MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	AAATC	2	10	21	30	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017484	CATAA	2	10	163	172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017484	TCAAT	2	10	611	620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017484	AGAAA	2	10	1030	1039	80 %	0 %	20 %	0 %	385829560
5	NC_017484	ATAAA	2	10	2816	2825	80 %	20 %	0 %	0 %	385829561
6	NC_017484	TTTTG	2	10	3397	3406	0 %	80 %	20 %	0 %	385829562
7	NC_017484	CCGTT	2	10	4681	4690	0 %	40 %	20 %	40 %	385829562
8	NC_017484	ATTTT	2	10	5230	5239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017484	TATTT	2	10	6326	6335	20 %	80 %	0 %	0 %	385829565
10	NC_017484	TTGTT	2	10	6638	6647	0 %	80 %	20 %	0 %	385829565
11	NC_017484	TCTTT	2	10	7662	7671	0 %	80 %	0 %	20 %	385829566
12	NC_017484	TGGTT	2	10	7751	7760	0 %	60 %	40 %	0 %	385829566
13	NC_017484	TGCTT	2	10	15298	15307	0 %	60 %	20 %	20 %	385829575
14	NC_017484	TAACT	2	10	18289	18298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017484	TTAAC	2	10	18364	18373	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017484	TTGGA	2	10	18883	18892	20 %	40 %	40 %	0 %	385829576
17	NC_017484	TACAA	2	10	22969	22978	60 %	20 %	0 %	20 %	385829578
18	NC_017484	ATTAA	2	10	23186	23195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017484	AATTA	2	10	26661	26670	60 %	40 %	0 %	0 %	385829583
20	NC_017484	AGAAA	2	10	26872	26881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017484	TACGG	2	10	28982	28991	20 %	20 %	40 %	20 %	385829587
22	NC_017484	AATCC	2	10	29238	29247	40 %	20 %	0 %	40 %	385829587
23	NC_017484	GTCAA	2	10	29775	29784	40 %	20 %	20 %	20 %	385829587
24	NC_017484	ATTCT	2	10	30894	30903	20 %	60 %	0 %	20 %	385829587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.