MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017486	ATTAA	2	10	12753	12762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017486	TATCA	2	10	12847	12856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017486	CTATT	2	10	22427	22436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017486	ATGGA	2	10	22510	22519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017486	CTTAA	2	10	28595	28604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017486	AAGTC	2	10	28736	28745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017486	TAATC	2	10	35392	35401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017486	TGCCT	2	10	41116	41125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017486	TAACT	2	10	43583	43592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017486	TTTGA	2	10	45691	45700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017486	TTTTG	2	10	46174	46183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017486	AAAAT	2	10	46945	46954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017486	TGCCT	2	10	48494	48503	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017486	GAAAT	2	10	52723	52732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017486	AGTAA	2	10	53757	53766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017486	ATTCA	2	10	69393	69402	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017486	CTTAA	2	10	70008	70017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017486	ATTTT	2	10	71365	71374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017486	CAAAT	2	10	72828	72837	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017486	AGTTT	2	10	75674	75683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017486	TGAAA	2	10	78866	78875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017486	GTAAA	2	10	83874	83883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017486	AAAGA	2	10	92767	92776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017486	ATAGA	2	10	94624	94633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017486	ATCTT	2	10	97951	97960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017486	TATGA	2	10	101858	101867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017486	TTTTA	2	10	120260	120269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017486	ATAAA	2	10	129477	129486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017486	TGTAT	2	10	130206	130215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017486	AAATC	2	10	151905	151914	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017486	TTTGA	2	10	155812	155821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017486	ATGAA	2	10	157230	157239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017486	TATAA	2	10	160060	160069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017486	AGGAA	2	10	175890	175899	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017486	TAAAA	2	10	178613	178622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017486	AAAGT	2	10	180734	180743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017486	AAAAG	2	10	218463	218472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017486	ATAAA	2	10	224484	224493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017486	CTAGT	2	10	224899	224908	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017486	GATTG	2	10	226286	226295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017486	TTTGG	2	10	227475	227484	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017486	TGAAT	2	10	230499	230508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017486	GCTCT	2	10	240304	240313	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017486	TTCCT	2	10	257877	257886	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017486	AATAA	2	10	257897	257906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017486	TTTGC	2	10	258075	258084	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017486	CAAAG	2	10	261881	261890	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017486	TGTTT	2	10	263443	263452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017486	TTTAC	2	10	270815	270824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017486	AAATA	2	10	271521	271530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017486	ATAAA	2	10	275109	275118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017486	ATTTT	2	10	278907	278916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017486	AAAAT	2	10	300727	300736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017486	GATAA	2	10	302463	302472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017486	TAAAA	2	10	303387	303396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017486	TAAAA	2	10	311530	311539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017486	CCTTT	2	10	327747	327756	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017486	TAAAA	2	10	328436	328445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017486	ATTGT	2	10	328464	328473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017486	TTATA	2	10	349181	349190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017486	CTTTC	2	10	352895	352904	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017486	TATAA	2	10	358903	358912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017486	TATTT	2	10	386507	386516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017486	TTATA	2	10	388849	388858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017486	TTAAA	2	10	393935	393944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017486	CAAAT	2	10	397207	397216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017486	TATAA	2	10	400628	400637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017486	CTTAT	2	10	407201	407210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017486	TTTTA	2	10	429507	429516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017486	TATAG	2	10	440542	440551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017486	TAAAA	2	10	450845	450854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017486	ATAAA	2	10	467222	467231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017486	AGGAG	2	10	471247	471256	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017486	TCGTG	2	10	471657	471666	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017486	AGGGA	2	10	475165	475174	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017486	TGTAG	2	10	475643	475652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017486	TGTAA	2	10	481245	481254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017486	ATATT	2	10	482806	482815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017486	TTTTA	2	10	482940	482949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017486	TAAAA	2	10	482988	482997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017486	TATAA	2	10	491324	491333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017486	GATAG	2	10	493822	493831	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017486	TTATT	2	10	494151	494160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017486	GGAAA	2	10	511719	511728	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017486	TAAAA	2	10	511800	511809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017486	TAAAA	2	10	511873	511882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017486	TAAAA	2	10	514971	514980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017486	ATGTA	2	10	515795	515804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017486	TCATT	2	10	516867	516876	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017486	CCAAA	2	10	529602	529611	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017486	CAATG	2	10	529733	529742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017486	AATTC	2	10	531240	531249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017486	ATTTG	2	10	532951	532960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017486	AAAAT	2	10	537483	537492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017486	TTTTA	2	10	544720	544729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017486	TATTT	2	10	547038	547047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017486	AATTG	2	10	553461	553470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017486	AATTA	2	10	565292	565301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017486	AAAGG	2	10	565307	565316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017486	AATTT	2	10	588556	588565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017486	TGTTA	2	10	594720	594729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017486	TTTGT	2	10	597398	597407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017486	AAAAG	2	10	599861	599870	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017486	TAAAG	2	10	601436	601445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017486	TATAA	2	10	602208	602217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017486	ATAAA	2	10	615950	615959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017486	TTTTC	2	10	618175	618184	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017486	TAAAA	2	10	625422	625431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017486	TTTTA	2	10	625538	625547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017486	TAAAA	2	10	625637	625646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017486	AAAAT	2	10	625853	625862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017486	GAATT	2	10	626000	626009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017486	GGTAA	2	10	626454	626463	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017486	TGAGG	2	10	633404	633413	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017486	AAAAT	2	10	640595	640604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017486	TAAAT	2	10	644920	644929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017486	AAAAT	2	10	644941	644950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017486	ATGCT	2	10	649328	649337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017486	TTTAA	2	10	649678	649687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017486	ATTTT	2	10	655461	655470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017486	AGCGT	2	10	655536	655545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017486	AGGGT	2	10	657792	657801	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017486	TATAG	2	10	658259	658268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017486	GATAT	2	10	667089	667098	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017486	TAAAA	2	10	680900	680909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017486	TATAA	2	10	685432	685441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017486	AAACA	2	10	685456	685465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017486	TTATT	2	10	687524	687533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017486	ATTTT	2	10	690256	690265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017486	GCTTT	2	10	705372	705381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017486	ATTTA	2	10	707706	707715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017486	ATTTT	2	10	707872	707881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017486	ATAAA	2	10	711165	711174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017486	ATTTC	2	10	712225	712234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017486	AAAAT	2	10	713212	713221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017486	AAGAA	2	10	716645	716654	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017486	GGTTT	2	10	717192	717201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017486	ATTAA	2	10	736146	736155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017486	AATAT	2	10	737701	737710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017486	TTGTC	2	10	737723	737732	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017486	TAAAA	2	10	737747	737756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017486	AAAGG	2	10	742862	742871	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017486	TTAAT	2	10	749988	749997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017486	TATTT	2	10	751035	751044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017486	ATAAA	2	10	754897	754906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017486	CGTAG	2	10	765916	765925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017486	TGAAA	2	10	766574	766583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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