	133573	60 %	0 %	20 %	20 %	385829718
124	NC_017486	AATAC	2	10	134331	134340	60 %	20 %	0 %	20 %	385829718
125	NC_017486	AATAC	2	10	134616	134625	60 %	20 %	0 %	20 %	385829718
126	NC_017486	AAGTC	2	10	137412	137421	40 %	20 %	20 %	20 %	385829719
127	NC_017486	TGTTT	2	10	138701	138710	0 %	80 %	20 %	0 %	385829720
128	NC_017486	GCTTT	2	10	142136	142145	0 %	60 %	20 %	20 %	385829725
129	NC_017486	TGTCA	2	10	143231	143240	20 %	40 %	20 %	20 %	385829726
130	NC_017486	TTTAT	2	10	143247	143256	20 %	80 %	0 %	0 %	385829726
131	NC_017486	TAATT	2	10	144784	144793	40 %	60 %	0 %	0 %	385829727
132	NC_017486	ACGGA	2	10	149119	149128	40 %	0 %	40 %	20 %	385829731
133	NC_017486	TGGTT	2	10	149948	149957	0 %	60 %	40 %	0 %	385829731
134	NC_017486	TTTTG	2	10	150233	150242	0 %	80 %	20 %	0 %	385829732
135	NC_017486	GAATT	2	10	151192	151201	40 %	40 %	20 %	0 %	385829733
136	NC_017486	AAATC	2	10	151905	151914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017486	TGAAA	2	10	152268	152277	60 %	20 %	20 %	0 %	385829734
138	NC_017486	AATTT	2	10	153955	153964	40 %	60 %	0 %	0 %	385829736
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