MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 1485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017482	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	385826724
2	NC_017482	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	385826724
3	NC_017482	AGTTA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	20 %	0 %	385826724
4	NC_017482	GAAAA	2	10	7386	7395	80 %	0 %	20 %	0 %	385826726
5	NC_017482	TGTTT	2	10	14600	14609	0 %	80 %	20 %	0 %	385826735
6	NC_017482	CCGGT	2	10	15647	15656	0 %	20 %	40 %	40 %	385826736
7	NC_017482	CTCGA	2	10	17409	17418	20 %	20 %	20 %	40 %	385826739
8	NC_017482	TTGAT	2	10	20548	20557	20 %	60 %	20 %	0 %	385826743
9	NC_017482	GTTGC	2	10	21896	21905	0 %	40 %	40 %	20 %	385826743
10	NC_017482	AGCTA	2	10	23317	23326	40 %	20 %	20 %	20 %	385826745
11	NC_017482	CAAAC	2	10	25027	25036	60 %	0 %	0 %	40 %	385826747
12	NC_017482	GATTT	2	10	25232	25241	20 %	60 %	20 %	0 %	385826747
13	NC_017482	TGGTG	2	10	28236	28245	0 %	40 %	60 %	0 %	385826750
14	NC_017482	GCCGG	2	10	29592	29601	0 %	0 %	60 %	40 %	385826751
15	NC_017482	AACTG	2	10	30895	30904	40 %	20 %	20 %	20 %	385826752
16	NC_017482	GATGC	2	10	31145	31154	20 %	20 %	40 %	20 %	385826752
17	NC_017482	GAATA	2	10	31616	31625	60 %	20 %	20 %	0 %	385826753
18	NC_017482	AAAAC	2	10	34467	34476	80 %	0 %	0 %	20 %	385826754
19	NC_017482	CCGTC	2	10	34531	34540	0 %	20 %	20 %	60 %	385826754
20	NC_017482	ATGAC	2	10	35149	35158	40 %	20 %	20 %	20 %	385826755
21	NC_017482	CTGAT	2	10	35915	35924	20 %	40 %	20 %	20 %	385826756
22	NC_017482	CGCTA	2	10	36446	36455	20 %	20 %	20 %	40 %	385826757
23	NC_017482	AAGAT	2	10	38627	38636	60 %	20 %	20 %	0 %	385826760
24	NC_017482	TTTTC	2	10	42750	42759	0 %	80 %	0 %	20 %	385826764
25	NC_017482	CCGTC	2	10	47754	47763	0 %	20 %	20 %	60 %	385826767
26	NC_017482	GATCG	2	10	50638	50647	20 %	20 %	40 %	20 %	385826770
27	NC_017482	AAAGC	2	10	52073	52082	60 %	0 %	20 %	20 %	385826771
28	NC_017482	AGACA	2	10	55060	55069	60 %	0 %	20 %	20 %	385826771
29	NC_017482	ACAGT	2	10	55743	55752	40 %	20 %	20 %	20 %	385826771
30	NC_017482	CATCG	2	10	59060	59069	20 %	20 %	20 %	40 %	385826774
31	NC_017482	AGCCC	2	10	62054	62063	20 %	0 %	20 %	60 %	385826777
32	NC_017482	TTGGC	2	10	62137	62146	0 %	40 %	40 %	20 %	385826777
33	NC_017482	CCGAT	2	10	63824	63833	20 %	20 %	20 %	40 %	385826778
34	NC_017482	GGCGT	2	10	66301	66310	0 %	20 %	60 %	20 %	385826780
35	NC_017482	AAGTG	2	10	67672	67681	40 %	20 %	40 %	0 %	385826781
36	NC_017482	GCCGG	2	10	70674	70683	0 %	0 %	60 %	40 %	385826784
37	NC_017482	CATAG	2	10	73292	73301	40 %	20 %	20 %	20 %	385826785
38	NC_017482	CTGAG	2	10	76417	76426	20 %	20 %	40 %	20 %	385826788
39	NC_017482	TTGGA	2	10	76899	76908	20 %	40 %	40 %	0 %	385826788
40	NC_017482	AATGG	2	10	78674	78683	40 %	20 %	40 %	0 %	385826789
41	NC_017482	GCGCC	2	10	80024	80033	0 %	0 %	40 %	60 %	385826791
42	NC_017482	GTGGC	2	10	82648	82657	0 %	20 %	60 %	20 %	385826794
43	NC_017482	GCCAA	2	10	83583	83592	40 %	0 %	20 %	40 %	385826795
44	NC_017482	AAACC	2	10	84045	84054	60 %	0 %	0 %	40 %	385826796
45	NC_017482	AAATC	2	10	84080	84089	60 %	20 %	0 %	20 %	385826796
46	NC_017482	AGATC	2	10	86059	86068	40 %	20 %	20 %	20 %	385826798
47	NC_017482	TTCGT	2	10	87163	87172	0 %	60 %	20 %	20 %	385826800
48	NC_017482	GCAAG	2	10	87226	87235	40 %	0 %	40 %	20 %	385826800
49	NC_017482	CGGCC	2	10	89720	89729	0 %	0 %	40 %	60 %	385826802
50	NC_017482	CGTTT	2	10	90935	90944	0 %	60 %	20 %	20 %	385826804
51	NC_017482	AAAAC	2	10	92224	92233	80 %	0 %	0 %	20 %	385826806
52	NC_017482	CGATT	2	10	94976	94985	20 %	40 %	20 %	20 %	385826810
53	NC_017482	TGGGA	2	10	95955	95964	20 %	20 %	60 %	0 %	385826811
54	NC_017482	GAAAA	2	10	96769	96778	80 %	0 %	20 %	0 %	385826813
55	NC_017482	GAATC	2	10	98024	98033	40 %	20 %	20 %	20 %	385826813
56	NC_017482	ATCGC	2	10	101346	101355	20 %	20 %	20 %	40 %	385826815
57	NC_017482	CGAAG	2	10	108974	108983	40 %	0 %	40 %	20 %	385826824
58	NC_017482	AGTCG	2	10	109128	109137	20 %	20 %	40 %	20 %	385826824
59	NC_017482	TGGGC	2	10	117823	117832	0 %	20 %	60 %	20 %	385826832
60	NC_017482	AGGGC	2	10	117876	117885	20 %	0 %	60 %	20 %	385826832
61	NC_017482	GCTTT	2	10	118530	118539	0 %	60 %	20 %	20 %	385826832
62	NC_017482	GCGGA	2	10	121451	121460	20 %	0 %	60 %	20 %	385826834
63	NC_017482	TAACG	2	10	121917	121926	40 %	20 %	20 %	20 %	385826834
64	NC_017482	CCTTG	2	10	122425	122434	0 %	40 %	20 %	40 %	385826835
65	NC_017482	TCTTT	2	10	125523	125532	0 %	80 %	0 %	20 %	385826839
66	NC_017482	GCGTT	2	10	126810	126819	0 %	40 %	40 %	20 %	385826840
67	NC_017482	ATTGT	2	10	127103	127112	20 %	60 %	20 %	0 %	385826840
68	NC_017482	ACCGC	2	10	134227	134236	20 %	0 %	20 %	60 %	385826845
69	NC_017482	GCATC	2	10	135656	135665	20 %	20 %	20 %	40 %	385826846
70	NC_017482	AGGCT	2	10	135909	135918	20 %	20 %	40 %	20 %	385826846
71	NC_017482	GAATC	2	10	136466	136475	40 %	20 %	20 %	20 %	385826847
72	NC_017482	AATCA	2	10	138199	138208	60 %	20 %	0 %	20 %	385826848
73	NC_017482	TTTTC	2	10	138516	138525	0 %	80 %	0 %	20 %	385826848
74	NC_017482	GTTTG	2	10	139255	139264	0 %	60 %	40 %	0 %	385826849
75	NC_017482	GGTCA	2	10	139770	139779	20 %	20 %	40 %	20 %	385826850
76	NC_017482	CAGCT	2	10	139993	140002	20 %	20 %	20 %	40 %	385826850
77	NC_017482	GGGAT	2	10	143897	143906	20 %	20 %	60 %	0 %	385826852
78	NC_017482	GGCTC	2	10	145314	145323	0 %	20 %	40 %	40 %	385826853
79	NC_017482	TGTTC	2	10	150042	150051	0 %	60 %	20 %	20 %	385826857
80	NC_017482	CGGTG	2	10	151370	151379	0 %	20 %	60 %	20 %	385826858
81	NC_017482	GTGAT	2	10	151711	151720	20 %	40 %	40 %	0 %	385826858
82	NC_017482	AGATA	2	10	155815	155824	60 %	20 %	20 %	0 %	385826862
83	NC_017482	GACCA	2	10	159114	159123	40 %	0 %	20 %	40 %	385826864
84	NC_017482	TGCTG	2	10	165804	165813	0 %	40 %	40 %	20 %	385826871
85	NC_017482	ATTGC	2	10	168923	168932	20 %	40 %	20 %	20 %	385826875
86	NC_017482	GCAAT	2	10	170739	170748	40 %	20 %	20 %	20 %	385826877
87	NC_017482	GCGTG	2	10	173728	173737	0 %	20 %	60 %	20 %	385826882
88	NC_017482	GAAGA	2	10	173960	173969	60 %	0 %	40 %	0 %	385826882
89	NC_017482	CAAAC	2	10	175175	175184	60 %	0 %	0 %	40 %	385826883
90	NC_017482	AATTT	2	10	175911	175920	40 %	60 %	0 %	0 %	385826883
91	NC_017482	GGCAA	3	15	176994	177008	40 %	0 %	40 %	20 %	385826884
92	NC_017482	CATAA	2	10	177550	177559	60 %	20 %	0 %	20 %	385826885
93	NC_017482	AATCA	2	10	177787	177796	60 %	20 %	0 %	20 %	385826885
94	NC_017482	TCAGT	2	10	179963	179972	20 %	40 %	20 %	20 %	385826888
95	NC_017482	GAATA	2	10	182489	182498	60 %	20 %	20 %	0 %	385826892
96	NC_017482	TGGTT	2	10	182840	182849	0 %	60 %	40 %	0 %	385826893
97	NC_017482	TGAAC	2	10	183574	183583	40 %	20 %	20 %	20 %	385826893
98	NC_017482	ATACG	2	10	184036	184045	40 %	20 %	20 %	20 %	385826894
99	NC_017482	ATATT	2	10	186132	186141	40 %	60 %	0 %	0 %	385826895
100	NC_017482	GTGAA	2	10	186731	186740	40 %	20 %	40 %	0 %	385826896
101	NC_017482	ACACA	2	10	187815	187824	60 %	0 %	0 %	40 %	385826897
102	NC_017482	TCACT	2	10	190762	190771	20 %	40 %	0 %	40 %	385826900
103	NC_017482	GGCGA	2	10	191949	191958	20 %	0 %	60 %	20 %	385826901
104	NC_017482	CGCAA	2	10	192275	192284	40 %	0 %	20 %	40 %	385826901
105	NC_017482	TTCAT	2	10	192313	192322	20 %	60 %	0 %	20 %	385826901
106	NC_017482	TCGAC	2	10	192790	192799	20 %	20 %	20 %	40 %	385826901
107	NC_017482	CAAGC	2	10	195800	195809	40 %	0 %	20 %	40 %	385826904
108	NC_017482	CACAA	2	10	200742	200751	60 %	0 %	0 %	40 %	385826909
109	NC_017482	AATAA	2	10	201435	201444	80 %	20 %	0 %	0 %	385826910
110	NC_017482	TGGTC	2	10	203842	203851	0 %	40 %	40 %	20 %	385826912
111	NC_017482	TTCGG	2	10	206054	206063	0 %	40 %	40 %	20 %	385826913
112	NC_017482	ATGCG	2	10	209072	209081	20 %	20 %	40 %	20 %	385826916
113	NC_017482	GCCGA	2	10	209662	209671	20 %	0 %	40 %	40 %	385826917
114	NC_017482	CCGTT	2	10	209735	209744	0 %	40 %	20 %	40 %	385826917
115	NC_017482	CAGCC	2	10	215839	215848	20 %	0 %	20 %	60 %	385826921
116	NC_017482	TTGCT	2	10	217008	217017	0 %	60 %	20 %	20 %	385826922
117	NC_017482	GCTAT	2	10	217035	217044	20 %	40 %	20 %	20 %	385826922
118	NC_017482	GACGG	2	10	217402	217411	20 %	0 %	60 %	20 %	385826923
119	NC_017482	TTATT	2	10	217589	217598	20 %	80 %	0 %	0 %	385826923
120	NC_017482	CAGAT	2	10	219325	219334	40 %	20 %	20 %	20 %	385826925
121	NC_017482	CTTTT	2	10	222645	222654	0 %	80 %	0 %	20 %	385826929
122	NC_017482	TTCGT	2	10	222787	222796	0 %	60 %	20 %	20 %	385826929
123	NC_017482	TCTTT	2	10	226630	226639	0 %	80 %	0 %	20 %	385826932
124	NC_017482	GATGC	2	10	229635	229644	20 %	20 %	40 %	20 %	385826934
125	NC_017482	TCGCT	2	10	229739	229748	0 %	40 %	20 %	40 %	385826934
126	NC_017482	CAAAG	2	10	232523	232532	60 %	0 %	20 %	20 %	385826938
127	NC_017482	TTCAT	2	10	233142	233151	20 %	60 %	0 %	20 %	385826939
128	NC_017482	GTTGC	2	10	240660	240669	0 %	40 %	40 %	20 %	385826952
129	NC_017482	AGAGA	2	10	245952	245961	60 %	0 %	40 %	0 %	385826959
130	NC_017482	CGATT	2	10	246396	246405	20 %	40 %	20 %	20 %	385826960
131	NC_017482	AAAGC	2	10	254393	254402	60 %	0 %	20 %	20 %	385826969
132	NC_017482	TCCGG	2	10	254470	254479	0 %	20 %	40 %	40 %	385826969
133	NC_017482	GGTTT	2	10	255712	255721	0 %	60 %	40 %	0 %	385826970
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