MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	TCAAT	2	10	461	470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017483	ACAAA	2	10	2025	2034	80 %	0 %	0 %	20 %	385831893
3	NC_017483	TCAAA	2	10	6810	6819	60 %	20 %	0 %	20 %	385831895
4	NC_017483	ATGAA	2	10	7311	7320	60 %	20 %	20 %	0 %	385831895
5	NC_017483	GTTTT	2	10	9196	9205	0 %	80 %	20 %	0 %	385831897
6	NC_017483	AGTAA	2	10	10165	10174	60 %	20 %	20 %	0 %	385831898
7	NC_017483	TATTT	2	10	10856	10865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017483	TCATT	2	10	10967	10976	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017483	AGAAA	2	10	11563	11572	80 %	0 %	20 %	0 %	385831899
10	NC_017483	TGAAA	2	10	11983	11992	60 %	20 %	20 %	0 %	385831899
11	NC_017483	AATAT	2	10	12661	12670	60 %	40 %	0 %	0 %	385831900
12	NC_017483	TTAGA	2	10	12838	12847	40 %	40 %	20 %	0 %	385831900
13	NC_017483	CAATT	2	10	13769	13778	40 %	40 %	0 %	20 %	385831900
14	NC_017483	AAGAA	2	10	13888	13897	80 %	0 %	20 %	0 %	385831900
15	NC_017483	GAAAA	2	10	14844	14853	80 %	0 %	20 %	0 %	385831900
16	NC_017483	AATAA	2	10	17014	17023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017483	ATTCA	2	10	17701	17710	40 %	40 %	0 %	20 %	385831903
18	NC_017483	GTTAA	2	10	18550	18559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017483	AGTTA	2	10	18625	18634	40 %	40 %	20 %	0 %	385831904
20	NC_017483	ATTTG	2	10	19249	19258	20 %	60 %	20 %	0 %	385831904
21	NC_017483	TTTCT	2	10	19564	19573	0 %	80 %	0 %	20 %	385831904
22	NC_017483	CATTT	2	10	19961	19970	20 %	60 %	0 %	20 %	385831905
23	NC_017483	CATTT	2	10	20487	20496	20 %	60 %	0 %	20 %	385831906
24	NC_017483	TCCCA	2	10	20874	20883	20 %	20 %	0 %	60 %	385831906
25	NC_017483	GAACA	2	10	23414	23423	60 %	0 %	20 %	20 %	385831909
26	NC_017483	ATTTT	2	10	23538	23547	20 %	80 %	0 %	0 %	385831909
27	NC_017483	TAAAC	2	10	23823	23832	60 %	20 %	0 %	20 %	385831909
28	NC_017483	CATAT	2	10	23912	23921	40 %	40 %	0 %	20 %	385831909
29	NC_017483	ACAAA	2	10	24755	24764	80 %	0 %	0 %	20 %	385831910
30	NC_017483	GGTCT	2	10	26007	26016	0 %	40 %	40 %	20 %	385831913
31	NC_017483	TCAAT	2	10	26750	26759	40 %	40 %	0 %	20 %	385831913
32	NC_017483	TGCTT	2	10	29342	29351	0 %	60 %	20 %	20 %	385831917
33	NC_017483	TTAAT	2	10	33302	33311	40 %	60 %	0 %	0 %	385831920
34	NC_017483	CTTCA	2	10	33347	33356	20 %	40 %	0 %	40 %	385831920
35	NC_017483	TCTTT	2	10	33895	33904	0 %	80 %	0 %	20 %	385831921
36	NC_017483	TTCTT	2	10	34810	34819	0 %	80 %	0 %	20 %	385831922
37	NC_017483	ACGAA	2	10	35911	35920	60 %	0 %	20 %	20 %	385831922
38	NC_017483	GAAAA	2	10	38340	38349	80 %	0 %	20 %	0 %	385831924
39	NC_017483	AAATA	2	10	38435	38444	80 %	20 %	0 %	0 %	385831924
40	NC_017483	AAATA	2	10	39608	39617	80 %	20 %	0 %	0 %	385831927
41	NC_017483	ATTTC	2	10	40316	40325	20 %	60 %	0 %	20 %	385831927
42	NC_017483	AAAAT	2	10	42275	42284	80 %	20 %	0 %	0 %	385831929
43	NC_017483	CGTTG	2	10	43562	43571	0 %	40 %	40 %	20 %	385831930
44	NC_017483	ATTTT	2	10	43621	43630	20 %	80 %	0 %	0 %	385831930

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.