MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	GAAA	2	8	1019	1026	75 %	0 %	25 %	0 %	385829560
2	NC_017484	ATTT	2	8	1158	1165	25 %	75 %	0 %	0 %	385829560
3	NC_017484	CGGA	2	8	1523	1530	25 %	0 %	50 %	25 %	385829560
4	NC_017484	ATGA	2	8	1902	1909	50 %	25 %	25 %	0 %	385829560
5	NC_017484	ATTC	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	385829561
6	NC_017484	TTTC	2	8	3814	3821	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
7	NC_017484	CTTT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
8	NC_017484	GTTT	2	8	4135	4142	0 %	75 %	25 %	0 %	385829562
9	NC_017484	GGAC	2	8	4218	4225	25 %	0 %	50 %	25 %	385829562
10	NC_017484	TTTC	2	8	4267	4274	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
11	NC_017484	ATTT	2	8	4306	4313	25 %	75 %	0 %	0 %	385829562
12	NC_017484	TGAA	2	8	4574	4581	50 %	25 %	25 %	0 %	385829562
13	NC_017484	TGAT	2	8	4853	4860	25 %	50 %	25 %	0 %	385829563
14	NC_017484	TTTC	2	8	5001	5008	0 %	75 %	0 %	25 %	385829563
15	NC_017484	TCAC	2	8	5205	5212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017484	AATT	2	8	5333	5340	50 %	50 %	0 %	0 %	385829564
17	NC_017484	ATTT	2	8	5534	5541	25 %	75 %	0 %	0 %	385829564
18	NC_017484	TTCT	2	8	5719	5726	0 %	75 %	0 %	25 %	385829565
19	NC_017484	AATT	2	8	5792	5799	50 %	50 %	0 %	0 %	385829565
20	NC_017484	TTTC	2	8	6079	6086	0 %	75 %	0 %	25 %	385829565
21	NC_017484	TTTG	2	8	7046	7053	0 %	75 %	25 %	0 %	385829566
22	NC_017484	GCTT	2	8	7059	7066	0 %	50 %	25 %	25 %	385829566
23	NC_017484	GCTT	2	8	7083	7090	0 %	50 %	25 %	25 %	385829566
24	NC_017484	TTGT	2	8	7094	7101	0 %	75 %	25 %	0 %	385829566
25	NC_017484	TTTG	2	8	7109	7116	0 %	75 %	25 %	0 %	385829566
26	NC_017484	CTTT	2	8	7278	7285	0 %	75 %	0 %	25 %	385829566
27	NC_017484	TTTA	2	8	7358	7365	25 %	75 %	0 %	0 %	385829566
28	NC_017484	GATT	4	16	7561	7576	25 %	50 %	25 %	0 %	385829566
29	NC_017484	TGAT	2	8	7627	7634	25 %	50 %	25 %	0 %	385829566
30	NC_017484	TAAC	2	8	7921	7928	50 %	25 %	0 %	25 %	385829566
31	NC_017484	TTAA	2	8	7929	7936	50 %	50 %	0 %	0 %	385829566
32	NC_017484	TTGA	2	8	8276	8283	25 %	50 %	25 %	0 %	385829567
33	NC_017484	TTAA	2	8	8319	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	385829567
34	NC_017484	TTCT	2	8	8335	8342	0 %	75 %	0 %	25 %	385829567
35	NC_017484	ATTT	2	8	8361	8368	25 %	75 %	0 %	0 %	385829567
36	NC_017484	AATT	2	8	8462	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	385829568
37	NC_017484	ATTT	2	8	8736	8743	25 %	75 %	0 %	0 %	385829569
38	NC_017484	ATTG	2	8	8836	8843	25 %	50 %	25 %	0 %	385829569
39	NC_017484	TTTG	2	8	8895	8902	0 %	75 %	25 %	0 %	385829569
40	NC_017484	AATA	2	8	9660	9667	75 %	25 %	0 %	0 %	385829571
41	NC_017484	ATTG	2	8	10383	10390	25 %	50 %	25 %	0 %	385829571
42	NC_017484	ATTG	2	8	10657	10664	25 %	50 %	25 %	0 %	385829571
43	NC_017484	CTTG	2	8	10926	10933	0 %	50 %	25 %	25 %	385829571
44	NC_017484	CTTT	2	8	11135	11142	0 %	75 %	0 %	25 %	385829571
45	NC_017484	ATCT	2	8	11447	11454	25 %	50 %	0 %	25 %	385829571
46	NC_017484	GTCC	2	8	12349	12356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017484	AAAC	2	8	12958	12965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017484	TAAA	2	8	13745	13752	75 %	25 %	0 %	0 %	385829573
49	NC_017484	TAGA	2	8	14047	14054	50 %	25 %	25 %	0 %	385829574
50	NC_017484	AATT	2	8	14083	14090	50 %	50 %	0 %	0 %	385829574
51	NC_017484	TAAG	2	8	14754	14761	50 %	25 %	25 %	0 %	385829575
52	NC_017484	TAAT	2	8	14895	14902	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
53	NC_017484	TTTA	2	8	15312	15319	25 %	75 %	0 %	0 %	385829575
54	NC_017484	CAAT	2	8	15377	15384	50 %	25 %	0 %	25 %	385829575
55	NC_017484	TAAT	2	8	15714	15721	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
56	NC_017484	ATTA	2	8	15730	15737	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
57	NC_017484	AAAC	2	8	15754	15761	75 %	0 %	0 %	25 %	385829575
58	NC_017484	CAGT	2	8	16403	16410	25 %	25 %	25 %	25 %	385829575
59	NC_017484	ATTA	2	8	16411	16418	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
60	NC_017484	ATTC	2	8	16511	16518	25 %	50 %	0 %	25 %	385829575
61	NC_017484	CTAT	2	8	16557	16564	25 %	50 %	0 %	25 %	385829575
62	NC_017484	GTAA	2	8	17382	17389	50 %	25 %	25 %	0 %	385829575
63	NC_017484	CAAA	2	8	17879	17886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017484	TAAA	2	8	17940	17947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017484	ATTT	2	8	18457	18464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017484	AAAT	2	8	18525	18532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017484	TTGA	2	8	18687	18694	25 %	50 %	25 %	0 %	385829576
68	NC_017484	CTTT	2	8	19018	19025	0 %	75 %	0 %	25 %	385829576
69	NC_017484	GATT	2	8	19445	19452	25 %	50 %	25 %	0 %	385829576
70	NC_017484	CTTC	2	8	19473	19480	0 %	50 %	0 %	50 %	385829576
71	NC_017484	TATT	2	8	19597	19604	25 %	75 %	0 %	0 %	385829576
72	NC_017484	TTGA	2	8	19892	19899	25 %	50 %	25 %	0 %	385829576
73	NC_017484	TGGT	2	8	19940	19947	0 %	50 %	50 %	0 %	385829576
74	NC_017484	TTGA	2	8	19949	19956	25 %	50 %	25 %	0 %	385829576
75	NC_017484	TTTC	2	8	20077	20084	0 %	75 %	0 %	25 %	385829576
76	NC_017484	GGCT	2	8	20363	20370	0 %	25 %	50 %	25 %	385829576
77	NC_017484	AATG	2	8	20756	20763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017484	TCTA	2	8	20774	20781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017484	TTGA	2	8	21417	21424	25 %	50 %	25 %	0 %	385829577
80	NC_017484	TTTA	2	8	21634	21641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017484	TGTA	2	8	21662	21669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017484	TTAT	2	8	21710	21717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017484	ATTA	2	8	21920	21927	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
84	NC_017484	TTAT	2	8	21985	21992	25 %	75 %	0 %	0 %	385829578
85	NC_017484	ATAA	2	8	22128	22135	75 %	25 %	0 %	0 %	385829578
86	NC_017484	AATT	2	8	22189	22196	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
87	NC_017484	AACA	2	8	22297	22304	75 %	0 %	0 %	25 %	385829578
88	NC_017484	TAGC	2	8	22777	22784	25 %	25 %	25 %	25 %	385829578
89	NC_017484	TGGG	2	8	22885	22892	0 %	25 %	75 %	0 %	385829578
90	NC_017484	TTAC	2	8	23030	23037	25 %	50 %	0 %	25 %	385829578
91	NC_017484	CTAT	2	8	23204	23211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017484	TGAG	2	8	23511	23518	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017484	TTTG	2	8	24353	24360	0 %	75 %	25 %	0 %	385829580
94	NC_017484	TGAT	2	8	24400	24407	25 %	50 %	25 %	0 %	385829580
95	NC_017484	AATG	2	8	24656	24663	50 %	25 %	25 %	0 %	385829580
96	NC_017484	CTTT	2	8	25165	25172	0 %	75 %	0 %	25 %	385829580
97	NC_017484	CATG	2	8	25779	25786	25 %	25 %	25 %	25 %	385829581
98	NC_017484	GTTT	2	8	25866	25873	0 %	75 %	25 %	0 %	385829581
99	NC_017484	TACT	2	8	26204	26211	25 %	50 %	0 %	25 %	385829582
100	NC_017484	ATTA	2	8	26921	26928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017484	TCGA	2	8	27494	27501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017484	AATT	2	8	27699	27706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017484	TATC	2	8	28422	28429	25 %	50 %	0 %	25 %	385829586
104	NC_017484	CTTT	2	8	28837	28844	0 %	75 %	0 %	25 %	385829587
105	NC_017484	AAGT	2	8	29150	29157	50 %	25 %	25 %	0 %	385829587
106	NC_017484	TCCC	2	8	29182	29189	0 %	25 %	0 %	75 %	385829587
107	NC_017484	CATT	2	8	29428	29435	25 %	50 %	0 %	25 %	385829587
108	NC_017484	AACC	2	8	29552	29559	50 %	0 %	0 %	50 %	385829587
109	NC_017484	TACA	2	8	29579	29586	50 %	25 %	0 %	25 %	385829587
110	NC_017484	TTGC	2	8	29635	29642	0 %	50 %	25 %	25 %	385829587
111	NC_017484	TTAT	2	8	29850	29857	25 %	75 %	0 %	0 %	385829587
112	NC_017484	CCAA	2	8	30392	30399	50 %	0 %	0 %	50 %	385829587
113	NC_017484	GAAT	2	8	30720	30727	50 %	25 %	25 %	0 %	385829587
114	NC_017484	TCTT	2	8	30820	30827	0 %	75 %	0 %	25 %	385829587
115	NC_017484	CTGC	2	8	30952	30959	0 %	25 %	25 %	50 %	385829587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.