MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017484	AT	4	8	698	705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017484	GT	3	6	1008	1013	0 %	50 %	50 %	0 %	385829560
4	NC_017484	GA	3	6	1529	1534	50 %	0 %	50 %	0 %	385829560
5	NC_017484	AT	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	385829561
6	NC_017484	TA	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	385829562
7	NC_017484	TA	3	6	5439	5444	50 %	50 %	0 %	0 %	385829564
8	NC_017484	CT	3	6	5994	5999	0 %	50 %	0 %	50 %	385829565
9	NC_017484	GT	3	6	6257	6262	0 %	50 %	50 %	0 %	385829565
10	NC_017484	TC	3	6	6354	6359	0 %	50 %	0 %	50 %	385829565
11	NC_017484	TG	3	6	6984	6989	0 %	50 %	50 %	0 %	385829566
12	NC_017484	AT	5	10	9234	9243	50 %	50 %	0 %	0 %	385829570
13	NC_017484	AT	3	6	9336	9341	50 %	50 %	0 %	0 %	385829570
14	NC_017484	AT	3	6	9772	9777	50 %	50 %	0 %	0 %	385829571
15	NC_017484	CA	3	6	10122	10127	50 %	0 %	0 %	50 %	385829571
16	NC_017484	TG	3	6	10598	10603	0 %	50 %	50 %	0 %	385829571
17	NC_017484	AC	3	6	10823	10828	50 %	0 %	0 %	50 %	385829571
18	NC_017484	TA	3	6	11515	11520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017484	AG	3	6	12427	12432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017484	GA	3	6	12547	12552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017484	TA	3	6	12946	12951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017484	AT	3	6	13228	13233	50 %	50 %	0 %	0 %	385829572
23	NC_017484	TC	4	8	14590	14597	0 %	50 %	0 %	50 %	385829575
24	NC_017484	AT	3	6	15640	15645	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
25	NC_017484	TC	3	6	15812	15817	0 %	50 %	0 %	50 %	385829575
26	NC_017484	AT	3	6	16582	16587	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
27	NC_017484	TA	3	6	16788	16793	50 %	50 %	0 %	0 %	385829575
28	NC_017484	GC	3	6	16840	16845	0 %	0 %	50 %	50 %	385829575
29	NC_017484	CA	3	6	17062	17067	50 %	0 %	0 %	50 %	385829575
30	NC_017484	AG	3	6	17124	17129	50 %	0 %	50 %	0 %	385829575
31	NC_017484	TC	4	8	18253	18260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017484	TA	4	8	20780	20787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017484	AC	3	6	21250	21255	50 %	0 %	0 %	50 %	385829577
34	NC_017484	TA	3	6	21520	21525	50 %	50 %	0 %	0 %	385829577
35	NC_017484	CT	3	6	21547	21552	0 %	50 %	0 %	50 %	385829577
36	NC_017484	AG	3	6	21876	21881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017484	AT	3	6	22107	22112	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
38	NC_017484	TA	3	6	22245	22250	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
39	NC_017484	AT	3	6	22252	22257	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
40	NC_017484	TA	3	6	22459	22464	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
41	NC_017484	AT	4	8	22704	22711	50 %	50 %	0 %	0 %	385829578
42	NC_017484	TA	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017484	CT	3	6	24763	24768	0 %	50 %	0 %	50 %	385829580
44	NC_017484	AT	3	6	25260	25265	50 %	50 %	0 %	0 %	385829580
45	NC_017484	AT	3	6	25324	25329	50 %	50 %	0 %	0 %	385829580
46	NC_017484	AT	3	6	26317	26322	50 %	50 %	0 %	0 %	385829582
47	NC_017484	TA	3	6	26378	26383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017484	AT	3	6	26575	26580	50 %	50 %	0 %	0 %	385829583
49	NC_017484	AT	3	6	26620	26625	50 %	50 %	0 %	0 %	385829583
50	NC_017484	CT	3	6	26751	26756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017484	TA	4	8	27011	27018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017484	TA	3	6	27257	27262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017484	TA	3	6	27777	27782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017484	AC	4	8	28042	28049	50 %	0 %	0 %	50 %	385829586
55	NC_017484	GA	3	6	28868	28873	50 %	0 %	50 %	0 %	385829587
56	NC_017484	TA	3	6	29374	29379	50 %	50 %	0 %	0 %	385829587
57	NC_017484	TA	3	6	30268	30273	50 %	50 %	0 %	0 %	385829587
58	NC_017484	GT	3	6	31340	31345	0 %	50 %	50 %	0 %	385829588

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.