MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	GTTT	2	8	256	263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017483	GAAA	2	8	859	866	75 %	0 %	25 %	0 %	385831892
3	NC_017483	ATTT	2	8	998	1005	25 %	75 %	0 %	0 %	385831892
4	NC_017483	GGAC	2	8	1173	1180	25 %	0 %	50 %	25 %	385831892
5	NC_017483	AGTA	2	8	1289	1296	50 %	25 %	25 %	0 %	385831892
6	NC_017483	TATC	2	8	2063	2070	25 %	50 %	0 %	25 %	385831893
7	NC_017483	AACA	2	8	2123	2130	75 %	0 %	0 %	25 %	385831893
8	NC_017483	AAAG	2	8	2425	2432	75 %	0 %	25 %	0 %	385831893
9	NC_017483	AACA	2	8	2465	2472	75 %	0 %	0 %	25 %	385831893
10	NC_017483	ATTA	2	8	2838	2845	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
11	NC_017483	ATGG	2	8	2892	2899	25 %	25 %	50 %	0 %	385831894
12	NC_017483	AAGC	2	8	2929	2936	50 %	0 %	25 %	25 %	385831894
13	NC_017483	GCTC	2	8	3124	3131	0 %	25 %	25 %	50 %	385831894
14	NC_017483	AATG	2	8	3298	3305	50 %	25 %	25 %	0 %	385831894
15	NC_017483	AATT	2	8	3975	3982	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
16	NC_017483	AATC	2	8	4129	4136	50 %	25 %	0 %	25 %	385831895
17	NC_017483	ATTT	2	8	4681	4688	25 %	75 %	0 %	0 %	385831895
18	NC_017483	TGAA	2	8	5091	5098	50 %	25 %	25 %	0 %	385831895
19	NC_017483	AATT	2	8	5629	5636	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
20	NC_017483	GTTC	2	8	5792	5799	0 %	50 %	25 %	25 %	385831895
21	NC_017483	TTAC	2	8	5834	5841	25 %	50 %	0 %	25 %	385831895
22	NC_017483	GAAA	2	8	5878	5885	75 %	0 %	25 %	0 %	385831895
23	NC_017483	AAAG	2	8	5917	5924	75 %	0 %	25 %	0 %	385831895
24	NC_017483	GAAC	2	8	5999	6006	50 %	0 %	25 %	25 %	385831895
25	NC_017483	AATT	2	8	6553	6560	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
26	NC_017483	GAAA	2	8	6688	6695	75 %	0 %	25 %	0 %	385831895
27	NC_017483	CAAT	2	8	7176	7183	50 %	25 %	0 %	25 %	385831895
28	NC_017483	GATG	2	8	7493	7500	25 %	25 %	50 %	0 %	385831895
29	NC_017483	TCTA	2	8	7600	7607	25 %	50 %	0 %	25 %	385831895
30	NC_017483	CTTG	2	8	7641	7648	0 %	50 %	25 %	25 %	385831895
31	NC_017483	CGAT	2	8	8077	8084	25 %	25 %	25 %	25 %	385831896
32	NC_017483	ACTA	2	8	8307	8314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017483	AACT	2	8	8639	8646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017483	ATTT	2	8	8770	8777	25 %	75 %	0 %	0 %	385831897
35	NC_017483	GTTG	2	8	9333	9340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017483	CTAT	2	8	9705	9712	25 %	50 %	0 %	25 %	385831898
37	NC_017483	ATTT	2	8	9859	9866	25 %	75 %	0 %	0 %	385831898
38	NC_017483	TCTT	2	8	9911	9918	0 %	75 %	0 %	25 %	385831898
39	NC_017483	TTGC	2	8	10473	10480	0 %	50 %	25 %	25 %	385831898
40	NC_017483	TAAG	2	8	10599	10606	50 %	25 %	25 %	0 %	385831898
41	NC_017483	ATTT	2	8	10795	10802	25 %	75 %	0 %	0 %	385831898
42	NC_017483	GAAA	2	8	11506	11513	75 %	0 %	25 %	0 %	385831899
43	NC_017483	AATT	2	8	11625	11632	50 %	50 %	0 %	0 %	385831899
44	NC_017483	CAAA	2	8	11749	11756	75 %	0 %	0 %	25 %	385831899
45	NC_017483	ATGT	2	8	12164	12171	25 %	50 %	25 %	0 %	385831899
46	NC_017483	ATAA	2	8	12571	12578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017483	TCAT	2	8	13244	13251	25 %	50 %	0 %	25 %	385831900
48	NC_017483	AGAA	2	8	13334	13341	75 %	0 %	25 %	0 %	385831900
49	NC_017483	ATTT	2	8	13422	13429	25 %	75 %	0 %	0 %	385831900
50	NC_017483	AAAT	2	8	14177	14184	75 %	25 %	0 %	0 %	385831900
51	NC_017483	CAAA	2	8	14229	14236	75 %	0 %	0 %	25 %	385831900
52	NC_017483	ACAA	2	8	14360	14367	75 %	0 %	0 %	25 %	385831900
53	NC_017483	TTAA	2	8	14625	14632	50 %	50 %	0 %	0 %	385831900
54	NC_017483	AAGA	2	8	14854	14861	75 %	0 %	25 %	0 %	385831900
55	NC_017483	GAGG	2	8	15072	15079	25 %	0 %	75 %	0 %	385831900
56	NC_017483	AATG	2	8	15785	15792	50 %	25 %	25 %	0 %	385831901
57	NC_017483	TTTG	2	8	16223	16230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017483	TTTG	2	8	16782	16789	0 %	75 %	25 %	0 %	385831902
59	NC_017483	AATA	2	8	17838	17845	75 %	25 %	0 %	0 %	385831903
60	NC_017483	CTTA	2	8	17883	17890	25 %	50 %	0 %	25 %	385831903
61	NC_017483	ATGG	2	8	17984	17991	25 %	25 %	50 %	0 %	385831903
62	NC_017483	ATTT	2	8	18184	18191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017483	ATAA	2	8	18234	18241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017483	ATTA	2	8	18264	18271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017483	TTTA	2	8	18976	18983	25 %	75 %	0 %	0 %	385831904
66	NC_017483	TGAT	2	8	19013	19020	25 %	50 %	25 %	0 %	385831904
67	NC_017483	TTTG	2	8	19037	19044	0 %	75 %	25 %	0 %	385831904
68	NC_017483	AACT	2	8	19057	19064	50 %	25 %	0 %	25 %	385831904
69	NC_017483	ATCT	2	8	19117	19124	25 %	50 %	0 %	25 %	385831904
70	NC_017483	GAGT	2	8	19134	19141	25 %	25 %	50 %	0 %	385831904
71	NC_017483	TACC	2	8	19797	19804	25 %	25 %	0 %	50 %	385831905
72	NC_017483	GAAA	2	8	19843	19850	75 %	0 %	25 %	0 %	385831905
73	NC_017483	TAGG	2	8	20534	20541	25 %	25 %	50 %	0 %	385831906
74	NC_017483	ATTT	2	8	20708	20715	25 %	75 %	0 %	0 %	385831906
75	NC_017483	AGTC	2	8	20750	20757	25 %	25 %	25 %	25 %	385831906
76	NC_017483	TGAC	2	8	21268	21275	25 %	25 %	25 %	25 %	385831906
77	NC_017483	TTTA	2	8	21474	21481	25 %	75 %	0 %	0 %	385831906
78	NC_017483	TAAA	2	8	22369	22376	75 %	25 %	0 %	0 %	385831907
79	NC_017483	TTTA	2	8	22401	22408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017483	TTAT	2	8	22438	22445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017483	ATAA	2	8	22482	22489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017483	GATA	2	8	22931	22938	50 %	25 %	25 %	0 %	385831908
83	NC_017483	TAAA	2	8	22960	22967	75 %	25 %	0 %	0 %	385831908
84	NC_017483	TCAA	2	8	23051	23058	50 %	25 %	0 %	25 %	385831908
85	NC_017483	TGAC	2	8	23297	23304	25 %	25 %	25 %	25 %	385831909
86	NC_017483	CATT	2	8	23307	23314	25 %	50 %	0 %	25 %	385831909
87	NC_017483	AATA	2	8	23676	23683	75 %	25 %	0 %	0 %	385831909
88	NC_017483	CTAT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	385831909
89	NC_017483	ATTA	2	8	24082	24089	50 %	50 %	0 %	0 %	385831909
90	NC_017483	GAAA	2	8	24531	24538	75 %	0 %	25 %	0 %	385831910
91	NC_017483	AATT	2	8	24811	24818	50 %	50 %	0 %	0 %	385831910
92	NC_017483	TTTC	2	8	24928	24935	0 %	75 %	0 %	25 %	385831911
93	NC_017483	ATGT	2	8	26262	26269	25 %	50 %	25 %	0 %	385831913
94	NC_017483	TCTA	2	8	26908	26915	25 %	50 %	0 %	25 %	385831913
95	NC_017483	AAAC	2	8	27002	27009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017483	TAAA	2	8	27789	27796	75 %	25 %	0 %	0 %	385831915
97	NC_017483	TAGA	2	8	28091	28098	50 %	25 %	25 %	0 %	385831916
98	NC_017483	AATT	2	8	28127	28134	50 %	50 %	0 %	0 %	385831916
99	NC_017483	TAAG	2	8	28798	28805	50 %	25 %	25 %	0 %	385831917
100	NC_017483	TAAT	2	8	28939	28946	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
101	NC_017483	TTTA	2	8	29356	29363	25 %	75 %	0 %	0 %	385831917
102	NC_017483	CAAT	2	8	29421	29428	50 %	25 %	0 %	25 %	385831917
103	NC_017483	TAAT	2	8	29758	29765	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
104	NC_017483	ATTA	2	8	29774	29781	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
105	NC_017483	AAAC	2	8	29798	29805	75 %	0 %	0 %	25 %	385831917
106	NC_017483	CAGT	2	8	30447	30454	25 %	25 %	25 %	25 %	385831917
107	NC_017483	ATTA	2	8	30455	30462	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
108	NC_017483	ATTC	2	8	30555	30562	25 %	50 %	0 %	25 %	385831917
109	NC_017483	CTAT	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	385831917
110	NC_017483	GTAA	2	8	31426	31433	50 %	25 %	25 %	0 %	385831917
111	NC_017483	GCTT	2	8	32462	32469	0 %	50 %	25 %	25 %	385831918
112	NC_017483	ACTT	2	8	32495	32502	25 %	50 %	0 %	25 %	385831918
113	NC_017483	TTGG	2	8	32635	32642	0 %	50 %	50 %	0 %	385831919
114	NC_017483	TGAA	2	8	32671	32678	50 %	25 %	25 %	0 %	385831919
115	NC_017483	CTAT	2	8	32693	32700	25 %	50 %	0 %	25 %	385831919
116	NC_017483	ATTC	2	8	32821	32828	25 %	50 %	0 %	25 %	385831919
117	NC_017483	ATTA	2	8	32939	32946	50 %	50 %	0 %	0 %	385831919
118	NC_017483	CTTA	2	8	33407	33414	25 %	50 %	0 %	25 %	385831920
119	NC_017483	GTAT	2	8	33750	33757	25 %	50 %	25 %	0 %	385831920
120	NC_017483	ATAA	2	8	33866	33873	75 %	25 %	0 %	0 %	385831921
121	NC_017483	TATT	2	8	33927	33934	25 %	75 %	0 %	0 %	385831921
122	NC_017483	TCAA	2	8	34075	34082	50 %	25 %	0 %	25 %	385831921
123	NC_017483	GATA	2	8	34515	34522	50 %	25 %	25 %	0 %	385831922
124	NC_017483	TCAA	2	8	34801	34808	50 %	25 %	0 %	25 %	385831922
125	NC_017483	GGAC	2	8	35025	35032	25 %	0 %	50 %	25 %	385831922
126	NC_017483	AAAT	2	8	35969	35976	75 %	25 %	0 %	0 %	385831922
127	NC_017483	CAGA	2	8	36426	36433	50 %	0 %	25 %	25 %	385831922
128	NC_017483	ATGA	2	8	36450	36457	50 %	25 %	25 %	0 %	385831923
129	NC_017483	TTTA	2	8	37130	37137	25 %	75 %	0 %	0 %	385831923
130	NC_017483	TACT	2	8	37502	37509	25 %	50 %	0 %	25 %	385831923
131	NC_017483	CAAA	2	8	37789	37796	75 %	0 %	0 %	25 %	385831923
132	NC_017483	TTGG	2	8	38128	38135	0 %	50 %	50 %	0 %	385831923
133	NC_017483	AAAC	2	8	38236	38243	75 %	0 %	0 %	25 %	385831923
134	NC_017483	TTCA	2	8	38313	38320	25 %	50 %	0 %	25 %	385831923
135	NC_017483	TATT	2	8	38350	38357	25 %	75 %	0 %	0 %	385831924
136	NC_017483	AGAC	2	8	38621	38628	50 %	0 %	25 %	25 %	385831924
137	NC_017483	AGCA	2	8	38636	38643	50 %	0 %	25 %	25 %	385831924
138	NC_017483	TGAT	2	8	38809	38816	25 %	50 %	25 %	0 %	385831924
139	NC_017483	TTAA	2	8	39109	39116	50 %	50 %	0 %	0 %	385831925
140	NC_017483	TCAT	2	8	39200	39207	25 %	50 %	0 %	25 %	385831925
141	NC_017483	AAGA	2	8	39280	39287	75 %	0 %	25 %	0 %	385831926
142	NC_017483	ATTA	2	8	39296	39303	50 %	50 %	0 %	0 %	385831926
143	NC_017483	ATCA	2	8	39339	39346	50 %	25 %	0 %	25 %	385831926
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145	NC_017483	CAAT	2	8	39905	39912	50 %	25 %	0 %	25 %	385831927
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.