MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 33927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017482	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826721
2	NC_017482	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826721
3	NC_017482	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826721
4	NC_017482	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826721
5	NC_017482	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826721
6	NC_017482	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826721
7	NC_017482	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826721
8	NC_017482	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
9	NC_017482	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
10	NC_017482	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826721
11	NC_017482	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826721
12	NC_017482	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
13	NC_017482	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
14	NC_017482	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826721
15	NC_017482	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826721
16	NC_017482	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826722
17	NC_017482	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826722
18	NC_017482	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
19	NC_017482	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826722
20	NC_017482	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
21	NC_017482	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826722
22	NC_017482	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826722
23	NC_017482	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826722
24	NC_017482	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
25	NC_017482	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826722
26	NC_017482	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826722
27	NC_017482	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826723
28	NC_017482	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826723
29	NC_017482	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826723
30	NC_017482	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826723
31	NC_017482	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826724
32	NC_017482	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826724
33	NC_017482	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826724
34	NC_017482	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826724
35	NC_017482	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826724
36	NC_017482	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826724
37	NC_017482	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826724
38	NC_017482	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826724
39	NC_017482	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826724
40	NC_017482	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826724
41	NC_017482	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826724
42	NC_017482	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826724
43	NC_017482	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826724
44	NC_017482	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
45	NC_017482	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826725
46	NC_017482	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
47	NC_017482	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826725
48	NC_017482	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
49	NC_017482	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
50	NC_017482	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826725
51	NC_017482	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
52	NC_017482	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
53	NC_017482	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
54	NC_017482	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
55	NC_017482	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
56	NC_017482	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
57	NC_017482	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
58	NC_017482	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
59	NC_017482	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
60	NC_017482	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
61	NC_017482	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
62	NC_017482	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826725
63	NC_017482	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826725
64	NC_017482	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
65	NC_017482	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
66	NC_017482	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826725
67	NC_017482	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
68	NC_017482	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826725
69	NC_017482	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
70	NC_017482	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826725
71	NC_017482	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
72	NC_017482	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826725
73	NC_017482	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826725
74	NC_017482	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
75	NC_017482	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
76	NC_017482	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
77	NC_017482	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826725
78	NC_017482	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
79	NC_017482	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
80	NC_017482	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
81	NC_017482	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
82	NC_017482	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826726
83	NC_017482	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826726
84	NC_017482	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
85	NC_017482	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826726
86	NC_017482	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826726
87	NC_017482	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826726
88	NC_017482	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826726
89	NC_017482	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
90	NC_017482	TGG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
91	NC_017482	TGA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
92	NC_017482	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826726
93	NC_017482	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826726
94	NC_017482	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
95	NC_017482	CGG	3	9	7626	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
96	NC_017482	GAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
97	NC_017482	ATT	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
98	NC_017482	ATT	2	6	7938	7943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
99	NC_017482	ATG	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
100	NC_017482	CTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
101	NC_017482	AAG	2	6	8047	8052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
102	NC_017482	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
103	NC_017482	GAT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
104	NC_017482	TCG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
105	NC_017482	ATG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
106	NC_017482	CTT	2	6	8213	8218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826726
107	NC_017482	CAA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826726
108	NC_017482	GCA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
109	NC_017482	ATG	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
110	NC_017482	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
111	NC_017482	CGG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
112	NC_017482	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
113	NC_017482	TGA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
114	NC_017482	CGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
115	NC_017482	CGA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
116	NC_017482	CAG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
117	NC_017482	TGA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
118	NC_017482	ATG	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826727
119	NC_017482	TGG	2	6	9907	9912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
120	NC_017482	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826727
121	NC_017482	TTG	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826727
122	NC_017482	TGG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
123	NC_017482	GGT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
124	NC_017482	TGG	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
125	NC_017482	GAC	2	6	10505	10510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826728
126	NC_017482	TGA	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826728
127	NC_017482	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826728
128	NC_017482	CAA	2	6	10674	10679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826728
129	NC_017482	CTG	3	9	11064	11072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826729
130	NC_017482	ACA	2	6	11198	11203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826729
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254	NC_017482	CTT	2	6	22433	22438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826744
255	NC_017482	ATT	2	6	22519	22524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826744
256	NC_017482	GCG	2	6	22544	22549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826744
257	NC_017482	TGC	2	6	22557	22562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826744
258	NC_017482	GAC	2	6	22647	22652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826744
259	NC_017482	GCG	2	6	22694	22699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826744
260	NC_017482	AAT	2	6	22740	22745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826744
261	NC_017482	TCG	2	6	22777	22782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826744
262	NC_017482	GAT	2	6	22801	22806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826744
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271	NC_017482	ATA	2	6	23817	23822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826746
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283	NC_017482	GCT	2	6	24783	24788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826747
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286	NC_017482	TCA	2	6	24834	24839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826747
287	NC_017482	AAC	2	6	25166	25171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826747
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372	NC_017482	GGT	2	6	32318	32323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826753
373	NC_017482	GGC	2	6	32336	32341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826753
374	NC_017482	CCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826753
375	NC_017482	GCG	2	6	32667	32672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826753
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499	NC_017482	GAA	2	6	42854	42859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826764
500	NC_017482	TCA	2	6	42873	42878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826764

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