MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	AAAGTT	2	12	128	139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017484	TAAAGG	2	12	1280	1291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385829560
3	NC_017484	GTTTGA	2	12	3556	3567	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385829562
4	NC_017484	TTTCTT	2	12	3853	3864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385829562
5	NC_017484	TATTTT	2	12	5257	5268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017484	TCATTG	2	12	5728	5739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385829565
7	NC_017484	GTTTTT	2	12	6457	6468	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385829565
8	NC_017484	CAATGA	2	12	7588	7599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385829566
9	NC_017484	CTTTAG	2	12	9881	9892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385829571
10	NC_017484	GAAAAG	2	12	10871	10882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829571
11	NC_017484	AATAAA	2	12	13561	13572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385829573
12	NC_017484	TTACTA	2	12	16083	16094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385829575
13	NC_017484	AAGTGC	2	12	17167	17178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385829575
14	NC_017484	CTAAAT	2	12	19270	19281	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385829576
15	NC_017484	GAAAAA	2	12	21110	21121	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385829577
16	NC_017484	ATAAAA	2	12	23831	23842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385829579
17	NC_017484	ATAAAG	2	12	26042	26053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385829581
18	NC_017484	TCAGTT	2	12	30201	30212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385829587
19	NC_017484	GAAAAA	2	12	31113	31124	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.