MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	AGCT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017480	TTGC	2	8	528	535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017480	CGTT	2	8	945	952	0 %	50 %	25 %	25 %	385839805
4	NC_017480	TTAA	2	8	1170	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	385839805
5	NC_017480	ATTA	2	8	1325	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	385839805
6	NC_017480	CTTT	2	8	1400	1407	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
7	NC_017480	CAAC	2	8	1579	1586	50 %	0 %	0 %	50 %	385839805
8	NC_017480	TTGC	2	8	1628	1635	0 %	50 %	25 %	25 %	385839805
9	NC_017480	TGCG	2	8	1721	1728	0 %	25 %	50 %	25 %	385839805
10	NC_017480	TTCT	2	8	1799	1806	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
11	NC_017480	GATT	2	8	1853	1860	25 %	50 %	25 %	0 %	385839805
12	NC_017480	TCTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
13	NC_017480	TAAA	2	8	1931	1938	75 %	25 %	0 %	0 %	385839805
14	NC_017480	ATTC	2	8	2175	2182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017480	ATTA	2	8	2315	2322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017480	AGCA	2	8	2610	2617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017480	TCAT	2	8	2882	2889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017480	TGTT	2	8	3325	3332	0 %	75 %	25 %	0 %	385839806
19	NC_017480	GTTT	2	8	3681	3688	0 %	75 %	25 %	0 %	385839806
20	NC_017480	CCTT	2	8	3746	3753	0 %	50 %	0 %	50 %	385839806
21	NC_017480	GTTC	2	8	4872	4879	0 %	50 %	25 %	25 %	385839807
22	NC_017480	TTCT	2	8	4939	4946	0 %	75 %	0 %	25 %	385839807
23	NC_017480	ATTA	2	8	5734	5741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017480	AAAT	2	8	5745	5752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017480	TCTT	2	8	5956	5963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017480	TAAT	2	8	6496	6503	50 %	50 %	0 %	0 %	385839808
27	NC_017480	AAAT	2	8	6884	6891	75 %	25 %	0 %	0 %	385839808
28	NC_017480	ATCA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	0 %	25 %	385839809
29	NC_017480	ACTC	2	8	7462	7469	25 %	25 %	0 %	50 %	385839809
30	NC_017480	GAGT	2	8	7792	7799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017480	AAAT	2	8	7952	7959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017480	TTGA	2	8	8100	8107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017480	TGCT	2	8	8461	8468	0 %	50 %	25 %	25 %	385839810
34	NC_017480	TTGA	2	8	9161	9168	25 %	50 %	25 %	0 %	385839811
35	NC_017480	GAAT	2	8	9813	9820	50 %	25 %	25 %	0 %	385839812
36	NC_017480	GATT	2	8	9868	9875	25 %	50 %	25 %	0 %	385839812
37	NC_017480	CTAA	2	8	10351	10358	50 %	25 %	0 %	25 %	385839812
38	NC_017480	AGCA	2	8	10361	10368	50 %	0 %	25 %	25 %	385839812
39	NC_017480	AATC	2	8	10555	10562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017480	GGTT	2	8	10634	10641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017480	CAAA	2	8	10675	10682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017480	TTGG	3	12	10893	10904	0 %	50 %	50 %	0 %	385839813
43	NC_017480	GAAG	2	8	11997	12004	50 %	0 %	50 %	0 %	385839814
44	NC_017480	ACGA	2	8	12787	12794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017480	ATAA	2	8	12920	12927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017480	ACAT	2	8	13913	13920	50 %	25 %	0 %	25 %	385839815
47	NC_017480	ATTT	2	8	13967	13974	25 %	75 %	0 %	0 %	385839815
48	NC_017480	AATA	2	8	14302	14309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017480	CATT	2	8	14400	14407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017480	AATT	2	8	14966	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	385839816
51	NC_017480	ATCA	2	8	15137	15144	50 %	25 %	0 %	25 %	385839816
52	NC_017480	GTTG	2	8	15330	15337	0 %	50 %	50 %	0 %	385839816
53	NC_017480	TTCC	2	8	15351	15358	0 %	50 %	0 %	50 %	385839816
54	NC_017480	CTTA	2	8	16179	16186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017480	GAAA	2	8	16662	16669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017480	ATGG	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017480	TCAT	2	8	17666	17673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017480	TCAC	2	8	17836	17843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017480	AACA	2	8	18078	18085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017480	ACTA	2	8	18492	18499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017480	CAAT	2	8	18966	18973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017480	GAAC	2	8	19053	19060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017480	TTTA	2	8	19391	19398	25 %	75 %	0 %	0 %	385839817
64	NC_017480	ATGG	2	8	19517	19524	25 %	25 %	50 %	0 %	385839817
65	NC_017480	TGTT	2	8	19570	19577	0 %	75 %	25 %	0 %	385839817
66	NC_017480	ATTT	2	8	19723	19730	25 %	75 %	0 %	0 %	385839817

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.