MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	AAAAGA	2	12	2715	2726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831893
2	NC_017483	TCATGA	2	12	4216	4227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385831895
3	NC_017483	AAGATG	2	12	4595	4606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385831895
4	NC_017483	TAAACT	2	12	8256	8267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385831896
5	NC_017483	GAAAAA	2	12	11450	11461	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831899
6	NC_017483	AAAAGA	2	12	11647	11658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831899
7	NC_017483	AAATGA	2	12	12719	12730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385831900
8	NC_017483	AAATAA	2	12	14449	14460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385831900
9	NC_017483	ATATTT	2	12	15766	15777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831901
10	NC_017483	CCTAAA	2	12	22040	22051	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385831907
11	NC_017483	TAAAAG	2	12	22311	22322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385831907
12	NC_017483	TAGATA	2	12	22675	22686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385831908
13	NC_017483	TTAGAA	2	12	23455	23466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385831909
14	NC_017483	AGGGAA	2	12	25764	25775	50 %	0 %	50 %	0 %	385831912
15	NC_017483	TACAGG	2	12	26603	26614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831913
16	NC_017483	AATAAA	2	12	27605	27616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385831915
17	NC_017483	TTACTA	2	12	30127	30138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831917
18	NC_017483	AAGTGC	2	12	31211	31222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385831917
19	NC_017483	TTGATA	2	12	32874	32885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385831919
20	NC_017483	AAATAA	2	12	33168	33179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385831920
21	NC_017483	AGGGGC	2	12	33417	33428	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385831920
22	NC_017483	GTTGAT	2	12	37821	37832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385831923
23	NC_017483	ATAAAA	2	12	40613	40624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385831927
24	NC_017483	AAAGAA	2	12	40654	40665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831927
25	NC_017483	GACGAA	2	12	41888	41899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385831928

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.