MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017483	AT	4	8	548	555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017483	GT	3	6	848	853	0 %	50 %	50 %	0 %	385831892
3	NC_017483	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017483	TA	3	6	3203	3208	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
5	NC_017483	TA	3	6	3220	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
6	NC_017483	AT	3	6	3493	3498	50 %	50 %	0 %	0 %	385831894
7	NC_017483	AT	3	6	4138	4143	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
8	NC_017483	CT	3	6	6579	6584	0 %	50 %	0 %	50 %	385831895
9	NC_017483	CA	3	6	6736	6741	50 %	0 %	0 %	50 %	385831895
10	NC_017483	AT	3	6	7418	7423	50 %	50 %	0 %	0 %	385831895
11	NC_017483	TA	3	6	7903	7908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017483	TA	3	6	7948	7953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017483	TC	3	6	9445	9450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017483	CT	3	6	9479	9484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017483	GA	3	6	10157	10162	50 %	0 %	50 %	0 %	385831898
16	NC_017483	CT	3	6	10780	10785	0 %	50 %	0 %	50 %	385831898
17	NC_017483	AT	3	6	11014	11019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017483	GA	3	6	11817	11822	50 %	0 %	50 %	0 %	385831899
19	NC_017483	AG	3	6	13910	13915	50 %	0 %	50 %	0 %	385831900
20	NC_017483	AT	3	6	14087	14092	50 %	50 %	0 %	0 %	385831900
21	NC_017483	GA	3	6	14404	14409	50 %	0 %	50 %	0 %	385831900
22	NC_017483	CG	3	6	14808	14813	0 %	0 %	50 %	50 %	385831900
23	NC_017483	GA	3	6	15100	15105	50 %	0 %	50 %	0 %	385831900
24	NC_017483	AC	3	6	15181	15186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017483	AT	3	6	16995	17000	50 %	50 %	0 %	0 %	385831902
26	NC_017483	AT	4	8	17058	17065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017483	AG	3	6	17091	17096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017483	AT	4	8	17273	17280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017483	AG	3	6	17306	17311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017483	TC	3	6	17812	17817	0 %	50 %	0 %	50 %	385831903
31	NC_017483	TA	3	6	17951	17956	50 %	50 %	0 %	0 %	385831903
32	NC_017483	AT	3	6	18407	18412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017483	GA	4	8	18663	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385831904
34	NC_017483	TC	3	6	21058	21063	0 %	50 %	0 %	50 %	385831906
35	NC_017483	AT	3	6	21094	21099	50 %	50 %	0 %	0 %	385831906
36	NC_017483	AT	3	6	21157	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	385831906
37	NC_017483	TA	4	8	21613	21620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017483	TA	3	6	21714	21719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017483	TA	3	6	21900	21905	50 %	50 %	0 %	0 %	385831907
40	NC_017483	TA	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	385831907
41	NC_017483	TG	3	6	22328	22333	0 %	50 %	50 %	0 %	385831907
42	NC_017483	TC	3	6	22379	22384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017483	GA	3	6	22393	22398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017483	AT	3	6	22472	22477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017483	TA	3	6	22685	22690	50 %	50 %	0 %	0 %	385831908
46	NC_017483	TA	4	8	22824	22831	50 %	50 %	0 %	0 %	385831908
47	NC_017483	AG	3	6	23244	23249	50 %	0 %	50 %	0 %	385831909
48	NC_017483	TA	3	6	23521	23526	50 %	50 %	0 %	0 %	385831909
49	NC_017483	AG	3	6	23774	23779	50 %	0 %	50 %	0 %	385831909
50	NC_017483	TC	3	6	23799	23804	0 %	50 %	0 %	50 %	385831909
51	NC_017483	TA	5	10	24207	24216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017483	TA	3	6	24225	24230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017483	TA	3	6	24497	24502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017483	AT	3	6	26278	26283	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
55	NC_017483	AT	3	6	26429	26434	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
56	NC_017483	AT	3	6	26851	26856	50 %	50 %	0 %	0 %	385831913
57	NC_017483	TA	3	6	26990	26995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017483	AT	3	6	27272	27277	50 %	50 %	0 %	0 %	385831914
59	NC_017483	TC	4	8	28634	28641	0 %	50 %	0 %	50 %	385831917
60	NC_017483	AT	3	6	29684	29689	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
61	NC_017483	TC	3	6	29856	29861	0 %	50 %	0 %	50 %	385831917
62	NC_017483	AT	3	6	30626	30631	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
63	NC_017483	TA	3	6	30832	30837	50 %	50 %	0 %	0 %	385831917
64	NC_017483	GC	3	6	30884	30889	0 %	0 %	50 %	50 %	385831917
65	NC_017483	CA	3	6	31106	31111	50 %	0 %	0 %	50 %	385831917
66	NC_017483	AG	3	6	31168	31173	50 %	0 %	50 %	0 %	385831917
67	NC_017483	AC	3	6	32287	32292	50 %	0 %	0 %	50 %	385831918
68	NC_017483	AT	3	6	32525	32530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017483	GA	3	6	32617	32622	50 %	0 %	50 %	0 %	385831919
70	NC_017483	TA	3	6	33765	33770	50 %	50 %	0 %	0 %	385831921
71	NC_017483	AG	3	6	34039	34044	50 %	0 %	50 %	0 %	385831921
72	NC_017483	AC	3	6	34183	34188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017483	CT	3	6	34199	34204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017483	AT	3	6	35899	35904	50 %	50 %	0 %	0 %	385831922
75	NC_017483	CT	3	6	36087	36092	0 %	50 %	0 %	50 %	385831922
76	NC_017483	TC	3	6	37259	37264	0 %	50 %	0 %	50 %	385831923
77	NC_017483	AT	3	6	37916	37921	50 %	50 %	0 %	0 %	385831923
78	NC_017483	AT	3	6	38201	38206	50 %	50 %	0 %	0 %	385831923
79	NC_017483	TA	3	6	38412	38417	50 %	50 %	0 %	0 %	385831924
80	NC_017483	AT	3	6	39162	39167	50 %	50 %	0 %	0 %	385831925
81	NC_017483	TG	3	6	39881	39886	0 %	50 %	50 %	0 %	385831927
82	NC_017483	CT	3	6	40765	40770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017483	AC	3	6	41328	41333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017483	TG	3	6	42137	42142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017483	AC	3	6	42144	42149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017483	GA	3	6	42495	42500	50 %	0 %	50 %	0 %	385831929
87	NC_017483	GA	3	6	42607	42612	50 %	0 %	50 %	0 %	385831930
88	NC_017483	CA	3	6	42928	42933	50 %	0 %	0 %	50 %	385831930
89	NC_017483	AC	3	6	44059	44064	50 %	0 %	0 %	50 %	385831930

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.