MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 4794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	TTA	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017486	AAT	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017486	TAA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017486	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017486	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017486	CTA	3	9	1833	1841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017486	TAT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017486	GGT	2	6	10924	10929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017486	TGA	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017486	GAA	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017486	GAA	2	6	12857	12862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017486	AGG	2	6	12912	12917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017486	TGA	2	6	15914	15919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017486	CTC	2	6	15960	15965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017486	TAA	2	6	15985	15990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017486	AGA	2	6	16574	16579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017486	TAA	2	6	20708	20713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017486	TAA	2	6	21305	21310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017486	ATG	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017486	TTA	3	9	21335	21343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017486	ATC	2	6	21663	21668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017486	TAT	2	6	22405	22410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017486	ACA	2	6	22493	22498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017486	ATT	2	6	22502	22507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017486	TTA	2	6	25808	25813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017486	AAG	2	6	25825	25830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017486	TAA	3	9	25848	25856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017486	GAC	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017486	TTA	2	6	28076	28081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017486	ATT	2	6	28094	28099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017486	ATA	2	6	28147	28152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017486	CAA	2	6	28176	28181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017486	CGG	2	6	28224	28229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017486	GGA	2	6	28264	28269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017486	TCC	2	6	28347	28352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017486	AGC	2	6	28374	28379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017486	TCG	2	6	28388	28393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017486	CGG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017486	GTA	2	6	28827	28832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017486	ATG	2	6	28850	28855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017486	TGA	2	6	34641	34646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017486	TTA	2	6	34714	34719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017486	CAG	2	6	34934	34939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017486	AAG	2	6	34955	34960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017486	CCA	2	6	34994	34999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017486	TAA	2	6	35026	35031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017486	TAA	2	6	35038	35043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017486	TAA	2	6	35127	35132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017486	GAT	2	6	35333	35338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017486	TAA	2	6	35432	35437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017486	TAA	3	9	35492	35500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017486	TCA	3	9	35685	35693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017486	TTC	2	6	35747	35752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017486	TCT	2	6	35877	35882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017486	GTA	2	6	37446	37451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017486	GTA	2	6	37456	37461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017486	ACA	2	6	37471	37476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017486	CTG	2	6	40728	40733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017486	ATC	2	6	40768	40773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017486	TGG	2	6	40840	40845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017486	TAA	2	6	41106	41111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017486	TTA	2	6	41346	41351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017486	TCA	2	6	41367	41372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017486	GTC	2	6	41405	41410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017486	CCT	2	6	41423	41428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017486	TCA	2	6	41522	41527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017486	ACT	2	6	41539	41544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017486	TAG	2	6	43411	43416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017486	CTT	2	6	43430	43435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017486	CTT	2	6	43452	43457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017486	TAT	2	6	43479	43484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017486	CTG	2	6	43539	43544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017486	AAG	2	6	43558	43563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017486	ATA	2	6	43615	43620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017486	AAT	2	6	43651	43656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017486	GAA	2	6	44642	44647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017486	TGT	2	6	44673	44678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017486	TGT	2	6	44800	44805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017486	TAA	2	6	44902	44907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017486	TAT	2	6	44943	44948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017486	TTG	2	6	44961	44966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017486	TTG	2	6	44993	44998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017486	AGG	2	6	45037	45042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017486	ATA	2	6	45397	45402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017486	TAT	2	6	45467	45472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017486	ACA	2	6	45723	45728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017486	CAA	2	6	46060	46065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017486	GTT	2	6	46090	46095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017486	GTT	3	9	46345	46353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017486	TCC	2	6	46399	46404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017486	TAT	2	6	46433	46438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017486	TAT	2	6	46453	46458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017486	AAT	2	6	46819	46824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017486	AAT	2	6	46900	46905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017486	TAA	2	6	46984	46989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017486	ACA	2	6	47138	47143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017486	GTT	2	6	47278	47283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017486	CCG	2	6	47347	47352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017486	TAC	2	6	47417	47422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017486	GAG	2	6	47520	47525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017486	ATC	2	6	47613	47618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017486	CCA	2	6	47890	47895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017486	ATT	2	6	47909	47914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017486	AGG	2	6	47971	47976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017486	CTT	2	6	48321	48326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017486	ATA	2	6	48399	48404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017486	TAA	2	6	48423	48428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017486	TAA	2	6	48439	48444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017486	TAA	2	6	48465	48470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017486	GAA	2	6	48526	48531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017486	TAA	2	6	49739	49744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017486	TAA	2	6	49751	49756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017486	TTA	2	6	49822	49827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017486	AAT	2	6	49880	49885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017486	AAT	2	6	50036	50041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017486	AAC	2	6	50638	50643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017486	ATT	2	6	51007	51012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017486	AAT	2	6	52707	52712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017486	AGA	2	6	52803	52808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017486	ATG	2	6	52821	52826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017486	TTA	2	6	52836	52841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017486	ATA	2	6	53429	53434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017486	TAA	2	6	53467	53472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017486	TAC	2	6	53557	53562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017486	ATA	2	6	53785	53790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017486	AGA	2	6	55056	55061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017486	ATA	2	6	56940	56945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017486	GGA	2	6	56954	56959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017486	TCA	2	6	56963	56968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017486	ATT	2	6	59592	59597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017486	TAA	2	6	61152	61157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017486	TAA	2	6	61193	61198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017486	TTA	2	6	61218	61223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017486	TTA	2	6	69167	69172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017486	ACC	2	6	69219	69224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017486	TTG	2	6	69260	69265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017486	AGG	2	6	69427	69432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017486	AAT	2	6	69947	69952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017486	GAA	2	6	71378	71383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017486	GTT	2	6	71435	71440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017486	AAT	2	6	71456	71461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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