MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	AAT	2	6	60	65	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017483	GTC	2	6	165	170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017483	ATA	2	6	724	729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017483	TCT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017483	GGA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017483	GTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017483	ATG	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017483	CAG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017483	TTG	2	6	8323	8328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017483	GAT	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017483	TCT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017483	TGG	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017483	GAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017483	TAA	4	12	9256	9267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017483	TGA	2	6	9278	9283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017483	TAA	2	6	9315	9320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017483	CAT	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017483	CAA	2	6	10931	10936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017483	ATT	2	6	11038	11043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017483	ATA	2	6	11050	11055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017483	TCC	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017483	TAT	2	6	11203	11208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017483	CTA	2	6	12535	12540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017483	GGA	2	6	12565	12570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017483	ATA	2	6	15255	15260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017483	TGA	2	6	15280	15285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017483	GAA	2	6	15975	15980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017483	GAA	2	6	16021	16026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017483	AAT	2	6	16242	16247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017483	TCT	2	6	16268	16273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017483	CTT	2	6	16330	16335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017483	TTA	2	6	16339	16344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017483	ATT	2	6	16347	16352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017483	TAG	2	6	17141	17146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017483	ATA	3	9	17154	17162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017483	ATT	2	6	17254	17259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017483	TAG	2	6	17356	17361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017483	ATA	3	9	17369	17377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017483	CTT	2	6	18194	18199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017483	AGA	2	6	18276	18281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017483	CTT	2	6	18282	18287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017483	AGA	2	6	18401	18406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017483	TAA	2	6	18435	18440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017483	GTT	2	6	18465	18470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017483	CAA	2	6	18520	18525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017483	GCC	2	6	18590	18595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017483	AGT	2	6	21508	21513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017483	TAT	2	6	21629	21634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017483	ATC	2	6	21680	21685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017483	ATT	2	6	21706	21711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017483	CCA	2	6	21748	21753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017483	CCA	2	6	21820	21825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017483	AGA	3	9	23207	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017483	TAA	2	6	24232	24237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017483	GAC	2	6	24346	24351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017483	TGT	2	6	24397	24402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017483	ATA	2	6	24489	24494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017483	GAA	2	6	24911	24916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017483	TTC	2	6	27063	27068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017483	TTA	2	6	27093	27098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017483	ACA	2	6	28476	28481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017483	AGG	2	6	28501	28506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017483	AAT	4	12	31505	31516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017483	ACC	2	6	31567	31572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017483	TTA	2	6	31675	31680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017483	AAG	2	6	31718	31723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017483	AGA	2	6	31803	31808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017483	TTC	2	6	31882	31887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017483	TAA	2	6	31991	31996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017483	AGT	2	6	32116	32121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017483	TGA	2	6	32166	32171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017483	GGA	2	6	32235	32240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017483	AGG	2	6	32996	33001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017483	AGT	2	6	34167	34172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017483	AAG	2	6	40721	40726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017483	TAG	2	6	40860	40865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017483	GTG	2	6	41276	41281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017483	AAT	2	6	41413	41418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017483	GAA	2	6	41488	41493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017483	AAG	2	6	41615	41620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017483	GAA	2	6	41656	41661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017483	GAT	2	6	42117	42122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017483	CAC	2	6	42160	42165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.