MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	CGTT	2	8	945	952	0 %	50 %	25 %	25 %	385839805
2	NC_017480	TTAA	2	8	1170	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	385839805
3	NC_017480	ATTA	2	8	1325	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	385839805
4	NC_017480	CTTT	2	8	1400	1407	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
5	NC_017480	CAAC	2	8	1579	1586	50 %	0 %	0 %	50 %	385839805
6	NC_017480	TTGC	2	8	1628	1635	0 %	50 %	25 %	25 %	385839805
7	NC_017480	TGCG	2	8	1721	1728	0 %	25 %	50 %	25 %	385839805
8	NC_017480	TTCT	2	8	1799	1806	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
9	NC_017480	GATT	2	8	1853	1860	25 %	50 %	25 %	0 %	385839805
10	NC_017480	TCTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	385839805
11	NC_017480	TAAA	2	8	1931	1938	75 %	25 %	0 %	0 %	385839805
12	NC_017480	TGTT	2	8	3325	3332	0 %	75 %	25 %	0 %	385839806
13	NC_017480	GTTT	2	8	3681	3688	0 %	75 %	25 %	0 %	385839806
14	NC_017480	CCTT	2	8	3746	3753	0 %	50 %	0 %	50 %	385839806
15	NC_017480	GTTC	2	8	4872	4879	0 %	50 %	25 %	25 %	385839807
16	NC_017480	TTCT	2	8	4939	4946	0 %	75 %	0 %	25 %	385839807
17	NC_017480	TAAT	2	8	6496	6503	50 %	50 %	0 %	0 %	385839808
18	NC_017480	AAAT	2	8	6884	6891	75 %	25 %	0 %	0 %	385839808
19	NC_017480	ATCA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	0 %	25 %	385839809
20	NC_017480	ACTC	2	8	7462	7469	25 %	25 %	0 %	50 %	385839809
21	NC_017480	TGCT	2	8	8461	8468	0 %	50 %	25 %	25 %	385839810
22	NC_017480	TTGA	2	8	9161	9168	25 %	50 %	25 %	0 %	385839811
23	NC_017480	GAAT	2	8	9813	9820	50 %	25 %	25 %	0 %	385839812
24	NC_017480	GATT	2	8	9868	9875	25 %	50 %	25 %	0 %	385839812
25	NC_017480	CTAA	2	8	10351	10358	50 %	25 %	0 %	25 %	385839812
26	NC_017480	AGCA	2	8	10361	10368	50 %	0 %	25 %	25 %	385839812
27	NC_017480	TTGG	3	12	10893	10904	0 %	50 %	50 %	0 %	385839813
28	NC_017480	GAAG	2	8	11997	12004	50 %	0 %	50 %	0 %	385839814
29	NC_017480	ACAT	2	8	13913	13920	50 %	25 %	0 %	25 %	385839815
30	NC_017480	ATTT	2	8	13967	13974	25 %	75 %	0 %	0 %	385839815
31	NC_017480	AATT	2	8	14966	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	385839816
32	NC_017480	ATCA	2	8	15137	15144	50 %	25 %	0 %	25 %	385839816
33	NC_017480	GTTG	2	8	15330	15337	0 %	50 %	50 %	0 %	385839816
34	NC_017480	TTCC	2	8	15351	15358	0 %	50 %	0 %	50 %	385839816
35	NC_017480	TTTA	2	8	19391	19398	25 %	75 %	0 %	0 %	385839817
36	NC_017480	ATGG	2	8	19517	19524	25 %	25 %	50 %	0 %	385839817
37	NC_017480	TGTT	2	8	19570	19577	0 %	75 %	25 %	0 %	385839817
38	NC_017480	ATTT	2	8	19723	19730	25 %	75 %	0 %	0 %	385839817

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.