MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017482	CTATTA	2	12	1463	1474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017482	TGATCT	2	12	108085	108096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017482	GTGAGC	2	12	115417	115428	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017482	TGGATA	2	12	155311	155322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017482	GCTCAC	2	12	201283	201294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017482	TGGCGA	2	12	260810	260821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017482	GCTCAC	2	12	263820	263831	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017482	GCAAAG	2	12	281589	281600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017482	AATCGT	2	12	289022	289033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017482	CTGACA	2	12	297214	297225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017482	CGGAGC	2	12	309222	309233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017482	TGGAAG	2	12	311418	311429	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017482	GTAGTT	2	12	323680	323691	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017482	GCTCAC	2	12	341164	341175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017482	AATATT	2	12	365299	365310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017482	TTTAAA	2	12	386295	386306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017482	AGAAGT	2	12	393309	393320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017482	CGTTAT	2	12	397756	397767	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017482	ATTAAG	2	12	416231	416242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017482	AATTAA	2	12	434851	434862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017482	TGTCAA	2	12	440078	440089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017482	TAAAAA	2	12	492867	492878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017482	TATCGA	2	12	494742	494753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017482	CTCTAT	2	12	501616	501627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017482	GAAAAA	2	12	506063	506074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017482	AAAACA	2	12	527667	527678	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017482	AAGGTA	2	12	532488	532499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017482	CGGCAG	2	12	587706	587717	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017482	ATAACA	2	12	588062	588073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017482	GCTCAC	2	12	590413	590424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017482	ATTTAA	2	12	609137	609148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017482	CAAGGA	2	12	609979	609990	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017482	AGACTT	2	12	658277	658288	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017482	TGAGCA	2	12	702788	702799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017482	ATTTTT	2	12	720420	720431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017482	GTTTTT	2	12	779364	779375	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017482	GTTCTG	2	12	800632	800643	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017482	ATTTTC	2	12	800675	800686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017482	GGAATT	2	12	820435	820446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017482	CGGAGC	2	12	823259	823270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017482	TGGAAG	2	12	825455	825466	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017482	TCGCTT	2	12	828666	828677	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017482	TATACT	2	12	831772	831783	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017482	CGGAGC	2	12	843300	843311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017482	TGGAAG	2	12	845496	845507	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017482	AAAACA	2	12	861507	861518	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017482	GCTCAC	2	12	865655	865666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017482	AATGCA	2	12	875418	875429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017482	CAGAAG	2	12	901374	901385	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017482	GCTCAC	2	12	925181	925192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017482	TCGCAG	2	12	943415	943426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017482	ATTTTA	2	12	965291	965302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017482	GCATAA	2	12	992128	992139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017482	ATTTAA	2	12	994557	994568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017482	AATGAA	2	12	1028217	1028228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017482	ATCAGT	2	12	1041985	1041996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017482	GCTCAC	2	12	1052187	1052198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017482	AGCTGC	2	12	1056380	1056391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017482	GCTCAC	2	12	1059356	1059367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017482	GCTCAC	2	12	1059478	1059489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017482	GTGAGC	2	12	1061762	1061773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017482	TAAAAT	2	12	1076720	1076731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017482	TCCATT	2	12	1111848	1111859	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017482	ATGTGG	2	12	1115896	1115907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017482	GCTCAC	2	12	1178039	1178050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017482	GCTCAC	2	12	1178286	1178297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017482	ACTTCG	2	12	1203870	1203881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017482	TGTTAT	2	12	1236946	1236957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017482	CTTTTT	2	12	1270762	1270773	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017482	TCACAC	2	12	1362711	1362722	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017482	GATAGT	2	12	1382060	1382071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017482	ATCAAT	2	12	1404137	1404148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017482	ACGATT	2	12	1483278	1483289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017482	AGGTTG	2	12	1485515	1485526	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017482	TGCAGA	2	12	1486223	1486234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017482	TGTATT	2	12	1552217	1552228	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017482	CATCAA	2	12	1567281	1567292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017482	CGCCCA	2	12	1571375	1571386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017482	ACTACC	2	12	1616700	1616711	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017482	CTGTCA	2	12	1651564	1651575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017482	CCTGCC	2	12	1710770	1710781	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017482	ATTTTT	2	12	1711363	1711374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017482	TCCTTG	2	12	1714569	1714580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017482	TATTTT	2	12	1719478	1719489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017482	GTGAGC	2	12	1745716	1745727	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017482	AATTCG	2	12	1776803	1776814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017482	ACGCCG	2	12	1779709	1779720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017482	GTGAAC	2	12	1830524	1830535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017482	GTGAGC	2	12	1869604	1869615	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017482	ACCCCA	2	12	1886620	1886631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017482	CACTTC	2	12	1920509	1920520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017482	GCTCCG	2	12	1922707	1922718	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017482	TCGCAG	2	12	1932949	1932960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017482	GCTCAC	2	12	1933055	1933066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017482	GCTCAC	2	12	1946918	1946929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017482	GCTATT	2	12	1959997	1960008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017482	GCTCAC	2	12	1966422	1966433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017482	GCTCAC	2	12	1966548	1966559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017482	TGCACA	2	12	1978203	1978214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017482	AGCTGA	2	12	1995130	1995141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017482	AAGTGT	2	12	2116446	2116457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017482	GGCTGG	2	12	2116521	2116532	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017482	ATCAAT	2	12	2120033	2120044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017482	GTATCG	2	12	2124772	2124783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017482	GCTCAC	2	12	2132902	2132913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017482	GCTTTG	2	12	2169466	2169477	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017482	TCGCAG	2	12	2179730	2179741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017482	TCATTT	2	12	2211496	2211507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017482	GCTTGT	2	12	2234299	2234310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017482	TCGCAG	2	12	2280043	2280054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017482	GCTCAC	2	12	2331232	2331243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017482	AAAAGA	2	12	2357806	2357817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017482	GTTGCA	2	12	2375788	2375799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017482	AATTTT	2	12	2396066	2396077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017482	CTTACC	2	12	2399525	2399536	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017482	GATTTA	2	12	2406269	2406280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017482	GCCAAG	2	12	2429765	2429776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017482	TTTTCA	2	12	2430643	2430654	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017482	GTGAGC	2	12	2432163	2432174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017482	CCTGCT	2	12	2432435	2432446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017482	GCAACT	2	12	2465956	2465967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017482	CCGACA	2	12	2490776	2490787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017482	CTGCGA	2	12	2520899	2520910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017482	ATTCAC	2	12	2543622	2543633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017482	TTTGAC	2	12	2559176	2559187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017482	CACTTC	2	12	2560457	2560468	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017482	GCTCCG	2	12	2562655	2562666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017482	TTGTGA	2	12	2604627	2604638	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017482	GCTTAT	2	12	2605670	2605681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017482	AAAAAC	2	12	2609359	2609370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017482	GTGAGC	2	12	2633388	2633399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017482	CAGTTT	2	12	2656876	2656887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017482	GCATCA	2	12	2706065	2706076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017482	ACTTCA	2	12	2776098	2776109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017482	ATTTTC	2	12	2817107	2817118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017482	TCTGCT	2	12	2819931	2819942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017482	ACGATG	2	12	2849235	2849246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017482	TCGTTG	2	12	2850666	2850677	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017482	ATCAAA	2	12	2857829	2857840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017482	TCGCAG	2	12	2861133	2861144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017482	CGATTA	2	12	2905738	2905749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017482	GCTCAC	2	12	2910478	2910489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017482	TTCGTC	2	12	2943742	2943753	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017482	TTATAA	2	12	2951077	2951088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017482	ATAGTC	2	12	2957010	2957021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017482	CGGCCG	2	12	2958280	2958291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017482	GAAAAA	2	12	2967355	2967366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017482	ATTTTT	2	12	2969490	2969501	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017482	AACGAC	2	12	3002037	3002048	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.